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2008 Fiscal Year Annual Research Report

がんの統合的ゲノム解析と個性診断法の開発

Research Project

Project/Area Number 17015012
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

稲澤 譲治  Tokyo Medical and Dental University, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 逸勢  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (30258610)
小崎 健一  東京医科歯科大学, 硬組織疾患ゲノムセンター, 特任准教授 (50270715)
Keywordsがん / ゲノム / 個性診断 / 分子標的治療 / アレイCGH / DNAメチル化 / マイクロRNA / BAMCA法
Research Abstract

ゲノム構造変化、エピゲノム遺伝子制御、体系的遺伝子発現解析など統合的ゲノム解析研究を通して、癌の原因遺伝子探索と病態解明、さらに画期的な診断バイオマーカーや治療の標的分子の同定を目指した。口腔扁平上皮癌細胞(OSCC)株において4q25ホモ欠失を高頻度に見出し、標的遺伝子MTNRlAを明らかにした(Nakamura et al., Cancer Sci 2008)。さらに、OSCC特異的DNA過剰メチル化によって発現抑制を受ける癌抑制性マイクロRNAとしてmiR-137とmiR-193aを同定した(Kozaki et al., Cancer Res 2008)。アレイCGHにより卵巣癌細胞株に新規ホモ欠失(9q33.3)を見出し、標的遺伝子としてAngiopoietin-like protein 2(ANGPTL2)遺伝子を同定した。ANGPTL2は過剰DNAメチル化により発現抑制を受ける早期卵巣癌の癌抑制遺伝子候補である(Kikuchi et al.,Cancer Res 2008)。全癌の中でも極めて悪性の甲状腺未分化癌に20q11.22増幅を見出し、その標的癌関連遺伝子としてユビキチンE3リガーゼITCHを同定した(Ishihara et al., Cancer Sci 2008)。さらに、多発性骨髄腫の11q23.1増幅領域から標的遺伝子候補POU2AF1を同定した(Zhao et al., Oncogene 2008)。また、CGH databaseに各種癌のアレイCGH解析データを格納し、これを新たに公開した。「CGH database Japan」として米国NCBIのゲノムデータベースからもリンクが張られ、27300件以上のアクセス(2009/03/11)があり国際的に利用されている

  • Research Products

    (62 results)

All 2008 Other

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 15 results) Presentation (35 results) Book (2 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (9 results) (of which Overseas: 3 results)

  • [Journal Article] SKI and MEL1 cooperate to inhibit transforming growth factor-beta signal in gastric cancer cells2008

    • Author(s)
      Takahata M, Inazawa J, et.al
    • Journal Title

      J Riol Chem (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profiles in both precancerous conditions and clear cell renal cell carcinomas are correlated with malignant potential and patient outcome2008

    • Author(s)
      Arai E, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Carcinoqenesis (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ITCH is a putative target for a ribvel 20q11.22 amplification detected in anaplastic thyroid carcinoma cells by array-based comparative genomic hybridization2008

    • Author(s)
      Ishihara T, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Sci 99

      Pages: 1940-1949

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic clustering of clear cell renal cell carcinoma based on array-comparative genomic hybridization : its association with DNA methylation alteration and patient outcome2008

    • Author(s)
      Arai E, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Clin Cancer Res 14

      Pages: 5531-5539

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression and gene amplification of actinin-4 in invasive ductal carcinoma of the pancreas2008

    • Author(s)
      Kikuchi S, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Clin Cancer Res 14

      Pages: 5348-5356

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Caffeine yields aneuploidy through asymmetrical cell division caused by misalignment of chromosomes2008

    • Author(s)
      Katsuki Y, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Sci 99

      Pages: 1539-1545

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activation of B-Mvb by E2F1 in hepatocellular carcinoma2008

    • Author(s)
      Nakajima T, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Hepatol Res 38

      Pages: 886-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of cIAP-I correlates with nodal metastasis in squamous cell carcinoma of the tongue.2008

    • Author(s)
      Oi S, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Int J Oral Maxillofac Surg 37

      Pages: 1047-1053

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Frequent inactivation of a putative conditional tumor-suppressor gene, angiopoietin-like protein 2, in ovarian cancer2008

    • Author(s)
      Kikuchi R, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Res 68

      Pages: 5067-5075

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Frequent silencing of a putative tumor suppressor gene melatonin receptor 1A (MTNR1A) in oral squamous-cell carcinoma2008

    • Author(s)
      Nakamura E, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Sci 99

      Pages: 1390-1400

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploration of tumor-suppressive microRNAs silenced by D NA hynermethylation in oral cancer2008

    • Author(s)
      Kozaki K, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Res 68

      Pages: 2094-2105

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of SMURF1 as a possible target for 7q21.3-2 2.1 amplification detected in a pancreatic cancer cell line by in-house array-based comparative genomic hybridization2008

    • Author(s)
      Suzuki A, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Cancer Sci 99

      Pages: 986-994

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aurora kinase B is a predictive factor for the aggressive recurrence of hepatocellular carcinoma after curative hepate ctomy2008

    • Author(s)
      Tanaka S, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Br J Surg 95

      Pages: 611-619

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Overexpressed NF-{kappa}B inducing kinase contributes to the tumorigenesis of adult T-cell leukemia and Hodgkin Reed-Sternberg cells2008

    • Author(s)
      Saitoh Y, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Blood 111

      Pages: 5118-5129

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] POU2AF1, an amplification target at 11q23, promotes gro wth of multiple myeloma cells by directly regulating expression of a B-cell maturation factor, TNFRSF172008

    • Author(s)
      Zhao C, Inazawa J, et.al.
    • Journal Title

      Oncogene 27

      Pages: 63-75

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Application of in-house array-CGH for investigation and diagnosis of congenital genome disorders2008

    • Author(s)
      Hayashi S, Inazawa J, et.al.
    • Organizer
      58^<th> Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2008
    • Place of Presentation
      Philadelphia, Pennsylvania
    • Year and Date
      20081111-15
  • [Presentation] Exploration of genes related to X-linked mental retardation (XLMR) by in-house X-tiling array2008

    • Author(s)
      Honda S, Inazawa J, et.al.
    • Organizer
      58^<th> Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2008
    • Place of Presentation
      Philadelphia, Pennsylvania
    • Year and Date
      20081111-15
  • [Presentation] Frequent inactivation of a putative conditional tumor-suppressor gene TSOVC1 in ovarian cancer2008

    • Author(s)
      Kikuchi R, Inazawa, J et.al.
    • Organizer
      99th annual meeting of American Association for Cancer Research 2008
    • Place of Presentation
      San Diego, California
    • Year and Date
      20080412-16
  • [Presentation] Silencing of tumor-suppressive microRNAs by DNA hypermethylation in oral squamous cell carcinoma2008

    • Author(s)
      Kozaki K, Inazawa J, et.al.
    • Organizer
      99th annual meeting of American Association for Cancer Research 2008
    • Place of Presentation
      San Diego,California
    • Year and Date
      20080412-16
  • [Presentation] Identification of a novel amplification-target gene in oral squamous cell carcinoma(OSCC) using array-CGH-assisted strategy2008

    • Author(s)
      Begum A, Inazawa J, et.al.
    • Organizer
      99th annual meeting of American Association for Cancer Research 2008
    • Place of Presentation
      San Diego,California
    • Year and Date
      20080412-16
  • [Presentation] PRTFDCl, a possible tumor-suppressor gene, is frequently silenced in oral squamous-cell carcinomas by aberrant promoter hypermethylation2008

    • Author(s)
      Suzuki E, Inazawa J, et.al.
    • Organizer
      99th annual meeting of American Association for Cancer Research 2008
    • Place of Presentation
      San Diego, California
    • Year and Date
      20080412-16
  • [Presentation] 自作BACアレイを用いた未分化甲状腺癌細胞株のコピー数異常解析により検出された新規増幅領域20q11.22の標的遺伝子候補ITCH2008

    • Author(s)
      石原孝也、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] 自作BACアレイを用いた未分化甲状腺癌細胞株のコピー数異常解析により検出された新規増幅領域20q11.22の標的遺伝子候補ITCH2008

    • Author(s)
      石原孝也、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会・合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫
    • Year and Date
      2008-12-11
  • [Presentation] 肝細胞癌において腫瘍特異的DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制microRNA2008

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] 肝細胞癌において腫瘍特異的DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制microRNA2008

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会・合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] 高密度オリゴアレイCGHを用いた新規食道扁平上皮癌関連癌抑制遺伝子の探索2008

    • Author(s)
      春木茂男、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 口腔癌において腫瘍特異的DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制microRNA : miR-137とmiR-193a2008

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] エピゲノム異常で発現抑制を受ける新規口腔、食道扁平上皮癌抑制遺伝子候補の同定2008

    • Author(s)
      井本逸勢、井上純、稲澤譲治
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 神経芽腫細胞でのLAPTM5遺伝子強制発現により誘導される細胞死の特性2008

    • Author(s)
      井上純、井本逸勢、稲澤譲治
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 肝細胞癌において腫瘍特異的DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制microRNA2008

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌における新規診断治療標的遺伝子OESC1の同定2008

    • Author(s)
      小松周平、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] 肺小細胞癌における1p13増幅領域の標的候補遺伝子tripartite motif33(TRIM33)の解析2008

    • Author(s)
      横井左奈、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] エビジェネティック異常により発現抑制される子宮体がん関連癌抑制遺伝子のMPA療法における役割2008

    • Author(s)
      鶴田智彦、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] Inactivation of LC3A gene in human cancers2008

    • Author(s)
      白樺、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] 食道癌発生におけるYes-associated protein 1(YAP1)増幅の意義2008

    • Author(s)
      村松智輝、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] X-tilingアレイを用いたX染色体上の癌関連遺伝子群の探索2008

    • Author(s)
      坂本宙子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] Identification of a novel amplification-target gene in oral squamous cell carcinoma (OSCC) using-array-CGH strategy2008

    • Author(s)
      AsmaBegum、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] アレイCGHを用いた甲状腺未分化癌のゲノム構造解析による新規増幅領域20q11.22の標的候補遺伝子ITCHの同定2008

    • Author(s)
      石原孝也、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] Identification of a novel amplification-target gene in oral souamous cell carcinoma (OSCC) using array-CGH strategy2008

    • Author(s)
      Asma Begum、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第67回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知
    • Year and Date
      2008-10-28
  • [Presentation] アレイCGHを用いた多発奇形を伴う精神遅滞症例の解析と診断2008

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第53回大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川
    • Year and Date
      2008-09-30
  • [Presentation] X-tiling arrayを用いたX連鎖性精神発達遅滞(XLMR)の原因遺伝子探索2008

    • Author(s)
      本田尚三、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第53回大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川
    • Year and Date
      2008-09-30
  • [Presentation] アレイCGH法による肺小細胞癌の潜在的ゲノムコピー数解析と癌関連遺伝子の同定2008

    • Author(s)
      横井左奈、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第53回大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川
    • Year and Date
      2008-09-29
  • [Presentation] 先天異常症診断用アレイ、Genome Disorder Arrayを用いたMC/MRのアレイCGH解析2008

    • Author(s)
      会津善紀、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第53回大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川
    • Year and Date
      2008-09-28
  • [Presentation] Screening of tumor suppressive microRNAs silenced by tumor-s pecific DNA hypermethylation in hepatocellular carcinoma2008

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第9回文部科学省特定領域研究「がん」5領域・若手研究者ワークショップ
    • Place of Presentation
      アートランドホテル蓼科、長野
    • Year and Date
      2008-09-04
  • [Presentation] Identification of anovel amplification-target gene in oral squamous cell carcinoma(OSCC)using array CGH-assisted strategy2008

    • Author(s)
      Asma Begum、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本科学未来館みらいCANホール、東京
    • Year and Date
      2008-08-01
  • [Presentation] Pais a putative target for a novel 20q11.22 amplification detected in anaplastic thyroid carcinoma cells by array-based comparative genomic hybridization2008

    • Author(s)
      石原孝也
    • Organizer
      テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本科学未来館みらいCANホール、東京
    • Year and Date
      2008-08-01
  • [Presentation] Silencing of tumor-suppressive microRNAs by DNA hypermethylation in oral squamous cell carcinoma2008

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治
    • Organizer
      テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本科学未来館みらいCANホール、東京
    • Year and Date
      2008-08-01
  • [Presentation] PRTFDCl, a possible tumor-suppressor gene, is frequently silenced in oral squamous-cell carcinomas by aberrant promoter hypermethylation2008

    • Author(s)
      井本逸勢、稲澤譲治
    • Organizer
      テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本科学未来館みらいCANホール、東京
    • Year and Date
      2008-08-01
  • [Presentation] X-tiling arrayを用いたX連鎖生精神発達遅滞(XLMR)の原因遺伝子探索2008

    • Author(s)
      本田尚三、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第50回日本小児神経学会総会
    • Place of Presentation
      ホテル日航東京、東京
    • Year and Date
      2008-05-29
  • [Presentation] 先天異常疾患における潜在的染色体異常を探索・診断するツールとしてのアレイCGHの有用性2008

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第50回日本小児神経学会総会
    • Place of Presentation
      ホテル日航東京、東京
    • Year and Date
      2008-05-29
  • [Book] アレイCGH診断活用ガイドブック-知っておきたい染色体微細構造異常症-2008

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      239
    • Publisher
      医薬ジャーナル社
  • [Book] がんの分子標的治療(鶴尾隆編)2008

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      441
    • Publisher
      株式会社南山堂
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tmd.ac.jP/mri/cgen/frampage.htm

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 神経芽腫の検出方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・井上純
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2008-275176
    • Filing Date
      2008-09-11
  • [Patent(Industrial Property Rights)] BACクローンを用いる腎細胞癌の予後予測方法2008

    • Inventor(s)
      金井弥栄・新井恵吏・廣橋説雄・稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      財団法人ヒューマンサイエンス振興財団・国立大学法人東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2008-233491
    • Filing Date
      2008-09-11
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 口腔扁平上皮癌の検出方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・中村恵理奈・津田均
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2008-205138
    • Filing Date
      2008-08-08
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 先天性異常症の染色体欠失の検出方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・林深・会津善紀
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・株式会社ピー・エム・エル・富士フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2008-199541
    • Filing Date
      2008-08-01
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 甲状腺癌の検出方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・石原孝也・津田均
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2008-184982
    • Filing Date
      2008-07-16
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌抑制剤2008

    • Inventor(s)
      三沢あき子・井上純・井本逸勢・稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士写真フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2005-309921
    • Filing Date
      2008-05-16
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 卵巣癌の検出方法、及び抑制方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・菊池良子
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学東京医科歯科大学・富士写真フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2007-143111
    • Filing Date
      2008-05-28
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 口腔扁平上皮癌の検出方法、及び抑制方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・鈴木江美奈
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士写真フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2007-143110
    • Filing Date
      2008-05-23
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 神経芽腫の悪性度を含めた検出方法、及び抑制方法2008

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・杉野由里子
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京医科歯科大学・富士写真フイルム株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2007-169875
    • Filing Date
      2008-05-23
    • Overseas

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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