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2009 Fiscal Year Annual Research Report

がんの統合的ゲノム解析と個性診断法の開発

Research Project

Project/Area Number 17015012
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

稲澤 譲治  Tokyo Medical and Dental University, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 逸勢  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (30258610)
小崎 健一  東京医科歯科大学, 硬組織疾患ゲノムセンター, 特任准教授 (50270715)
Keywordsがん / ゲノム / 個性診断 / 分子標的治療 / CGHアレイ / DNAメチル化 / GhIP法 / BAMCA法
Research Abstract

高密度ゲノムアレイを用いて食道扁平上皮がん(ESCC)細胞で13q21.2ホモ欠失領域を検出し、標的遺伝子PCDH17を候補がん抑制遺伝子として同定した(Carcinogenesis,2010)。さらに、1q32-q41増幅領域の新規増幅標的遺伝子候補として、H3K36やp53K370にメチル基を付加しp53の不活性化するSMYD2を同定した(Carcinogenesis,2010)。SMYD2発現亢進のESCC症例は予後不良でありp53が正常例で特に予後不良が確認されておりESCCの個別化診断や治療標的分子の候補となる可能性が示された。さらに、肝細胞がん(HCC)においてがん抑制遺伝子型miRNA遺伝子を探索し、DNA過剰メチル化のエピジェネティック制御によって発現消失するmiR-124とmiR-203を同定した。両miRNAはHCCにおいて抗腫瘍活性を持ちその標的遺伝子としてCDK6やIQGAP1などを同定した(Carcinogenesis,2009)。また、神経芽腫(NB)には「腫瘍の自然消退」を認める予後良好型の存在が知られている。しかしその分子メカニズムは全く不明であった。独自開発のBACアレイを用いたDNAメチル化探索法(BAMCA法)によりLAPTM5(Lysosomal-associated protein multispanning membrane5)遺伝子が、NB細胞でメチル化により発現低下することを同定した(PLoS One,2009)。以上に加え、口腔がん(OSCC)細胞株の19q13増幅の標的遺伝子PAK4を同定た(Cancer Sci,2009)。PAK4はOSCCを含む頭頸部における蛋白レベルでの発現が亢進しており独立した予後予測因子となることが示された。PAK4はキナーゼドメイン点突然変異も報告されてきており、OSCCの新規がん治療標的になる可能性が示唆された。

  • Research Products

    (59 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (17 results) Presentation (27 results) Book (5 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (9 results) (of which Overseas: 2 results)

  • [Journal Article] DNA amplification and expression of FADD in oral squamous cell carcinoma2009

    • Author(s)
      Prapinjumrune C, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Oral Pathol Med. (in press)

  • [Journal Article] Gene-expression phenotypes for vascular invasiveness of hepatocellular carcinomas2009

    • Author(s)
      Tanaka S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Surgery. (in press)

  • [Journal Article] miR-124 and miR-203 are epigenetically silenced tumor-suppressive microRNAs in hepatocellular carcinoma2009

    • Author(s)
      Furuta M, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis. (in press)

  • [Journal Article] Lysosomal-associated protein multispanning transmembrane 5 gene(LAPTM5)is associated with spontaneous regression of neuroblastomas2009

    • Author(s)
      Inoue J, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      PLoS One. 4

      Pages: E7099

  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profiles in urothelial carcinomas and urothelia at the precancerous stage2009

    • Author(s)
      Nishiyama N, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Sci. (in press)

  • [Journal Article] Resequencing and Copy Number Analysis of the Human Tyrosine Kinase Gene Family in Poorly Differentiated Gastric Cancer2009

    • Author(s)
      Kubo T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis. 30

      Pages: 1857-1864

  • [Journal Article] Identification of PAK4 as a putative target gene for amplification within 19q13.12-q13.2 in oral squamous-cell carcinoma2009

    • Author(s)
      Begum A, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Sci. 100

      Pages: 1908-1916

  • [Journal Article] Kruppel-like factor 12 plays a significant role in poorly differentiated gastric cancer progression2009

    • Author(s)
      Nakamura Y, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Int J Cancer. 125

      Pages: 1859-1867

  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profiles in liver tissue at the precancerous stage and in hepatocellular carcinoma2009

    • Author(s)
      Arai E, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Int J Cancer. 125

      Pages: 2854-2862

  • [Journal Article] Overexpression of SMYD2 relates to tumor cell proliferation and malignant outcome of esophageal squamous-cell carcinoma2009

    • Author(s)
      Komatsu S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis. 30

      Pages: 1139-1146

  • [Journal Article] Molecular cloning of t(2 ; 7)(p24.3 ; p14.2), a novel chromosomal translocation in myelodysplastic syndrome-derived acute myeloid leukemia2009

    • Author(s)
      Fujita K, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Hum Genet. 54

      Pages: 355-359

  • [Journal Article] Surgical contribution to recurrence-free survival in patients with macrovascular-invasion-negative hepatocellular carcinoma2009

    • Author(s)
      Tanaka S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Am Coll Surg. 208

      Pages: 368-374

  • [Journal Article] ASK1 amd ASK2 differentially regulate the counteracting roles of apoptosis and inflammation in tumorigenesis2009

    • Author(s)
      Iriyama T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      EMBO Journal. 28

      Pages: 843-853

  • [Journal Article] PH domain-only protein PHLDA3 is a p53-regulated repressor of akt2009

    • Author(s)
      Kawase T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cell. 36

      Pages: 535-550

  • [Journal Article] Actinin-4 gene amplification in ovarian cancer : a candidate oncogene associated with poor patient prognosis and tumor chemoresistance2009

    • Author(s)
      Yamamoto S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Mod Pathol. 22

      Pages: 499-507

  • [Journal Article] SKI and MEL1 cooperate to inhibit transforming growth factor-beta signal in gastric cancer cells2009

    • Author(s)
      Takahata M, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Biol Chem. 284

      Pages: 3334-3344

  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profiles in both precancerous conditions and clear cell renal cell carcinomas are correlated with malignant potential and patient outcome2009

    • Author(s)
      Arai E, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis. 30

      Pages: 214-221

  • [Presentation] Exploration of genes related to X-linked mental retardation(XLMR)by BAC-based X-tiling array2009

    • Author(s)
      本田尚三、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2009
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii USA
    • Year and Date
      2009-10-21
  • [Presentation] Analyses of 499 cases of multiple congenital anomalies with mental retardation using array-CGH for investigation and diagnosis2009

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2009
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii USA
    • Year and Date
      2009-10-21
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌におけるYAP1とその isoform の癌遺伝子としての機能2009

    • Author(s)
      村松智輝、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-03
  • [Presentation] p53標的遺伝子PHLDA3はAkt抑制因子として機能するPH domain-only protein をコードする2009

    • Author(s)
      大木理恵子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-03
  • [Presentation] 口腔扁平上皮癌における19q13.12-q13.2増幅の新規標的遺伝子PAK42009

    • Author(s)
      ベガムアスマ、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-03
  • [Presentation] 尿路上皮がんならびに前がん段階にある尿路上皮におけるDNAメチル化プロファイル-発がんリスク評価と予後予測2009

    • Author(s)
      西山直隆、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 肝細胞がんとその前がん状態である慢性肝炎・肝硬変症におけるゲノム網羅的DNAメチル化プロファイル2009

    • Author(s)
      新井恵吏、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 肝細胞癌において腫瘍特異的DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制 microRNA2009

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌における新規診断・治療標的遺伝子SMYD2の同定2009

    • Author(s)
      小松周平、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 乳癌における1p13増幅領域の標的遺伝子 tripartite motif 33(TRIM33)の解析2009

    • Author(s)
      横井左奈、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 低分化胃がん進展におけるKLF12転写因子の役割2009

    • Author(s)
      中村裕、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 子宮体癌細胞株の機能的スクリーニングを用いたエピゲノム異常により発現抑制される癌抑制遺伝子型 microRNA の探索2009

    • Author(s)
      鶴田智彦、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 肝細胞癌においてエピゲノムで制御されるがん抑制遺伝子の統合的アレイ解析2009

    • Author(s)
      松村聡、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-02
  • [Presentation] 肝癌再発ネットワーク解析に基づく Aurora kinase B分子標的治療の開発2009

    • Author(s)
      田中真二、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-01
  • [Presentation] 胃がんにおける6p21ゲノム増幅と複数のがん関連遺伝子の協調的活性化2009

    • Author(s)
      細田文恵、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-01
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌において高頻度に発現抑制される癌関連抑制遺伝子DESC1の同定2009

    • Author(s)
      春木茂男、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-01
  • [Presentation] ヒト癌におけるLC3A variant 1の発現低下の意義2009

    • Author(s)
      白樺、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      第68回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-10-01
  • [Presentation] アレイCGH法による流産絨毛染色体分析2009

    • Author(s)
      小澤伸晃、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-26
  • [Presentation] ゲノムワイドな統合的DNAメチル化異常解析による肝癌抑制遺伝子候補探索2009

    • Author(s)
      井本逸勢、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-26
  • [Presentation] 自閉症スペクトラム障害を併存する精神遅滞の遺伝学的解析2009

    • Author(s)
      中川栄二、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-26
  • [Presentation] 1p13増幅領域の標的遺伝子 tripartite motif 33(TRIM33)は乳癌の予後不良因子である2009

    • Author(s)
      横井左奈、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] BAC-based X-tiling array を用いたX連鎖性精神発達遅滞(XLMR)の原因遺伝子探索2009

    • Author(s)
      本田尚三、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] アレイCGHを用いた多発奇形を伴う精神遅滞症例解析の4年間の実績2009

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] 小頭症と小脳脳幹部低形成を伴う発達遅滞12例におけるCASK遺伝子の解析2009

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] GDA700による染色体微細異常解析受託システムの構築2009

    • Author(s)
      会津善紀、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] 新規症候群の可能性のある10q24微細欠失を伴う2症例の報告2009

    • Author(s)
      岡本奈那、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] アレイCGHで診断された1p34.3微細欠失例2009

    • Author(s)
      岡本伸彦、稲澤譲治, その他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第54回大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Book] 講義録腫瘍学2009

    • Author(s)
      稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      240
    • Publisher
      株式会社メジカルビュー社
  • [Book] 造血器腫瘍アトラス-形態、免疫、染色体と遺伝子-改訂第4版2009

    • Author(s)
      稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      574
    • Publisher
      日本医事新報社
  • [Book] 入門腫瘍内科学2009

    • Author(s)
      稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      301
    • Publisher
      篠原出版新社
  • [Book] がん化学療法・分子標的治療 update2009

    • Author(s)
      稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      733
    • Publisher
      中外医学社
  • [Book] 新臨床腫瘍学(改訂第2版)-がん物療法専門医のために-2009

    • Author(s)
      稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      921
    • Publisher
      株式会社南江堂
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/cgen/framepage.htm

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 食道癌の検出又は予後の予測のための方法及び食道癌抑制剤2010

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・井本逸勢・春木茂男
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学・富士フィルム(株)
    • Industrial Property Number
      特願2010-041825
    • Filing Date
      2010-02-26
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 癌の検出方法および抑制方法2010

    • Inventor(s)
      稲澤譲治・小崎健一・井本逸勢・古田繭子・有井滋樹
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学・富士フィルム(株)
    • Industrial Property Number
      特願2010-046564
    • Filing Date
      2010-03-03
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸マイクロアレイを用いた解析方法2009

    • Inventor(s)
      氏原大、金原秀行、稲澤譲治、井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      富士フィルム株式会社、国立大学法人東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2009-126780
    • Filing Date
      2009-05-26
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸アレイ及び核酸アレイの識別方法2009

    • Inventor(s)
      石井靖幸、吉田淳哉、氏原大、三好隼人、岩木義英、稲澤譲治、井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      富士フィルム株式会社、国立大学法人東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2009-126894
    • Filing Date
      2009-05-26
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 薬剤耐性マーカーおよびその利用2009

    • Inventor(s)
      井上純、稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      稲澤譲治、富士フィルム株式会社、
    • Industrial Property Number
      特願2009-111725
    • Filing Date
      2009-05-01
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸マイクロアレイの異常スポットを検出する方法2009

    • Inventor(s)
      金原秀行、吉田淳哉、稲澤譲治
    • Industrial Property Rights Holder
      富士フィルム(株)、東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2009-128162
    • Filing Date
      2009-05-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 甲状腺癌の検出方法2009

    • Inventor(s)
      稲澤譲治、井本逸勢、石原孝也、津田均
    • Industrial Property Rights Holder
      富士フィルム(株)、東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2008-18498212/503,434
    • Filing Date
      2009-07-15
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 神経芽腫の検出方法2009

    • Inventor(s)
      稲澤譲治、井本逸勢、井上純
    • Industrial Property Rights Holder
      富士フィルム(株)、東京医科歯科大学
    • Industrial Property Number
      特願2008-27517612/568,569
    • Filing Date
      2009-09-28
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] MASL1癌遺伝子2009

    • Inventor(s)
      稲澤譲治、中村祐輔
    • Industrial Property Rights Holder
      大塚製薬、稲澤譲治、中村祐輔
    • Industrial Property Number
      特許4280878
    • Acquisition Date
      2009-03-27

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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