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2009 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム塩基配列の網羅的解析法による疾患遺伝子探索と新規分子生命現象の発掘

Research Project

Project/Area Number 17019027
Research InstitutionHamamatsu University School of Medicine

Principal Investigator

蓑島 伸生  Hamamatsu University School of Medicine, 光量子医学研究センター, 教授 (90181966)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大石 健太郎  浜松医科大学, 光量子医学研究センター, 助教 (80345826)
大坪 正史  浜松医科大学, 光量子医学研究センター, 助教 (10327653)
堀田 喜裕  浜松医科大学, 医学部, 教授 (90173608)
Keywords遺伝学 / 遺伝子 / ゲノム / 情報工学 / 脳神経疾患
Research Abstract

緑内障と加齢黄斑変性(AMD)の発症原因・関連遺伝子について以下の結果を得た。
1. 緑内障の原因遺伝子探索:酵母2ハイブリッド法により、緑内障の既知原因遺伝子オプチニューリンの相互作用タンパクをスクリーニングした。その中から、緑内障発症の要因となる「細胞へのストレス負荷」に関連し得る遺伝子を柚出・分類して、翻訳領域全長cDNAを単離した後、培養細胞での発現と相互作用を確認した(下記中、発、相は、それぞれ発現が、さらに相互作用も確認されたものを示す)。
(1) 細胞死の誘導関連[発:VDAC2;相:SLC4A2, ATP6V0E2]
(2) ゴルジ体-核移行関連[発:DYNLL1, CETN2, TAGLN;相:RANBP10]
(3) 核移行後の機能関連[UBC, WSB2, FALZ]
(4) その他シグナル分子、細胞骨格等関連[PLOD, WNT2B, RIPK;発:CLU, FTL, TRAPP, EEF1A;相:Rab8]
2. AMDの関連遺伝子探索:ラット網膜光障害実験モデルでは、白色光照射で起こる網膜光障害の感受性の程度がラットの系統により異なるため、感受性を支配する遺伝子(群)の同定可能と考えられその遺伝子はAMD発症に寄与する可能性がある。昨年度までに、光障害感受性と光障害耐性(以下、感受性、耐性)の純系を交配して解析した結果、感受性が耐性に対して常染色体優性のメンデル遺伝形質を示すことを得ていた。そこで、F-1に対して耐性の純系を戻し交配し、感受性の戻し交配個体(BC-1)を選別して、その個体にさらに同じ戻し交配を繰り返した。BC-1~BC-4の全個体を表現型解析したところ、どの世代でも個体数比が感受性:耐性≒1:3となり、2遺伝子の同時関与が想定された。純系親を見分ける多型座位を利用して、BC-3、BC-4個体を解析したところ、2座位(5番および19番染色体)について、感受性親のゲノムが共通して残存していることが判明し、表現型解析により推定される関連遺伝子数と一致した。現在、遺伝子の同定に向けて戻し交配を継続している。

  • Research Products

    (19 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (14 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] KMeyeDB : a graphical database of mutations in genes that cause eye diseases2010

    • Author(s)
      Kawamura, T., et al.
    • Journal Title

      Human Mutation (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regression analysis of swimming time of rats with retinal photic injury using lognormal distribution model2010

    • Author(s)
      Ohishi, K., et al.
    • Journal Title

      Photomedicine and Photobiology 31

      Pages: 21-22

  • [Journal Article] Identification of 11 novel mutations in USH2A among Japanese patients with Usher syndrome type 22009

    • Author(s)
      Nakanishi, H., et al.
    • Journal Title

      Clinical Genetics 76

      Pages: 383-391

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ラット網膜光障害感受性に関わる染色体領域の同定2010

    • Author(s)
      大石健太郎, 他
    • Organizer
      第14回 眼科分子生物研究会
    • Place of Presentation
      大阪府池田市
    • Year and Date
      2010-02-13
  • [Presentation] The new version of MutationView : Enhanced Search Function and Significant Increase in the Number of Gene Entries2009

    • Author(s)
      Ohtsubo, M., et al.
    • Organizer
      20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091214-20091216
  • [Presentation] ラット網膜光障害感受性の責任遺伝子探索2009

    • Author(s)
      大石健太郎, 他
    • Organizer
      第32回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] 緑内障原因遺伝子産物オプチニュリンと相互作用するタンパクの同定2009

    • Author(s)
      大坪正史, 他
    • Organizer
      第32回 日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Interaction between optineurin and bZIP transcription factor NRL2009

    • Author(s)
      Wang, C., et al.
    • Organizer
      Association for Research in Vision and Ophthalmology
    • Place of Presentation
      Florida (USA)
    • Year and Date
      20090503-20090507
  • [Presentation] Mutation View(招待講演)2009

    • Author(s)
      Minoshima, S., et al.
    • Organizer
      International Symposium on Applied Genomics 2009 Me dical Genome Science in the Personal Genome Era
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-12-03
  • [Presentation] ゲノム医療の現状・将来について(招待講演)2009

    • Author(s)
      蓑島伸生
    • Organizer
      第119回 遠江医学会
    • Place of Presentation
      浜松
    • Year and Date
      2009-11-15
  • [Presentation] A new version of MutationView : Enhanced searching function and significant increase of the number of genes with variation data2009

    • Author(s)
      Ohtsubo, M., et al.
    • Organizer
      Human Genome Variation Society 2009
    • Place of Presentation
      Honolulu (USA)
    • Year and Date
      2009-10-20
  • [Presentation] Isolation of proteins interacting with optineurin, a product protein of glaucoma-causative gene2009

    • Author(s)
      Ohtsubo, M., et al.
    • Organizer
      第9回慶北-浜松合同医学シンポジウム(The 9th Kyungpook-Hamamatsu Joint Medical Symposium, Hamamatsu Meeting)
    • Place of Presentation
      大邸(韓国)
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] Genetic analysis of rat strain-dependents difference in susceptibility to retinal photicinjury and mapping possible susceptibility loci2009

    • Author(s)
      Ohishi, K., et al.
    • Organizer
      第9回慶北-浜松合同医学シンポジウム(The 9th Kyungpook-Hamamatsu Joint Medical Symposium, Hamamatsu Meeting)
    • Place of Presentation
      大邸(韓国)
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] ヒト遺伝子多様性データベースの構築の現状(招待講演)2009

    • Author(s)
      蓑島伸生, 他
    • Organizer
      第16回 日本遺伝子診療学会大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2009-07-31
  • [Presentation] ラット網膜光障害の感受性遺伝子検索のための遺伝学的アプローチ(2)2009

    • Author(s)
      大石健太郎, 他
    • Organizer
      第31回 日本光医学・光生物学会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-07-25
  • [Presentation] ラット網膜光障害の感受性遺伝子検索のための遺伝学的アプローチー-病理組織所見と行動学所見の関係比較-2009

    • Author(s)
      大石健太郎, 他
    • Organizer
      第20回 眼科酸化ストレス研究会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-07-25
  • [Presentation] 緑内障原因遺伝子ミオシリンの相互作用蛋白の同定:発症を修飾する因子どしての可能性2009

    • Author(s)
      大坪正史, 他
    • Organizer
      第113回 日本眼科学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-04-16
  • [Remarks]

    • URL

      http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/

  • [Remarks]

    • URL

      http://symphonie.mpb.hama-med.ac.jp/

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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