多発家系を基盤にした単・少・多因子疾患関連遺伝子の探索

2009 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17019055
• Research Institution: Health Sciences University of Hokkaido
• Principal Investigator: 新川 詔夫 Health Sciences University of Hokkaido, 個体差健康科学研究所, 教授 (00111170)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 太田 亨 個体差健康科学研究所, 准教授 (10223835)
• Keywords: 染色体異常 / 疾患遺伝子 / 連鎖解析 / 単因子疾患 / 因子疾患 / 関連解析 / 疾患感受性遺伝子

Research Abstract

(1) 歌舞伎症候群:(1)患者18名でゲノムコピー数変化のアレイ検索を行い、検出した18カ所の微細欠失中MAMDC2, SMC5, KLF9, TRPM3を候補遺伝子とし、患者41名で変異解析を行ったが疾患特異的変異はなかった。(2)患者30名でRAS-MAPK系遺伝子とC20orf133座の250kb欠失の有無を調べたが疾患特有変異はみられなかった。(3)多発性外骨種とKS、新生転座t(8;18)を合併する患者の転座切断点解析で、欠失を含む複雑異常を同定した。欠失内の24遺伝子における変異解析では異常はみられなかった。(4)標的分子がRAFで活性調節を行うことやKOマウスに下口唇窩が観察されることから遺伝子Xを候補とした。1例の患者に正常人にはないミスセンス変異を同定した。
(2) 発作性運動誘発性コレオアテトーシス:過去連鎖解析で確認された領域中の157遺伝子と外側の66遺伝子を候補として変異解析を行ったが、原因遺伝子は特定できなかった。
(3) 軟口蓋裂:優性遺伝の1家系において10Kアレイによる連鎖解析を行った結果、高いLOD値を示した3領域(1p36、2p24、5p15)が候補領域として示唆された。
(4) Dupuytren拘縮症:(1)ベラルーシ人試料を用いて、過去マップされた16qの6cM領域にある524 SNP(患者65試料と正常対照者55試料)、および50Kアレイ(患者77試料と対照者66試料)を用いて関連解析を行った結果、3 SNPでp<0.001以下となった。
(5) 4型合指症:連鎖解析によって疾患座を7q36にマップした。同領域の3種の候補遺伝子解析では変異はみられなかったが、類似疾患においてSHH上流のZRS領域重複が報告されたので、同家系患者における定量PCR、アレイによるコピー数とLOH解析を行い、LMBR1遺伝子を含む97KbのZRS重複を同定した。
(5)裂手裂足症:逆位挿入をもつ患者から7q21.3切断点の解析を行い新規遺伝子Yを単離した。患者ではイントロン3内に切断点が存在した。日本人患児61人中2人にエクソン6内の点変異(C->T)とエクソン7内の点変異(A->G)を認めた。健常人120人には変異はみられなかった。

Research Products

• [Journal Article] A type of familial cleft of the soft palate maps to 2p24.2-p24.1 or 2p21-p12 (2010)
  • Author(s): Tsuda M, Yamada T, Mikoya T, Sogabe I, Nakashima M, Kishino T, Kinoshita A, Niikawa N, Hirano A, Yoshiura K
  • Journal Title: J Hum Genet 55 Pages: 124-126
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Japanese map of the earwax gene frequency : a nation-wide collaborative study by Super Science High School (SSH) Consortium (2009)
  • Author(s): The Super Science High School (SSH) Consortium
  • Journal Title: J Hum Genet 54 Pages: 499-503
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Earwax, osmidrosis, and breast cancer : Why does one SNP (538G>A) in the human ABC transporter ABCC11 gene determine earwax type? (2009)
  • Author(s): Toyoda Y, Sakurai A, Mitani Y, Nakashima M, Yoshiura K, Nakagawa H, Sakai Y, Ota I, Lezhava A, Hayashizaki Y, Niikawa N, Ishikawa T
  • Journal Title: FASEB J 23(6) Pages: 2001-2013
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Mapping human genetic diversity in Asia (2009)
  • Author(s): HUGO Pan-Asian SNP Consortium
  • Journal Title: Science 326(5959) Pages: 1541-1545
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Developmentally dynamic changes of DNA methylation in the mouse Snurf/Snrpn gene (2009)
  • Author(s): Miyazaki K, Mapendano CK, Fuchigami Y, Kondo S, Ohta T, Kinoshita A, Tsukamoto K, Yoshiura K, Niikawa N, Kishino T
  • Journal Title: Gene 432 Pages: 97-101
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular karyotyping in 17 patients and mutation screening in 41 patients with Kabuki syndrome (2009)
  • Author(s): Kuniba H, Yoshiura K, Kondoh T, Ohashi H, Kurosawa K, Tonoki H, Nagai T, Okamoto N, Kato M, Fukushima Y, Kaname T, Naritomi K, Matsumoto T, Moriuchi H, Kishino T, Kinoshita A, Miyake N, Matsumoto N, Niikawa N
  • Journal Title: J Hum Genet 54 Pages: 304-309
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A locus for ophthalmo-acromelic syndrome mapped to 10p11.23 (2009)
  • Author(s): Hamanoue H, Megarbane A, Tohma T, Nishimura A, Mizuguchi T, Saitsu H, Sakai H, Miura S, Toda T, Miyake N, Niikawa N, Yoshiura K, Hirahara F, Matsumoto N
  • Journal Title: Am J Med Genet 149A Pages: 336-342
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Prenatal diagnosis of Costello syndrome using 3D ultrasonography amniocentesis confirmation of the rare HRAS mutation G12D (2009)
  • Author(s): Kuniba H, Pooh RK, Sasaki K, Shimokawa O, Harada N, Kondoh T, Egashira M, Moriuchi H, Yoshiura KI, Niikawa N
  • Journal Title: Am J Med Genet 149A Pages: 785-787
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A strong association of axillary osmidrosis with the wet earwax type determined by genotyping of the ABCC11 gene (2009)
  • Author(s): Nakano M, Miwa N, Hirano A, Yoshiura K, Niikawa N
  • Journal Title: BMC Genet 10 Pages: 42-44
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A ZRS duplication causes syndactyly type IV with tibial hypoplasia (2009)
  • Author(s): Wu L, Liang D, Niikawa N, Ma F, Sun M, Pan Q, Long Z, Zhou Z, Yoshiura K, Wang F, Sato D, Nishimura G, Dai H, Zhang H, Xia J
  • Journal Title: Am J Med Genet 149A Pages: 816-818
  • Peer Reviewed
• [Book] カラー図解基礎から疾患までわかる遺伝学 (2009)
  • Author(s): Eberhard Passarge(新川詔夫・吉浦孝一郎監訳)
  • Total Pages: 521
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル