多発家系を基盤にした単・少・多因子疾患関連遺伝子の探索

2008 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17019055
• Research Institution: Health Sciences University of Hokkaido
• Principal Investigator: 新川 詔夫 Health Sciences University of Hokkaido, 個体差健康科学研究所, 教授 (00111170)
• Keywords: 染色体異常 / 疾患遺伝子 / 連鎖解析 / 単因子疾患 / 多因子疾患 / 関連解析 / 疾患感受性遺伝子

Research Abstract

(1) Kabuki症候群におけるゲノムコピー-数変化の検索と候補遺伝子解析 : ゲノムコピー変化の検索で、患者18名中10名に9領域の欠失を検出したが、うち6欠失は既登録多型であった。9q21欠失中の遺伝子を候補遺伝子とし、43名の患者において変異解析を行ったが共通の病的変異はなかった。-方、患者30名で16個のRAS-MAPKシグナル伝達系遺伝子の候補変異解析を行ったが、患者に特有な変異はなかった。また20p12.1のC20orf133欠失や点変異も検出されなかった。転座由来の8q24欠失を伴った1例においてSNPアレイ解析を行った。6箇所の欠失内および周辺遺伝子の計26遺伝子について核型正常の30名の患者における変異解析を行った。10種の未登録の非同義変異塩基置換が同定されたが、うち8種は母や正常人にあり、稀な多型であった。6種の非同義変異は多型か否か未同定である。
(2) 発作性運動誘発性コレオアテトーシスの候補遺伝子解析 : 過去、確認されたPKC領域中の223の遺伝子についての変異解析を行ったが、原因遺伝子は特定できなかった。
(3) Dupuytren拘縮症 : ベラルーシ人試料を用いて、候補領域16qの6cM領域にある524SNPを選択し、患者65試料と正常対照者55試料のタイピング後、関連解析を行った。P<0.01を示す5つのSNPを含む遺伝子のエクソン部分の変異解析を行ったが、変異は発見されなかった。患者49試料におけるマイクロアレイを用いた全ゲノム関連解析を行った結果、p<0.001以下の3SNPを得た (最小はp=0.0000722)
(4) その他の疾患 : 軟口蓋裂、彎指・指異形成を伴う難聴、裂手裂足症、中條病などの解析は現在進行中である。

Research Products

• [Journal Article] Pre- and postnatal overgrowth in a patient with proximal 4p deletion (2008)
  • Author(s): Wu LQ, Long Z, Liang DS, Harada N, Pan Q, Yoshiura, K, Xia K, Dai HP, Niikawa N, Xia JH
  • Journal Title: Am J Med Genet 146A Pages: 791-794
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A Down syndrome girl with partial trisomy for 2lpter-g22.13 : A clue to narrow the Down syndrome critical region (2008)
  • Author(s): Sato D, Kawara H, Shimokawa O, Harada N, Tonoki H, Takahashi N, Imai Y, Kimura H, Matsumoto N, Ariga T, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: Am J Med Genet 146A Pages: 124127
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genome-wide linkage analysis and mutation analysis of hereditary congenital blepharoptosis in a Japanese family (2008)
  • Author(s): Nakashima M, Nakano M, Hirano A, Kishino T, Kondoh S, Miwa N, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: J Hum Genet 53 Pages: 34-41
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Precision of high-throughput single-nucleotide polymorphism genotyping with fingernail DNA : comparison with blood DNA (2008)
  • Author(s): Nakashima M, Tsuda M, Kishino T, Kondoh S, Kinoshita A, Shimokawa O, Niikawa N, Yoshiura K
  • Journal Title: Clin Chem 54 Pages: 1746-1748
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Lack of C20orf133 and FLRT3 mutations in 43 patients with Kabuki syndrome in Japan (2008)
  • Author(s): Kuniba H, Tsuda M, Nakashima M, Miura S, Miyake N, Kondoh T, Matsumoto T, Moriuchi H, Ohashi H, Kurosawa K, Tonoki H, Nagai T, Okamoto N, Kato M, Fukushima Y, Naritomi K, Matsumoto N, Kinoshita A, Yoshiura K, Niikawa N
  • Journal Title: J Med Genet 45 Pages: 479-480
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] No mutation in RAS-MAPK pathway genes in 30 patients with Kabuki syndrome (2008)
  • Author(s): Kuniba H, Sato D, Yoshiura K, Ohashi H, Kurosawa K, Miyake N, Kondoh T, Matsumoto T, Nagai T, Okamoto N, Fukushima Y, Matsumoto N, Niikawa N
  • Journal Title: Am J Med Genet 146 Pages: 1893-1896
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A haplotype, NAT2*6A, of the N-acetyltransferase 2 gene is an important biomarker for a risk of anti-tuberculosis drug-induced hepatotoxicity in Japanese patients with tuberculosis (2008)
  • Author(s): Higuchi N, Tahara N, Yanagihara K, Fukushima K, Suyama N, Inoue Y, Miyazak Y, Kobayashi T, Yoshiura K, Niikawa N, Isomoto H, Shikuwa S, MizutaY, Kohno S, Tsukamoto K
  • Journal Title: World J Gastroenterol 13 Pages: 6003-6008
  • Peer Reviewed
• [Book] Encyclopedia of Life Sciences (2009)
  • Author(s): Miyake N, Matsumoto N, Niikawa N
  • Total Pages: 1-8
  • Publisher: Wiley & Sons