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2007 Fiscal Year Annual Research Report

小型魚類変異体に基づく脊椎動物遺伝子の網羅的機能比較解析

Research Project

Project/Area Number 17018034
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

川上 浩一  National Institute of Genetics, 国立遺伝学研究所・個体遺伝研究系, 教授 (70195048)

Keywords分子生物学 / 発生遺伝学 / ゼブラフィッシュ / トランスポゾン / 挿入変異 / エンハンサートラップ / 遺伝子トラップ / トランスジェニック動物
Research Abstract

(1)Tol2トランスポゾン転移システムを用いて、ゼブラフィッシュにおいて遺伝子トラップ、エンハンサートラップスクリーニングを実施した。約500のGal4あるいはGFPを細胞・組織・器官特異的に発現するトランスジェニックフィッシュの作製を行った。
(2)心臓特異的にGFPを発現するトランスジェニックフィッシュを用いて、心臓の機能にミオシンリン酸化酵素が重要な働きをしていることを明らかにした。また、皮層の表面に存在するイオンのホメオスタシスに重要な細胞群特異的にGFPを発現するトランスジェニックフィッシュを用いて、これらの細胞の挙動を明らかにした。
(3)約200系統についてトランスポゾン挿入部位近傍のゲノムDNAをクローニングし、塩基配列決定を行った。さらに、これら系統のホモ2倍体を作製し、初期発生に重要な働きをしている遺伝子の変異を同定した。Tcf7遺伝子は、ヒレ形成におけるWntシグナルの伝達に重要であることを明らかにした。Synembryn-like遺伝子は、G蛋白質を介したシグナル伝達に重要で、色素胞形成に関わっていることを明らかにした。Parafibromin遺伝子は、筋肉細胞形成及びヒレ形成に必須であることを明らかにした。
(4)トランスジェニックフィッシュにおけるGFP及びGal4の組織・細胞・器官特異的な発現パターンとトランスポゾン挿入部位のデータベースzTrapに上記データを追加し公開している。また支援班の支援を得てこのデータベースの改良を行った。このデータベースを基に共同研究を推進した。

  • Research Products

    (38 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (25 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] misty somites, a maternal effect gene identified by transposon-mediated insertional mutagenesis in zebrafish that is essential for the somite boundary maintenance2008

    • Author(s)
      Kotani, T.
    • Journal Title

      Development Biology 316

      Pages: 383-396

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic dissection of neural circuits by To12 transposon-mediated Gal4 gene and enhancer trapping in zebrafish2008

    • Author(s)
      Asakawa, K.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 105

      Pages: 1255-1260

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insertional mutagenesis by the To12 transposon-mediated enhancer trap approach generated mutations in two developmental genes : tcf7 and synembryn-like2008

    • Author(s)
      Nagayoshi, S.
    • Journal Title

      Development 135

      Pages: 159-169

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] To12 : a versatile gene transfer vector in vertebrates2007

    • Author(s)
      Kawakami, K.
    • Journal Title

      Genome Biology 8

      Pages: 7-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nodal signals mediate interactions between the extra-embryonic and embryonic tissues in zebrafish.2007

    • Author(s)
      Fan, X.
    • Journal Title

      Developmental Biology 310

      Pages: 363-378

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A cardiac myosin light chain kinase regulates sarcomere assembly in the vertebrate heart.2007

    • Author(s)
      Seguchi, 0.
    • Journal Title

      The Journal of Clinical Investigation 117

      Pages: 2812-2824

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Localization of ammonia transporter Rhcg1 in mitochondrion-rich cells of yolk sac, gill, and kidney of zebrafish and its ionic strength-dependent expression.2007

    • Author(s)
      Nakada, T.
    • Journal Title

      Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol 293

      Pages: 1743-1753

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recombinant To12 transposase with activity in Xenopus embryos.2007

    • Author(s)
      Shibano, T.
    • Journal Title

      FEBS letters 581

      Pages: 4333-4336

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] stable integration and conditional expression of electroporated transgenes in chicken embryos2007

    • Author(s)
      Sato, Y.
    • Journal Title

      Developmental Biology 305

      Pages: 616-624

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeting neural circuitry in zebrafish using GAL4 enhancer trapping2007

    • Author(s)
      Scott, E.K.
    • Journal Title

      Nature Methods 48

      Pages: 323-326

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 脊椎動物におけるトランスポゾンを用いた遺伝学的方法論2007

    • Author(s)
      浦崎明宏
    • Journal Title

      実験医学 25

      Pages: 2507-2512

  • [Journal Article] To12トランスポゾンを用いたゼブラフィッシュGaL4エンハンサートラップ法の確立2007

    • Author(s)
      浅川和秀
    • Journal Title

      バイオテクノロジージャーナル 7

      Pages: 603-606

  • [Presentation] Genetic Dissection of Neural Circuits by Tol2 Transposon-Mediated Gal4 and Enhancer Trapping in Zebrafish2008

    • Author(s)
      Asakawa, K.
    • Organizer
      The 6th annual CDB Symposium 2008, Turning Neurons into a Nervous System
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20080324-26
  • [Presentation] Genetic dissection of neural circuits by To12 transposon-mediated Gal4 gene and enhancer trapping in zebrafish2008

    • Author(s)
      Asakawa, K.
    • Organizer
      The 2008 meeting on Neuronal Circuits : from Structure to Function, Cold Spring Harbor Laboratory
    • Place of Presentation
      New York
    • Year and Date
      20080313-16
  • [Presentation] Nrf2活性モニター用トランスジェニックゼブラフィッシュ系の開発2007

    • Author(s)
      辻田忠志
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] トランスポゾンを用いたGal4-UAS法による細胞の可視化と機能改変2007

    • Author(s)
      Kawakami, K.
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] 遺伝子トラップ系統を用いたゼブラフィッシュ三半規管形態形成の解析2007

    • Author(s)
      舟橋淳一
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] Transposon-mediated gene trapping and enhancer-trapping in zebrafish2007

    • Author(s)
      Kawakami, K.
    • Organizer
      ISDB
    • Place of Presentation
      Agra, India
    • Year and Date
      20071018-19
  • [Presentation] 三次元タイムラプスによるゼブラフィッシュ三半規管形態形成の解析2007

    • Author(s)
      舟橋淳一
    • Organizer
      第13回小型魚類研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20070916-17
  • [Presentation] 魚類の外部器官であるMitochondria-rich cells(MRCs)の複雑な発生分化機構2007

    • Author(s)
      江嵜正浩
    • Organizer
      第13回小型魚類研究
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20070916-17
  • [Presentation] ゼブラフィッシュバイオリソースII2007

    • Author(s)
      岡本仁
    • Organizer
      第13回小型魚類研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20070916-17
  • [Presentation] Transposon-mediated gene and enhancer trapping in zebrafish2007

    • Author(s)
      Kawakami, K.
    • Organizer
      The 16th Korea Genome Organization Conference
    • Place of Presentation
      Seoul
    • Year and Date
      20070913-14
  • [Presentation] Molybdenum cofactor biosynthesis essential for heparan sulfate formation and fgf signaling during vertebrate embryogenesis2007

    • Author(s)
      Kishimoto, Y.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] Insertion of RFP using gene trap results in a knockdown of the pax8 gene2007

    • Author(s)
      Gebhart, N.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] Visualization in zebrafish larvae of Na+ uptake in mitochondria-rich cells whose differentiation is dependent on foxi3A2007

    • Author(s)
      Esaki, M.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] Analysis of conserved element regulating expression of fgf8 in zebrafish2007

    • Author(s)
      Komisarczuk, A.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] Targeted gene expression by GAL4 gene and enhancer trapping in zebrafish defines subsets of neurons required for simple vetebrate behaviors2007

    • Author(s)
      Asakawa, K.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] New genetic techniques by excision of the To12 transposon : isolation of revertants and creating frame shift mutations2007

    • Author(s)
      Urasaki, A.
    • Organizer
      5th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      Amsterdam
    • Year and Date
      20070712-15
  • [Presentation] ゼブラフィッシュにおける新しい遺伝学的方法論の確立2007

    • Author(s)
      川上浩一
    • Organizer
      東洋紡バイオ財団設立25周年記念シンポジウム「次世代へのメッセージ」
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20070614-18
  • [Presentation] Somitic contribution to the formation of dorsal aorta involves cell migration regulated by Notch and ephrin2007

    • Author(s)
      Yoshiko Takahashi
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] ニワトリ胚視蓋極性形成におけるEnとFgfシグナルの役割2007

    • Author(s)
      原田英斉
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] ゼブラフィッシュGAL4トラップ法を用いた行動制御に関与する神経細胞の探索2007

    • Author(s)
      浅川和秀
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] ゼブラフィッシュにおけるJump starterトランスポゾンシステムの開発2007

    • Author(s)
      浦崎明宏
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] Xenopus胚において活性をもつ組換えTo12移転酵素の精製2007

    • Author(s)
      柴野卓志
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ幼生におけるNaイオン吸収細胞の同定とその発生分化機構の解析2007

    • Author(s)
      江崎正浩
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] 遺伝子トラップ系統を用いたゼブラフィッシュ三半規管形態形成の解析2007

    • Author(s)
      舟橋淳一
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Presentation] モリブデン補酵素生合成は、硫酸イオン生成を通じて脊椎動物胚発生におけるFgfシグナル伝達に必須の役割を果たす2007

    • Author(s)
      岸本康之
    • Organizer
      第40回日本発生生物学会, 第59回日本細胞生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20070528-30
  • [Remarks]

    • URL

      http://kawakami.lab.nig.ac.jp/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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