多発家系を基盤にした単・少・多因子疾患関連遺伝子の探索

2007 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17019055
• Research Institution: Health Sciences University of Hokkaido
• Principal Investigator: 新川 詔夫 Health Sciences University of Hokkaido, 個体差健康科学研究所, 教授 (00111170)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 太田 亨 個体差健康科学研究所, 准教授 (10223835) ; 木下 晃 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (60372778)
• Keywords: 染色体異常 / 疾患遺伝子 / 連鎖解析 / 単因子疾患 / 多因子疾患 / 関連解析 / 疾患感受性遺伝子

Research Abstract

染色体異常からの疾患遺伝子の同定:(a)染色体構造異常をもつOpitz C症候群、裂手裂足、爪低形成、および歌舞伎症候群患者の切断点解析を行い、前3者に各々TACTILEと新規遺伝子Y、ケラチン遺伝子クラスターを同定した。前2者では他の患者各1人に点変異を認めたが、健常日本人にはなかったので各々原因遺伝子である可能性が高い。歌舞伎症では、転座切断点とその付近に4ヵ所の欠失が存在し、欠失領域内の24遺伝子中11遺伝子の変異解析を他の患者で行い病的変異はみられなかった。単因子疾患における解析:(a)4型合指症家族の連鎖解析で、D7S3070とD7S559間領域で最大LOD得点=1.613を得た。同領域の候補遺伝子LMBR1、SHH、ZRSには変異はみられなかった。(b)1型合指症家族の連鎖解析で4ケ所の候補領域を見出した。(c)PKCの新規5家族の連鎖解析で、PKCCRに再びマップされた。同領域付近の158遺伝子の解析では変異は同定されなかった。(d)30名のKabuki症候群患者において、RAS-MAPKシグナル伝達系遺伝子の候補遺伝子解析を行ったが、全て既知SNPであった。(e)過去筆者らが報告した常染色体優性の後極性白内障座領域に白人家系の疾患がマップされたのを受け、候補遺伝子探索で両家系にCHMP4B遺伝子変異を同定した。少・多因子疾患における関連解析:(a)Dupuytren拘縮症患者70名と対照者を集積し、16qの候補領域中524SNP部位における関連解析を行った。5 SNP領域がP<0.01を示し、このうち2 SNP(rs2111114とrs8063241)のP値は各々0.0055と0.0014であった。一方、患者81名と対照者において、同2種SNPと7種の周辺SNPを追加して関連、ハプロタイプ、連鎖不平衡解析を行ったがいずれも有意ではなかった。(b)79名の腋窩臭汗症患者において腋窩臭症と湿型耳垢型との関連解析を行い、非常に強い相関を得た(p<3.0×10^-25)。

Research Products

• [Journal Article] A Down syndrome girl with partial trisomy for 2lpter-q22.13: A clue to narrow the Down syndrome critical region (2008)
  • Author(s): Sato D, Kawara H, Shimokawa O, Harada N, Tonoki H, Takahashi N, Imai Y, Kimura H, Matsumoto N, Aria T, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: Am J Med Genet 146A Pages: 124-127
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide linkage analysis and mutation analysis of hereditary congenital blepharoptosis in a Japanese family (2008)
  • Author(s): Nakashima M, Nakano M, Hirano A, Kishino T, Kondoh S, Miwa N, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: J Hum Genet 53(1) Pages: 34-41
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A strong association between human earwax-type and apocrine colostrum secretion from the mammary gland (2007)
  • Author(s): Miura K, Yoshiura K, Miura S, Shi mada T, Yamasaki K, Yoshida A, Nakayama D, Shibata Y, Niikawa N, Masuzaki H
  • Journal Title: Hum Genet 121(5) Pages: 631-633
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Paroxysmal kinesigenic choreoathetosis (PKC): Confirmation of linkage of to 16p1l-q21 but unsuccessful detection of mutations among 158 genes at the PKC-crit ical region in seven PKC families (2007)
  • Author(s): Kikuchi, T., Nomura, , M., Tomita, H., Harada, N., Kato, N., Yoshiura, K., Niikawa N
  • Journal Title: J Hum Genet 52 Pages: 334-341
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Congenital arhinia: Molecular-genetic analysis of five patients (2007)
  • Author(s): Sato D, Shimokawa O, Harada N, OlsenOE, Hou J-W, Muhlbauer W, Blinkenberg E, Okamoto N, Kinoshita A, Matsumoto N, Kondo S, Kishino T, Miwa N, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: Am J Med Genet 143A Pages: 546-552
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Role of DNA methylation and histone H3 lysine 27 methylation in tissue-specific imprinting of mouse Grb10 (2007)
  • Author(s): Yamasaki Y, Kayashima T, Mapendano CK, Soejima H, Ohta T, Masuzaki H, Kinoshita A, Urano T, Yoshiura K, Matsumoto N, Ishimaru T, Mukai T, Niikawa N, Kishino T
  • Journal Title: Mol Cell Biol 27(2) Pages: 732-742
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] PTCH1 mutations in four Japanese families with as cell nevus syndrome (2007)
  • Author(s): Matsuzawa N, Nagao T, Niikawa N, Shimozato K, Yoshiura K: PTCH1 mutations in four Japanese families with basal cell nevus syndrome
  • Journal Title: J Clin Pathol 59(10) Pages: 1084-1086
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular analysis of hearing loss associated with enlarged vestibular aqueduct in the mainland Chinese: A unique SLC26A4 mutation spectrum (2007)
  • Author(s): Hu H, Wu LQ, Feng Y, Pan Q, Long Z, Li J, Dai HP, Xia K, Liang DS, Niikawa N, Xia JH
  • Journal Title: J Hum Genet 52(6) Pages: 492-497
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Acrodysostosis with unusual iridal color changing with age (2007)
  • Author(s): Nii E, Urawa M, Nshimura T, Kitou H, Ikegawa S, Shimizu S, Niikaw a N, Taneda H, Uchida A
  • Journal Title: Am J Med Genet 144B Pages: 824-825
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Opitz C (trigonocephaly) syndrome caused by deficiency of a member of the immunoglobulin superfamily, CD96 (2007)
  • Author(s): Kaname T, Yanagi K, Chinen Y, Makita Y, Okamoto N, Maehara H, Ohwan I, Kanaya F, Kubota Y, Oike Y, Yamamoto T, Kurosawa K, Fuku shima Y, Bohring A, Opitz JM, Yoshiura K, Niikawa N, Naritomi K
  • Journal Title: Am J Hum Genet 81(4) Pages: 835-841
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] CHMP4B, a novel gene for autosomal dominant cataracts linked to chromosome 20q (2007)
  • Author(s): Shiels A, Bennett TM, Knopf HL, Yamada K, Yoshiura K, Niikawa N, Shim S, Hanson PI
  • Journal Title: Am J Hum Genet 81(3) Pages: 596-606
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A syndactyly type IV locus maps to 7q36 (2007)
  • Author(s): Sato D, Liang DS, Wu LQ, Nishimura G, Yoshiura K. Xia JH, Niikaw a N: A syndactyly type IV locus maps to 7q36
  • Journal Title: J Hum Genet 52(6) Pages: 561-564
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Quantitative SAR analysis and molecular dynamics simulation to functionally validate nonsynonymous polymorphisms of human ABC transporter ABCB1 (2007)
  • Author(s): Sakurai A, Onishi Y, Hirano H, Seigneuret M, Obanayama K, Kim GW. Liew EL, Sakaeda T, Yoshiura K, Niikawa N, Sakurai M, Ishikawa T
  • Journal Title: J Biochem 46(26) Pages: 7678-7693
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Deficiency of a member of the immunoglobulin superfamily causes a form of C (Opitz trigonocephaly) syndrome (2007)
  • Author(s): Tadashi Kaname, Kumiko Yanagi, Yasutsugu Chinen, Yoshio Makita, No buhiko Okamoto, Hiroki Maehara, Ichiro Owan, Fuminori Kanaya, Yuichi Oike, Toshiyuki Yamamoto, Kenji Kurosawa, Yoshimitsu Fukushima, Axel Bohring, John m. Opitz, Ko-ichiro Yoshiura, Norio
  • Organizer: 57th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
  • Place of Presentation: San Diego, USA
  • Year and Date: 20071000
• [Presentation] 古人骨における耳垢遺伝子解析の試み (2007)
  • Author(s): 佐伯和信、吉浦孝一郎、新川詔夫、岡本圭史、分部哲秋
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 20070912-15
• [Presentation] 合指症IV型の遺伝子座マッピング (2007)
  • Author(s): 佐藤大介、Liang Desheng、Wu Ling qian、Pan Qian、Xia Kun、Dai Heping、Wang Hua、西村玄、吉浦孝一郎、Xia Jiahui、新川 詔夫
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 20070912-15
• [Presentation] 歌舞伎メーキャップ症候群の染色体転座・微細欠失内の候補遺伝子解析 (2007)
  • Author(s): 国場英雄、霜川修、Liag Desheng、Xia Jiahui、木下晃、吉浦孝一郎、原田直樹、近藤達郎、大橋博文、黒澤健司、福島義光、成富研二、新川詔夫
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 20070912-15
• [Presentation] C症候群を呈し、均衡型転座t(3;18) (q13.13;q12.1)をもつ患児の染色体切断点解析 (2007)
  • Author(s): 要 匡、柳久美子、知念安紹、前原博樹、吉浦孝一郎、新川詔夫、成富研二
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 20070912-15
• [Presentation] C症候群の原因解析 (2007)
  • Author(s): 柳 久美子、要 匡、知念 安紹、蒔田 芳男、岡本 伸彦、前原 博樹、久保田 義顕、尾池 雄一、山本 俊至、黒澤 健司、福嶋 義光、Axel Bohring、John Opitz M、吉浦 孝一郎、新川 詔夫、成富 研二
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 20070912-15
• [Presentation] Breakpoints analysis of a balanced de novo translocation t (3;18) (q13.13;q12.1) in a patient with Opitz C trigonocephaly synt (3;18) (q13.13;q12.1) in a patient with Opitz C trigonodrome (2007)
  • Author(s): Tadashi Kaname, Kumiko Yanagi, Yasutsugu Chinen, Koichiro Yoshiura, Norio Niikawa, Kenii Naritomi
  • Organizer: European Human Genetics Conference 2007
  • Place of Presentation: Nice, France
  • Year and Date: 20070600
• [Presentation] 耳垢型決定因子としてのABCトランスポーター遺伝子(ABCC11) (2007)
  • Author(s): 新川詔夫、吉浦孝一郎
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 横浜市みなとみらい国際会議場
  • Year and Date: 2007-12-11
• [Presentation] 全国スーパーサイエンスハイスクール(SSH)の共同による耳垢型対立遺伝子の全国地図作製の研究 (2007)
  • Author(s): 山田賢輔、北島玲那、田中清、長嶋哲也、古賀巌、吉浦孝一郎、新川詔夫
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 2007-09-15
• [Presentation] 爪から抽出したgenomic DNAを用いた多型解析:血液サンプルとの比較 (2007)
  • Author(s): 中島光子、新川詔夫、吉浦孝一郎
  • Organizer: 第52回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 東京京王プラザホテル
  • Year and Date: 2007-09-12
• [Patent(Industrial Property Rights)] 耳垢型又は腋下臭症の評価方法 (2007)
  • Inventor(s): 新川詔夫、吉浦孝一郎
  • Industrial Property Rights Holder: 長崎大学長
  • Industrial Property Number: 国際特許、PCT/JP2006/312673
  • Filing Date: 2007-12-14
  • Overseas