2009 Fiscal Year Annual Research Report
高精度比較ゲノム地図の作成と、それに基づいた比較ゲノム構造解析研究
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17018031
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| Research Institution | National Institute of Informatics |
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Principal Investigator |
藤山 秋佐夫 National Institute of Informatics, 情報学プリンシプル研究系, 教授 (60142311)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
黒木 陽子 独立行政法人理化学研究所, 生命情報基盤研究部門, 研究員 (10344037)
豊田 敦 情報・システム研究機構・国立遺伝学研究所, 特任准教授 (10267495)
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| Keywords | 比較ゲノム / ゲノム科学 / ゲノム情報 / 染色体 / 遺伝学 |
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| Research Abstract |
昨年度から開始したヒト21番染色体、Y染色体についての新型シーケンサによる大規模シーケンシングについては、、配列データの情報解析を進めた。また、ヒト由来細胞(特にHapMap計画で使われている日本人由来細胞株)全ゲノムを対象に、新型シーケンサによる大規模シーケンシングを実施し(約20x)、中国人全ゲノム、韓国人全ゲノムデータとの比較解析を行った結果、各々に特徴的に一塩基多型の存在と分布を明らかにした。霊長類Y染色体の比較ゲノム解析についても続行し、オランウータンY染色体特異的フォスミドライブラリー(5Xゲノム分)の作成と、テロメアプライマーによるスクリーニングが進み、いくつかの候補クローンを得ることができた。比較の外群としてタマーワラビーY染色体の解析を進め、Y染色体のソーティングを行った。また、ヒト19番長腕末端に相当する霊長類ゲノム領域について、ZNF遺伝子群とサブテロメア構造進化の二つの局面から比較ゲノム解析を行い、新知見を得ることができた。
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