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2006 Fiscal Year Annual Research Report

放線菌ゲノム情報に基づく二次代謝産物の生産

Research Project

Project/Area Number 17019009
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

堀之内 末治  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授 (80143410)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鮒 信学  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助手 (70361574)
池田 治生  北里大学, 北里生命科学研究所, 教授 (90159632)
石川 淳  国立感染症研究所, 生物活性物質部, 室長 (40202957)
KeywordsStreptomyces griseus / ゲノム配列 / 二次代謝産物 / Streptomyces avermitilis / Nocardia farcinia / A-ファクター制御カスケード / チトクロームP-450 / コンビナトリアル生合成
Research Abstract

(1)S.griseusのゲノム中にあるIII型PKSを含む生合成遺伝子群を全解明し、arkylresorcinol合成およびメチル化酵素を同定した。
(2)天然型、非天然型のフラボノイド化合物群の発酵生産を達成した。この中には、長寿に関係するとして脚光を浴びているresveratrolやisoflavoneが含まれる。
(3)A-ファクター合成の鍵となるAfsAの反応機構をはじめ、BprAと名付けた還元酵素を同定するなど、全生合成経路を解明した。また、A-ファクター制御カスケードの重要な転写因子の標的として、プロテアーゼ阻害タンパク質(SSI)を同定し、放線菌の形態分化に関わるプロテアーゼ群およびその阻害タンパクによる制御を推定した。
(4)Nocardaminは4っの生合成遺伝子産物によってL-Lys, succinyl-CoAから生成することを明らかにした。また、この生合成遺伝子群は鉄イオンによって、IdeR(SAV3855)を介して発現が負に制御されていた。
(5)Ectoineは3つの生合成遺伝子産物によってL-Asp, acetyl-CoAから生成すること、またこれらの遺伝子は、NaClやKCIの濃度の上昇や非イオン性の溶質によって発現誘導が起きた。
(6)Pentalenolactoneの生合成系はterpene cyclase(Pt1A)を含む14-kbの領域に13個の遺伝子がクラスターを形成しており、これらの遺伝子産物の解析から部分経路を明らかにするとともに、新規な生合成中間体(1-deoxy-11β-hydroxypentalenic acid)を見出した。
(7)Cre/loxPを利用した大規模な染色体欠失を試み、およそ1.6Mbが欠失した組換え体を得た。欠失体の染色体は野生株に比べて約18%縮小しているが、生育および形態に変化はなかった。

  • Research Products

    (13 results)

All 2007 2006

All Journal Article (13 results)

  • [Journal Article] One-pot synthesis of genistein from tyrosine by coincubation of genetically engineered Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae cells.2007

    • Author(s)
      Y.Katsuyama
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol. 73

      Pages: 1143-1149

  • [Journal Article] Biosynthesis of γ-butyrolactone autoregulators that switch on secondary metabolism and morphological development in Streptomyces.2007

    • Author(s)
      J.Kato
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      Pages: 2378-2383

  • [Journal Article] Pentalenolactone biosynthesis. Molecular cloning and assignment of biochemical function to Pt1F, a short-chain dehydrogenase from Streptomyces avermitilis, and identification of a new biosynthetic intermediate.2007

    • Author(s)
      D.E.Cane
    • Journal Title

      Arch. Biochem. Biophys. Nov.(online)

  • [Journal Article] Construction of a pair of practical Nocardia-Escherichia coli shuttle vectors.2007

    • Author(s)
      K.Chiba
    • Journal Title

      Jpn. J. Infect. Dis. 60

      Pages: 45-47

  • [Journal Article] Phenolic lipid synthesis by type III polyketide synthases is essential for cyst formation in Azotobacter vinelandii.2006

    • Author(s)
      Nobutaka Funa
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103

      Pages: 6356-6361

  • [Journal Article] Combinatorial biosynthesis of flavones and flavonols in Escherichia coli.2006

    • Author(s)
      Ikuo Miyahisa
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol. 71

      Pages: 53-58

  • [Journal Article] A novel O-aminophenol oxidase responsible for formation of the phenoxazinone chromophore of grixazone.2006

    • Author(s)
      Hirokazu Suzuki
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 281

      Pages: 824-833

  • [Journal Article] Self-activation of serine/threonine kinase AfsK on autophosphorylation at threonine-168.2006

    • Author(s)
      Ayami Tomono
    • Journal Title

      J. Antibiot. 59

      Pages: 117-123

  • [Journal Article] Control of the Streptomyces subtilisin inhibitor gene by AdpA in the A-factor regulatory cascade in Streptomyces griseus.2006

    • Author(s)
      S.Hirano
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 188

      Pages: 6207-6216

  • [Journal Article] A gene cluster for biosynthesis of the sesqui-terpenoid antibiotic pentalenolactone in Streptomyces avermitilis.2006

    • Author(s)
      C.N.Tetzlaff
    • Journal Title

      Biochemistry 45

      Pages: 6179-6186

  • [Journal Article] Pentalenolactone biosynthesis; molecular cloning and assignment of biochemical function to Pt1H, a non-heme iron dioxygenase of Streptomyces avermitilis.2006

    • Author(s)
      Z.You
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 128

      Pages: 6566-6567

  • [Journal Article] Geosmin biosynthesis in Streptomyces avermitilis.2006

    • Author(s)
      D.E.Cane
    • Journal Title

      J. Antibiot. 59

      Pages: 471-479

  • [Journal Article] Pentalenolactone biosynthesis. Molecular cloning and assignment of biochemical function to Pt1I, a cytochrome P450 of Streptomyces avermitilis.2006

    • Author(s)
      R.Quaderer
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc. 128

      Pages: 13036-13037

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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