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2006 Fiscal Year Annual Research Report

がんの統合的ゲノム解析と個性診断法の開発

Research Project

Project/Area Number 17015012
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

稲澤 譲治  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 逸勢  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教授 (30258610)
Keywordsがん / ゲノム / 個性診断 / 分子標的治療 / CGHアレイ / DNAメチル化 / ChIP法 / BAMCA法
Research Abstract

胃癌細胞株で9p24.2ホモ欠失を見出し標的癌抑制遺伝子候補がVLDLRであることを明らかにした。
VLDLRプロモーターはメチル化により高頻度に不活化されていた。臨床検体においても高頻度にメチル化を検出し、またVLDLR type Iを胃癌細胞株に強制発現すると増殖抑制効果を示したことから、本遺伝子は胃癌抑制遺伝子候補と考えられた。(Takada et al., Oncogene 2006)BACアレイを用いてDNAメチル化領域をゲノムワイドに探索する手法であるBAMCA法を開発し、食道扁平上皮癌細胞株のDNAメチル化領域を探索し、異常DNAメチル化の標的遺伝子候補としてCRABP1を同定した。(Tanaka et al., Oncogene 2007)口腔癌では細胞株、臨床検体において高頻度にメチル化で不活化される癌抑制遺伝子候補LRPIBを見出した。(Nakagawa et al., Cancer Sci.2006)肺非小細胞癌(NSLC)細胞株の1例で新規13q21.2ホモ欠失を検出し、Protocadherin 20(PCDH20)が標的遺伝子であることを明らかにした。PCDH20のmRNAレベルでの発現は細胞株の52.6%(10/19)で消失し、これがPCDH20遺伝子プロモーターのメチル化に起因することを明らかにした。さらにNSCLC臨床検体59例の解析で、その54.2%(32/59)にメチル化を検出し、PCDH20メチル化陽性例は有意に予後不良であり、多変量解析の結果、他の臨床病理学的諸因子とは独立のバイオマーカーであることを示した。(Imoto et al., Cancer Res 2006)本研究成果は日経新聞朝刊(2006年10月16日)の科学覧において紹介された。甲状腺未分化癌において8p12新規遺伝子増幅を見出し標的癌遺伝子候補のDUSP26を同定した。DUSP26は機能ドメイン構造予測よりdual specificity phosphatase domainを有する脱リン酸化酵素であると考えられる。(Yu et al., Oncogene 2007)

  • Research Products

    (32 results)

All 2007 2006

All Journal Article (16 results) Book (8 results) Patent(Industrial Property Rights) (8 results)

  • [Journal Article] Fortuitous Detection of a Submicroscopic Deletion at 1q25 in a Girl With Cornelia-de Lange Syndrome Carrying t(5;13)(p13.1;q12.1) by Array-based Comparative Genomic Hybridization.2007

    • Author(s)
      Hayashi S, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Am J Med Genet. (in press)

  • [Journal Article] Construction of a High-density and High-resolution Human Chromosome X Array for Comparative Genomic Hybridization Analysis.2007

    • Author(s)
      Hayashi S, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      J Hum Genet (in press)

  • [Journal Article] Dup(8p)/del(8q) Recombinant Chromosome in a Girl With Hepatic Focal Nodular Hyperplasia.2007

    • Author(s)
      Tokutomi T, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Am J Med Genet. (in press)

  • [Journal Article] Clinical and molecular cytogenetic characterization od two patients with non-mutational aberrations of the FMR2 gene.2007

    • Author(s)
      Honda S, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Oncogene (in press)

  • [Journal Article] RGC32, a novel p53-inducible gene, is located on centrosomes during mitosis and results in G2/M arrest.2007

    • Author(s)
      Saigusa K, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 26・8

      Pages: 1110-1121

  • [Journal Article] A novel amplification target, DUSP26, promotes anaplastic thyroid cancer cell growth by inhibiting p38 MAPK activity.2007

    • Author(s)
      Yu W, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 26・8

      Pages: 1178-1187

  • [Journal Article] Genome-wide array-based comparative genomic hybridization analysis of pancreatic adenocarcinoma : identification of genetic indicators that predict patient outcome.2007

    • Author(s)
      Loukopoulos P, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci. (in press)

  • [Journal Article] Reduced Levels of ATF-2 Predispose Mice to Mammary Tumors.2007

    • Author(s)
      Maekawa T, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Mol Cell Biol. (in press)

  • [Journal Article] PIK3CA mutation is an oncogenic aberration at advanced stages of oral squamous cell carcinoma. Cancer Sci.2006

    • Author(s)
      Kozaki K, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci. 97・12

      Pages: 1351-1358

  • [Journal Article] Genomic loss and epigenetic silencing of very low density lipoprotein receptor involved in gastric carcinogenesis.2006

    • Author(s)
      Takada H, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 25・49

      Pages: 6554-6562

  • [Journal Article] Genetic or epigenetic silencing of low density lipoprotein receptor-relate protein 1B expression in oral squamous cell carcinoma.2006

    • Author(s)
      Nakagawa T, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci. 97・10

      Pages: 1070-1074

  • [Journal Article] Frequent silencing of the candidate tumor suppressor PCDH20 by epigenetic mechanism in non-small-cell lung cancers. Cancer Res.2006

    • Author(s)
      Imoto I, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Cancer Res. 66・10

      Pages: 4617-4626

  • [Journal Article] Mutation analyses of genes on 6p12-p11 in patients with juvenile myoclonic epilepsy.2006

    • Author(s)
      Suzuki T, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Neurosci Lett. 405・1-2

      Pages: 126-131

  • [Journal Article] The selective continued linkage of centromeres from mitosis to interphase in the absence of mammalian separase.2006

    • Author(s)
      Kumada K, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      J Cell Biol. 172・6

      Pages: 835-846

  • [Journal Article] Clinical heterogeneity of alpha-synuclein gene duplication in Parkinson's disease.2006

    • Author(s)
      Nishioka K, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      Ann Neurol. 59・2

      Pages: 298-309

  • [Journal Article] Early G2/M checkpoint failure as a molecular mechanism underlying etoposide-induced chromosomal aberrations.2006

    • Author(s)
      Nakada S, Inazawa J, et al.
    • Journal Title

      J Clin Invest. 116・8

      Pages: 80-89

  • [Book] 三輪血液病学第3版2006

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      2069
    • Publisher
      株式会社文光堂
  • [Book] 別冊医学のあゆみ 消化器疾患2006

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      750
    • Publisher
      医歯薬出版株式会社
  • [Book] 新臨床腫瘍学2006

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      809
    • Publisher
      株式会社南江堂
  • [Book] ゲノム医学2006

    • Author(s)
      小崎健一, 稲澤譲治
    • Total Pages
      113
    • Publisher
      メディカルレビュー社
  • [Book] 蛋白質 核酸 酵素2006

    • Author(s)
      井上純, 稲澤譲治
    • Total Pages
      384
    • Publisher
      共立出版
  • [Book] がん分子標的治療2006

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      79
    • Publisher
      メディカルレビュー社
  • [Book] Cancer Frontier2006

    • Author(s)
      三枝邦康, 稲澤譲治
    • Total Pages
      224
    • Publisher
      医薬ジャーナル社
  • [Book] Surgery Frontier2006

    • Author(s)
      中川貴之, 稲澤譲治
    • Total Pages
      118
    • Publisher
      メギノカルレビコー社
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌抑制剤2006

    • Inventor(s)
      井本逸勢, 稲澤譲治, 和泉宏幸, 横井左奈
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-078786
    • Filing Date
      2006-03-22
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌の検出方法および抑制方法2006

    • Inventor(s)
      ウエイ ユウ, 稲澤譲治, 井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-078787
    • Filing Date
      2006-03-22
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌関連欠矢遺伝子マーカーを用いた癌の診断方法2006

    • Inventor(s)
      稲澤譲治, 井本逸勢, 和泉宏幸, 横井左奈
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-109312
    • Filing Date
      2006-04-12
  • [Patent(Industrial Property Rights)] VLDLR遺伝子の検出による胃癌の検出方法2006

    • Inventor(s)
      高田久, 井本逸勢, 稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-118030
    • Filing Date
      2006-04-21
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌抑制剤2006

    • Inventor(s)
      稲澤譲治, 井本逸勢, 三枝邦康
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-204601
    • Filing Date
      2006-07-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 多発性骨髄腫の検出方法および制御方法2006

    • Inventor(s)
      サオ チェン, 井本逸勢, 稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-255155
    • Filing Date
      2006-09-21
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 食道癌の検出方法2006

    • Inventor(s)
      稲澤譲治, 井本逸勢, 田中浩司, 津田均
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-303331
    • Filing Date
      2006-11-08
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌の診断マーカーならびに治療の標的分子OSLC12006

    • Inventor(s)
      稲澤譲治, 井本逸勢, 横井左奈, 津田均
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2006-342462
    • Filing Date
      2006-12-20

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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