2017 Fiscal Year Research-status Report
HTLV-1プロウイルスのエピジェネティクス解析を用いた国際間比較研究（国際共同研究強化）
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16KK0206
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
勝屋 弘雄 熊本大学, エイズ学研究センター, 特任助教 (80632041)
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| Project Period (FY) |
2016 – 2018
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| Keywords | HTLV-1 / 成人T細胞白血病-リンパ腫 / HTLV-1関連脊髄症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ヒトT細胞白血病ウイルス1型（HTLV-1）に感染している一部のキャリアにおいて、HTLV-1関連脊髄症(HAM)を代表とする慢性進行性炎症性疾患や、造血器腫瘍である成人T細胞白血病・リンパ腫（ATL)が発症する。HAMの発症メカニズムとしては、HTLV-1感染T細胞が脊髄に浸潤し、ウイルス抗原であるTaxを標的としたウイルス特異的免疫応答が生じることで、その炎症反応により脊髄障害がおこる。一方でATLに関しては、Taxの発現が認められる症例は約20%であり、ウイルス抗原の発現抑制による免疫逃避機構が発症の要因の一つと考えられている。そこで、HTLV-1プロウイルス発現制御機構を解明するために研究を行っている。
方法は、HTLV-1感染クローンと患者からのPBMC検体を用いて、プローブによるエンリッチメント法を併用したクロマチン免疫沈降シークエンス（ChIP-seq）とRNA-seqを行っている。
ChIP-seqによるヒストン修飾マークは、キャリアにおいて転写活性のマーク（H3K9me3, H3K79me2）がHTLV-1全体で観察され、一方ATLでは3’LTR側でのみ観察された。これから、ATLでは5’LTRからのセンスの転写は抑制され、3’LTRからのアンチセンスの転写が起こっていることが考えられた。このヒストン修飾パターンから、HTLV-1プロウイルスの転写は病型毎に異なることが考えられた。そこで、mRNAの発現を調べるためmRNAシークエンスを行っている。現在までキャリア 6例、HAM 4例、ATL 32例のPBMCを用いてmRNA-seqを行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
他施設に協力を依頼し患者検体の収集を行っているため、おおむね順調に研究を遂行できている。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在まで行ったキャリア 6例、HAM 4例、ATL 32例のmRNA-seqの解析を行う。また、同じ病型においても症例毎で大きく異なることが分かったため、HTLV-1プロウイルスの状態を確認する必要があると考えた。そこで今後はプローブによるエンリッチメント法併用DNAシークエンスを実施し、プロウイルスのシークエンスを確認する。
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[Presentation] Highly sensitive viral RNA-seq is a powerful tool to analyze the viral transcripts in HTLV-1-infected individuals2017
Author(s)
Yuki Inada, Hiroo Katsuya, Paola Miyazato, Benjy Tan Jek Yang, Saori Iwase, Misaki Kakoki, Misaki Matsuo, Islam Mohammad Saiful, Masahito Tokunaga, Hiroyuki Hata, Yoshihisa Yamano, Atae Utsunomiya, Yorifumi Satou
Organizer
The 59th American Society of Hematology
Int'l Joint Research
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[Presentation] Possible involvement of YB-1 in abnormal nuclear shape of adult T-cell leukemia-Iymphoma cells2017
Author(s)
Misaki Kakoki, Hiroo Katsuya, Takafumi Noguchi, Yuki Inada, Paola Miyazato, Misaki Matsuo, Benjy Tan Jek Yang, Islam Mohammad Saiful, Hiroyuki Hata, Tokio Tani, Yorifumi Satou
Organizer
第4回日本HTLV-1学会学術集会
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[Presentation] Possible involvement of YB-1 in abnormal nuclear shape of adult T-cell leukemia-Iymphoma cells2017
Author(s)
Misaki Kakoki, Hiroo Katsuya, Takafumi Noguchi, Yuki Inada, Paola Miyazato, Misaki Matsuo, Masahito Tokunaga, Atae Utsunomiya, Hiroyuki Hata, Tokio Tani, Yorifumi Satou
Organizer
第７９回日本血液学会学術集会
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