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2008 Fiscal Year Annual Research Report

DNA修復機構の、逆遺伝学的手法(ニワトリ細胞株とメダカ)による機能解析

Research Project

Project/Area Number 17013039
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

武田 俊一  Kyoto University, 医学研究科, 教授 (60188191)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 谷口 善仁  京都大学, 医学研究科, 准教授 (00324616)
KeywordsDNA組み換え / DNA修復 / 変異 / ゲノム不安定性 / シスプラチン / DT40 / メダカ
Research Abstract

#発がん抑制遺伝子、NBS1の機能解析(Nakahara et al., PLoS Gene. 2009)
相同組み換えは、DNA修復反応であり、必ず、DNA損傷から開始される。相同組み換えを開始させるDNA損傷については、1重鎖ギャップと2重鎖切断とが想定されていた。そして、2重鎖切断が相同親み換えを開始することは、証明されていたが、1重鎖ギャップが相同組み換えを開始できるか否かは謎であった。我々は、ニワトリ抗体遺伝子の相同組み換えによる多様化は、1重鎖ギャップによって開始されることを証明した。そしてNBS1は、1重鎖ギャップの幅を拡げることによって、相同組み換えを促進することを示した。抗がん剤、シスプラチンが複製をブロックしたときに、2重鎖切断のみならず、1重鎖ギャップが大量に形成される。NBS1は、このギャップを修復するのに重要であることが示唆された。
#CEP63の機能解析(Smith E., et al., Nature Cell Biol. 2009)
放射線治療によって2重鎖切断が生じると、ATMなどのキナーゼが活性化され、最終的に細胞死などが誘導される。イギリスのグループが、ATMの基質の1つとしてCEP63を単離した。我々は、彼等との共同研究として、CEP63の機能解析を実施し、CEP63が放射線照射によって生じるM期カタストロフィーの防止に重要な役割を持つことを解明した。発表論文では、我々の教室のタイ人院生が第2著者になった。
#メダカの遺伝子破壊の効率化
1遺伝子破壊に100万円の費用がかかる。基生研と共同して、次世代シークエンサーを用い、遺伝子破壊の費用を低下させる為の努力を行なっている。

  • Research Products

    (20 results)

All 2009 2008

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Cohesin associates with spindle poles in a mitosis-specificmanner and functions in spindle assembly in vertebrate cells2009

    • Author(s)
      Kong X, Ball AR, Jr., Sonoda E, Fang J, Takeda S, Fukagawa T, Yen TJ, Yokoniori K
    • Journal Title

      Mol Cell Biol 20

      Pages: 1289-1301

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Vital Link between the Ubiquitin-Proteasome Pathway and DNA Repair : Impact on Cancer Therapy2009

    • Author(s)
      Motegi A, Murakawa Y, Takeda S
    • Journal Title

      Cancer Lett (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic evidence for single-strand lesions initiating Nbs1-dependent homologousrecombination in diversification of Ig V in chicken B lymphocytes2009

    • Author(s)
      Nakahara M, Sonoda E, Nojima K, Sale JE, Takenaka K, Kikuchi K, Taniguchi Y, Nakamura K, Sumitomo Y, Bree RT, Lowndes NF, Takeda S
    • Journal Title

      PLoS Genet 5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An ATM and ATR dependent checkpoint inactivates spindle assembly by targeting CEP632009

    • Author(s)
      Smith E, Dejsuphong D, Balestrini A, Hampel M, Lenz C, Vindigni A, Takeda S, Costanzo V
    • Journal Title

      Nat Cell Biol 11

      Pages: 278-285

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic Evidence That the Non-homologous End-joining Repair Pathway Is Involved in LINE Retrotransposition2009

    • Author(s)
      Suzuki J, Yamaguchi K, Kajikawa M, Ichiyanagi K, Adachi N, Koyama H, Takeda S, Okada N
    • Journal Title

      PLoS Genet

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ku70 prevents genome instability resulting from heterozygosity of the telomerase RNA component in a vertebrate tumour line2008

    • Author(s)
      Faure V, Wenner T, Cooley C, Bourke E, Farr CJ, Takeda S, Morrison CG
    • Journal Title

      DNA Repair (Mist) 7

      Pages: 713-724

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA damage response protein ASCIZ links base excision repair with immunoglobulin gene conversion2008

    • Author(s)
      Oka H. Sakai if, Sonoda E, Nakamura J, Asagoshi K, Wilson Si, Kobayashi N, Yamamoto K. Heierhorst J, Takeda S. Taniguchi Y
    • Journal Title

      Biochem Biophys Rei Commun 371

      Pages: 225-229

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single stranded DNA binding protein hSSB1 is critical for genomic stability2008

    • Author(s)
      Richard K, Boidersan E. Cubeddu L, Wadsonrth RIM, Savage K. Sharma CG, Nicolette ML, Tsvetanov S. MIlwraith MJ. Pandita R, Takeda S. Hay TT. Gautier J. West SC. Paull TT. Pandital TR. White MF. Khanna KK
    • Journal Title

      Nature 453

      Pages: 677-681

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The 9-1-1 DNA clamp is required for immunoglobulin gene conversion2008

    • Author(s)
      Saberi A, Nakahara M, Sale JE, Kikuchi K, Arakawa H, Buerstedde J-M, Takeda S, Sonoda E
    • Journal Title

      Mol Cell Biol 28

      Pages: 6113-6122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KU70/80, DNA-PKcs, and Artemis are essential for the rapid induction of apoptosis after massive DSB formation2008

    • Author(s)
      Abe T, Ishiai H. Hosono Y, Yoshimura A, Tada S, Adachi N. Koyama H. Takata N, Takeda S. Enomoto T. Seki M
    • Journal Title

      Cell Signal 20

      Pages: 1978-1985

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] PARP-1 ensures the modulation of replication fork progression by homologous recombination on damaged DNA2008

    • Author(s)
      Sugimura K, Takebayashi S, Taguchi H, Takeda S, Okumura K
    • Journal Title

      J Cell Biol 183

      Pages: 1203-1212

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cyclin-dependent kinases and cell-cycle transitions : does onefit all?2008

    • Author(s)
      Hochegger H, Takeda S, Hunt T
    • Journal Title

      Nat Rev Mol Cell Biol (Review) 9

      Pages: 910-916

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Analysis of Genome Maintenance Using Chemical Genetics2009

    • Author(s)
      武田俊一
    • Organizer
      金沢がん生物学国際シンポジウム2009
    • Place of Presentation
      金沢(石川)
    • Year and Date
      2009-02-19
  • [Presentation] A Critical Role, for the Ubiquitin-Conjugating Enzymes-Ubc13 and RNF8 in Homologous Recombination2009

    • Author(s)
      Takeda S
    • Organizer
      Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Ventura(アメリカ)
    • Year and Date
      2009-02-10
  • [Presentation] ニワトリBリンパ細胞を使ったDNA損傷応答機構の遺伝学的解析2008

    • Author(s)
      武田俊一
    • Organizer
      放射線防護センターシンポジウム
    • Place of Presentation
      稲毛(千葉)
    • Year and Date
      2008-12-16
  • [Presentation] A critical role for the ubiquitin-conjugating enzymes Ubc13 and RNF8 in homologous recombination2008

    • Author(s)
      武田俊一
    • Organizer
      3R Symposium 2008
    • Place of Presentation
      つま恋(静岡)
    • Year and Date
      2008-10-30
  • [Presentation] A critical role for the ubiquitin-conjugating eniymes Ubc13 and RNF8 in homologous recombination2008

    • Author(s)
      Takeda S
    • Organizer
      Genome Stability in Health and Disease
    • Place of Presentation
      Tel Aviv(イスラエル)
    • Year and Date
      2008-09-23
  • [Presentation] Collabofation of BRCA1 and CtIP in cellular tolerance totopoisomerase poisons2008

    • Author(s)
      rakeda S
    • Organizer
      Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Oxford(イギリス)
    • Year and Date
      2008-07-22
  • [Presentation] The role of anti-recombination in replication-fork collapse2008

    • Author(s)
      tkeda S
    • Organizer
      Molecular and Clinical Mechanisms in Bloom's Syndome and Related Diosorders
    • Place of Presentation
      Chicago(アメリカ)
    • Year and Date
      2008-05-28
  • [Presentation] Multiple functions of Mie11/Rad50/Nbs1 complex2008

    • Author(s)
      Takeda S
    • Organizer
      2008 EMBO Recombination Mechamisms
    • Place of Presentation
      I1 Ciocco (イタリア)
    • Year and Date
      2008-05-20

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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