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2009 Fiscal Year Annual Research Report

放線菌ゲノム情報に基づく二次代謝産物の生産

Research Project

Project/Area Number 17019009
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

池田 治生  Kitasato University, 大学院・感染制御科学府, 教授 (90159632)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鮒 信学  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (70361574)
石川 淳  国立感染症研究所, 生物活性物質部, 室長 (40202957)
Keywords放線菌 / 二次代謝産物 / ゲノム / 物質生産 / 遺伝子発現制御
Research Abstract

放線菌が有する多様な二次代謝酵素の反応機構の解明および改変を行い、パスウェイ工学、代謝工学、コンビナトリアル生合成法や人工的生合成遺伝子クラスターの一員として利用することにより、既知有用物質の増産はもとより、「非天然型」化合物の微生物生産を達成し、新規な生理活性や特性を有する医薬、工業原料の開発を目指す1. コンビナトリアル生合成法による「非天然型」フラボノイドの発酵生産,クルクミノイド生産系に様々な基質を投与することで天然型7種、非天然型17種のクルクミノイドの生産に成功した。また、クルクミノイド生産系に様々な組み合わせで2種の基質を投与することで現在までに50種類以上の非対称クルクミノイドの生産に成功している。2. 未知生合成遺伝子群の解明、半世紀前に発見され、なおかつ多くのStreptomyces属が生産することが知られているペンタレノラクトンの生合成の詳細はこれまで不明であった。各種変異体の作製によりペンタレネンから生合成すること。また、最終工程ではBaeyer-Villiger酸化反応が進行することが推定され、その反応段階を解明した。PtIEはFMNおよびNADPH存在化、1-デオキシ-11-オキソペンタレネン酸をネオペンタレノラクトンDに変換するBaeyer-Villiger反応を触媒する酵素であることを明らかにした。これは生理的な基質が明らかとなったBaeyer-Villiger酸化酵素として初めての例であった。3. S.griseusのゲノム解析を完了し、7,138個のタンパク質をコードする遺伝子を見出し、さらに34個の二次代謝産物生合成遺伝子群を推定した。

  • Research Products

    (18 results)

All 2009 Other

All Journal Article (16 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Dynamic changes in the extracellular proteome caused by absence of a pleiotropic regulator AdpA in Streptomyces griseus.2009

    • Author(s)
      Akanuma G, et.al
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 73

      Pages: 898-912

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of target genes of the GinI/GinR quorum-sensing system in Gluconacetobacter intermedius.2009

    • Author(s)
      Iida A, Ohnishi Y, Horinouchi S
    • Journal Title

      Microbiol. 155

      Pages: 3021-3032

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome mining in Streptomyces avermitilis : A biochemical Baeyer-Villiger reaction and discovery of a new branch of the pentalenolactone family tree.2009

    • Author(s)
      Jiang J, et.al.
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 6431-6440

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic basis for natural product biosynthetic diversity in the actino mycetes.2009

    • Author(s)
      Nett M, Ikeda H, Bradley S, Moore B.S
    • Journal Title

      Nat.Prod.Rep 26

      Pages: 1362-1384

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The site-specific recombination system of actinophage TG1.2009

    • Author(s)
      Morita K, Yamamoto T, Fusada N, Komatsu M, Ikeda H, Hirano N, Takahashi H
    • Journal Title

      FEMS Microbiol.Lett. 297

      Pages: 234-240

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antibiotic Overproduction by rpsL and rsmG Mutants of Various Actinomy cetes.2009

    • Author(s)
      Tanaka Y, Komatsu M, Okamoto S, Tokuyama S, Kaji A, Ikeda H, Ochi K
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 75

      Pages: 4919-4922

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a regulatory gene, aveR, for the biosynthesis of a vermectin in Streptomyces avermitilis.2009

    • Author(s)
      Kitani K, Ikeda H, Sakamoto T, Noguchi S, Nihira T
    • Journal Title

      Appl.Microbiol.Biotechnol. 82

      Pages: 1089-1096

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Structures of Cytochrome P450 105Pl from Streptomyces avermitilis : Conformational Flexibility and Histidine Ligation State.2009

    • Author(s)
      Xu L-H, Fushinobu S, Ikeda H, Wakagi T, Shoun H
    • Journal Title

      J.Bacteriol.

      Pages: 1211-1219

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CebR as a master regulator for cellulose/cellooligosaccharide catabolism affects morphological development in Streptomyces griseus.2009

    • Author(s)
      Marushima K, Ohnishi Y, Horinouchi S
    • Journal Title

      J.Bacteriol. 191

      Pages: 5930-5940

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of multiple curcumin synthases from the herb Curcuma longa.2009

    • Author(s)
      Katsuyama Y, Kita T, Horinouchi S
    • Journal Title

      FEBS Lett. 583

      Pages: 2799-2803

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic synthesis of bis-5-alkylresorcinols by resorcinol-Producing type III polyketide synthases.2009

    • Author(s)
      Miyanaga A, Horinouchi S
    • Journal Title

      J.Antibiot. 62

      Pages: 371-376

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Physically discrete beta-lactamase-type thioesterase catalyzes product release in atrochrysone synthesis by iterative type I polyketide synthase.2009

    • Author(s)
      Awakawa T, Yokota K, Funa N, Doi F, Mori N, Watanabe H, Horinouchi S
    • Journal Title

      Chem.Biol. 161

      Pages: 613-623

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and gene disruption of small noncoding RNAs in Streptomyces griseus.2009

    • Author(s)
      Tezuka T, Hara H.Ohnishi Y, Horinouchi S
    • Journal Title

      J.Bacteriol. 191

      Pages: 4896-4904

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthesis of aliphatic polyketides by type III polyketide synthase and methyltransferase in Bacillus subtilis.2009

    • Author(s)
      Nakano C, Ozawa H, Akanuma G, Funa N, Horinouchi S
    • Journal Title

      J.Bacteriol. 191

      Pages: 4916-4923

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Combinatorial biosynthesis of Plant medicinal polyketides by microorganisms.2009

    • Author(s)
      Horinouchi S
    • Journal Title

      Curr.Opin.Chem.Biol. 13

      Pages: 197-204

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Curcuminoid biosynthesis by two type III polyketide synthases in the herb Curcuma longa.2009

    • Author(s)
      Katsuyama Y, Kita T, Funa N, Horinouchi S
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 11160-11170

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] A versatile host for secondary metabolite production and its regulatory analysis.2009

    • Author(s)
      Haruo Ikeda
    • Organizer
      International Synpojium on Biology of Actinomyctes
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2009-08-21
  • [Remarks]

    • URL

      http://streptomyces.nih.go.jp/

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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