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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation for the regulation of motility and lifespan by proteostasis(Fostering Joint International Research)

Research Project

Project/Area Number 16KK0156
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

北村 朗  北海道大学, 先端生命科学研究院, 講師 (10580152)

Project Period (FY) 2017 – 2019
Keywordsタンパク質凝集体 / タンパク質恒常性 / ALS / TDP-43 / 線虫
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質凝集体による恒常性異常を調べるために,ALS関連タンパク質であるTDP-43のカルボキシル末端断片 (TDP43CTF)を発現する線虫株を複数樹立した.この運動性解析と寿命解析を行い,TDP43CTFはタンパク質恒常性に負の影響を与えることがわかった.またマウス神経芽細胞種Neuro2Aを用いて,TDP43CTFの細胞質封入体形成能と細胞死の増加を調べたところ,細胞死は凝集形成能と強く相関した.このことは,ALSにおけるTDP43CTFによる神経細胞死の機構として重要な知見である.また,線虫個体内におけるヒト配列TDP43CTFの封入体形成能は,Neuro2A内におけるそれとは一部異なっていた.このことから,TDP43CTFの封入体形成には,タンパク質そのものの性質は当然ながら,加えて内在性の他タンパク質が関与することが考えられた.本成果は現在,論文投稿準備中である.
このようなタンパク質凝集体,中でもALSに関与するものとしてRNA結合タンパク質の凝集が着目されている.本研究課題において,ALS関連RNA結合タンパク質の凝集性に関与するRNAの細胞内構造について着目した.このRNAの二次構造をCDで確認し,そのような構造が生きた細胞内でどのように維持されているかを調べるために,Transient state (TRAST) monitoring分光法を採用し,溶液内に加えて生細胞内での測定も行った.具体的には,グアニン四重鎖の立体構造を形成するRNAを利用し,このフォールド変化をTRAST分光法を用いて識別できる系を確立することができた.本成果は第一版を投稿済であり,査読後,改訂作業中である.

  • Research Products

    (11 results)

All 2020 2019 2018 2017

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] ノースウェスタン大学(米国)2018

    • Year and Date
      2018-08-24 – 2018-11-07
    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ノースウェスタン大学
    • Co-investigator Overseas
      Richard Morimoto
    • Department
      Rice Institute
    • Job Title
      Professor
  • [Int'l Joint Research] スウェーデン王立工科大学(スウェーデン)2017

    • Year and Date
      2017-10-02 – 2017-12-28 | 2018-05-152018-06-06 | 2020-02-142020-03-05
    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      スウェーデン王立工科大学
    • Co-investigator Overseas
      Jerker Widengran
    • Department
      Department of Applied Physics
    • Job Title
      Professor
  • [Journal Article] Session 2SHP report-decoding intracellular architecture using visualizing device development and mathematical modeling2020

    • Author(s)
      Kitamura Akira, Kabayama Kazuya
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00641-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of Intracellular Crowding Environments with Topology-Based DNA Quadruplex Sensors2019

    • Author(s)
      Takahashi Shuntaro、Yamamoto Johtaro、Kitamura Akira、Kinjo Masataka、Sugimoto Naoki
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 91 Pages: 2586~2590

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.8b04177

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Reading out G-quadruplex RNA structure using transient state (TRAST) of photochemical reaction of fluorophores2019

    • Author(s)
      北村朗
    • Organizer
      第57回 日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Aggregation process of carboxyl terminal fragments of TDP-432019

    • Author(s)
      Akira Kitamura, Kanami Moriya, Kazuho Takahashi, Rei Kawashima, Renee Brielman, Richard I. Morimoto, Masataka Kinjo
    • Organizer
      Asian Pacific Prion Symposium 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 蛍光ゆらぎを利用した光化学反応速度定数の算出とRNA構造変化の解析2019

    • Author(s)
      北村朗, Johan Tormmalm,Jerker Widengren, 金城 政孝
    • Organizer
      第10回・光塾
  • [Presentation] Aggregation process of carboxyl terminal fragments of TDP-432019

    • Author(s)
      Akira Kitamura, Kanami Moriya, Kazuho Takahashi, Rei Kawashima, Renee Brielman, Richard I. Morimoto, Masataka Kinjo
    • Organizer
      QBP/OCS seminar
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Elucidation for stress granule function using chromophore-assisted light inactivation (CALI)2019

    • Author(s)
      Akira Kitamura, Haruka Kawaguchi, Tsumugi Kurosaki, Masataka Kinjo
    • Organizer
      第42回 日本分子生物学会年会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 蛍光相関分光法とその応用法を用いたALS関連細胞内凝集体形成機構の解析2019

    • Author(s)
      北村朗
    • Organizer
      サントリー生命科学財団 生物有機科学研究所 生有研シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Transient state (TRAST) monitoringを用いた生細胞内RNAフォールドの解析2019

    • Author(s)
      北村朗
    • Organizer
      定量生物の会 北海道キャラバン2019
    • Invited

URL: 

Published: 2021-01-27  

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