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2009 Fiscal Year Annual Research Report

疾患遺伝子探索の方法論の開発

Research Project

Project/Area Number 17019063
Research InstitutionTokai University

Principal Investigator

猪子 英俊  Tokai University, 医学部, 教授 (10101932)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 間野 修平  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (20372948)
Keywords相関解析 / マイクロサテライト / 関節リウマチ / 糖尿病 / 酵母ツーハイブリッド法 / ネットワーク解析 / 蛋白相互作用
Research Abstract

急速なヒトゲノムの多型情報の蓄積により、多因子性疾患の感受性遺伝子の相関解析による同定が進みつつある。我々は、リウマチについて3万個のマイクロサテライトを用いた世界初のゲノムワイドな相関解析を進め、47個の感受性遺伝子候補領域を同定し、それらの領域より7個の感受性遺伝子を見出した。我々の本解析の検出力は50%であり、遺伝的な寄与が小さい遺伝子を含めれば、おそらく100個以上の感受性遺伝子の存在が予想される。また、発症の分子機構解明のためには、そのような多くの疾患感受性遺伝子についてそれぞれを機能解析する気の遠くなる膨大な作業を遂行しなければならない。
そこで、本年度は次の3つの研究を遂行した。
1)関節リウマチNFKBIL1のKOマウスを作成した。既に、KOマウスにおけるコラーゲン誘導性関節炎の亢進を観察しており、「NFKBIL1がリウマチの抑制因子である」とする我々の仮説と一致した結果がえられた。
2)2型糖尿病感受性遺伝子として同定したタンパクリン酸化酵素PKXX遺伝子について、その阻害剤が有効な治療薬開発に繋がる可能性が期待される。そこで、インシリコスクリーニングによって選別した低分子化合物のPKXX阻害効果を検討し、複数の有望な候補化合物を見出した。
3)糖尿病、摂食障害、尋常性乾癬等の疾患感受性遺伝子を対象として、独自に開発した酵母ツーハイブリッド(YTH)法を用いた相互因子解析を行った。得られた多数の新規YTH相互作用因子から、特徴的な機能ネットワークや、リガンド候補等を見いだした。
4)「独自YTHシステム構築」を完了し、計22遺伝子を対象として、1000余の新規YTH相互作用因子を同定した。また、これら多数のYTH相互作用因子と、既知の相互作用情報の統合により、相互作用ネットワークを抽出する手法について、その基盤を確立した。

  • Research Products

    (33 results)

All 2010 2009

All Journal Article (22 results) (of which Peer Reviewed: 22 results) Presentation (9 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] The genetic relationship among Iranian ethnic groups : an anthropological view based on HLA class II gene polymorphism.2009

    • Author(s)
      Farjadian S, Ota M, Inoko H, Ghaderi A
    • Journal Title

      Mol Biol Rep 36

      Pages: 1943-1950

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HLA-A allele associations with viral MER9-LTR nucleotide sequences at two distinct loci within the MHC alpha block.2009

    • Author(s)
      Kulski JK, Shigenari A, Shiina T, Hosomichi K, Yawata M, Inoko H
    • Journal Title

      Immunogenetics 61

      Pages: 257-270

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complex divergence at a microsatellite mazker C1_2_5 in the lineage of HLA-Cw/-B haplotype.2009

    • Author(s)
      Shichi D, Ota M, Katsuyama Y, Inoko H, Naruse TK, Kimura A
    • Journal Title

      J Hum Genet 54

      Pages: 224-229

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] PKC Delta and Epsilon in drug targeting and therapeutics.2009

    • Author(s)
      Yonezawa T, Kurata R, Kimura M, Inoko H
    • Journal Title

      Recent Patents on DNA & Gene Sequences 3

      Pages: 96-101

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Trans-species polymorphism of the Mhc class II DRB-like gene in banded penguins (genus Spheniscus).2009

    • Author(s)
      Kikkawa EF, Tsuda TT, Sumiyama D, Naruse TK, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Immunogenetics 61

      Pages: 341-352

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assessment of chromosome 19 for genetic association in severe chronic periodontitis.2009

    • Author(s)
      Tabeta K, Shimada Y, Tai H, Ishihara Y, Noguchi T, Soga Y, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      J Periodontol 80

      Pages: 663-671

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of TLR4 polymorphisms with Behcet's disease in a Korean population.2009

    • Author(s)
      Horie Y, Meguro A, Ota M, Kitaichi N, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Rheumatology 48

      Pages: 638-642

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of MICA as a Susceptibility Gene for Pulmonary Mycobacterium avium Complex Infection.2009

    • Author(s)
      Shojima J, Tanaka G, Keicho N, Tamiya G, Ando S, Oka A, et al, Inoko H.
    • Journal Title

      J Infect Dis 199

      Pages: 1707-1715

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HLA-B*15 subtypes in Burmese population by sequence-based typing.2009

    • Author(s)
      Kongmaroeng C, Romphruk A, Ruangwerayut R, Paupairoj C, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Tissue Antigens 74

      Pages: 164-167

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of PTPN22 polymorphisms and Vogt-Koyanagi-Harada disease in Japanese patients.2009

    • Author(s)
      Horie Y, Kitaichi N, Katsuyama Y, Yoshida K, Miura T, Ota M, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Mol Vis. 15

      Pages: 1115-1119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Megakaryoblastic leukemia factor-1 gene in the susceptibility to coronary artery disease.2009

    • Author(s)
      Hinohaza K, Nakajima T, Yasunami M, Houda S, Sasaoka T, Yamamoto K, Lee BS, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Hum Genet 126

      Pages: 539-547

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MHC class I A loci polymorphism and diversity in three Southeast Asian populations of cynomolgus macaque.2009

    • Author(s)
      Kita YF, Hosomichi K, Kohara S, Itoh Y, Ogasawara K, Tsuchiya H, Ioko H, et al.
    • Journal Title

      Immunogenetics 61

      Pages: 635-468

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Investigation of the association between the GLC3A locus and normal tension glaucoma in Japanese patients by microsatellite analysis.2009

    • Author(s)
      Ikamio M, Meguro A, Ota M, Nomura N, Kashiwagi K, Mabuchi F, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Clin Ophthalmol 3

      Pages: 183-188

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of microsatellite polymorphisms of the GPDS1 locus with normal tension glaucoma in the Japanese population.2009

    • Author(s)
      Nakamura K, Ota M, Meguro A, Nomura N, Kashiwagi K, Mabuchi F, et al.
    • Journal Title

      Clin Ophthalmol 3

      Pages: 307-312

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of novel candidate loci for anorexia nervosa at 1q41 and 11q22 in Japanese by a genome-wide association analysis with microsatellite markers.2009

    • Author(s)
      Nakabayashi K, Komaki G, Tajima A, Ando T, Oka A, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      J Hum Genet 54

      Pages: 531-537

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polymorphisms of NKG2D ligands : diverse iZAET1/ULBP genes in northeastern Thais.2009

    • Author(s)
      Romphruk AV, Romphruk A, Naruse TK, Inoko H, Leelayuwat C.
    • Journal Title

      Immunogenetics. 61

      Pages: Immunogenetics.61:1-617

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel system of polymorphic and diverse NK cell receptors in primates.2009

    • Author(s)
      Averdam A, Petersen B, Rosner C, Neff J, Roos C, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      PLoS Genet 5

      Pages: e1000688

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetics of Behcet's disease inside and outside the MHC.2009

    • Author(s)
      Meguro A, Inoko H, Ota M, Katsuyama Y, Oka A, Okada E, et al.
    • Journal Title

      Ann Rheum Dis 69:04:00

      Pages: 747-754

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nutritional and hormonal regulation of uncoupling protein 2.2009

    • Author(s)
      Yonezawa T, Kurata R, Hosomichi K, Kono A, Kimura M, Inoko H.
    • Journal Title

      IUBMB Life 61

      Pages: 1123-1131

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Indian Genome Variation Consortium : Mapping human genetic diversity in Asia.2009

    • Author(s)
      HUGO Pan-Asian SNP Consortium, Abdulla MA, Ahmed 1, et al.
    • Journal Title

      Science 326

      Pages: 1541-1545

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lack of association between toll-like receptor 4 gene polymorphisms and sarcoidosis-related uveitis in Japan.2009

    • Author(s)
      Asukata Y, Ota M, Meguro A, Katsuyama Y, Ishihara M, Inoko H, et al.
    • Journal Title

      Mol Vis 15

      Pages: 2673-2682

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 乾癬のマイクロサテライトによるゲノムワイド関連解析2009

    • Author(s)
      岡晃、猪子英俊
    • Journal Title

      実験医学(患いでんしの探索と超高速シークエンス増刊号) 27

      Pages: 80-85

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Target transgenesis through pronuclear injection.2009

    • Author(s)
      大塚正人、三浦浩美、荻原早苗、木村穣、猪子英俊
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Validation of artificial miRNA expression vectors for generation of knockdown mice.2009

    • Author(s)
      三浦浩美、猪子英俊、木村穣、大塚正人
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] HLA領域の遺伝子構造解析と疾患関連解析2009

    • Author(s)
      猪子英俊、細道一善、椎名隆、井ノ上逸朗
    • Organizer
      第18回日本組織適合性学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090925-20090927
  • [Presentation] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発2009

    • Author(s)
      細道一善、猪子英俊、河田寿子、井ノ上逸朗、椎名隆
    • Organizer
      第18回日本組織適合性学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090925-20090927
  • [Presentation] プラスチック基板上での等温増幅反応によるHLAタイピング2009

    • Author(s)
      奥平裕子、光永滋樹、山口香織、吉川枝里、岡晃、猪子英俊
    • Organizer
      第18回日本組織適合性学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090925-20090927
  • [Presentation] HLA多型の魅カー疾患解析のモデル領域2009

    • Author(s)
      猪子英俊
    • Organizer
      第54回日本人類遺伝学会招待講演
    • Place of Presentation
      高輪
    • Year and Date
      20090923-20090926
  • [Presentation] MHC研究の歴史~過去、現在そして未来2009

    • Author(s)
      猪子英俊
    • Organizer
      第7回最先端遺伝育種セミナー講演
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      20090910-20090912
  • [Presentation] 予防医学におけるHLAと疾患発症機構の因果関係2009

    • Author(s)
      猪子英俊
    • Organizer
      第42回中国四国医学検査学会
    • Place of Presentation
      高松
    • Year and Date
      2009-10-31
  • [Presentation] Identification of NFKBIL 1 as a susceptible locus of rheumatoid arthritis by genome- wide association using microsatellites and its functional analysis in steoclastogenesis.2009

    • Author(s)
      Inoko H
    • Organizer
      Simposium "Pathogenesis and epidemiology of lntgraocular inflammation" The 10th Congress of International Ocular lnflammation Society
    • Place of Presentation
      チェコ(プラハ)
    • Year and Date
      2009-06-02
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 抗菌剤2010

    • Inventor(s)
      猪子英俊、良原栄策、光永滋樹
    • Industrial Property Rights Holder
      東海大学
    • Industrial Property Number
      2010-041850
    • Filing Date
      2010-02-26
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 抗グラム陰性菌剤2009

    • Inventor(s)
      猪子英俊、良原栄策、光永滋樹
    • Industrial Property Rights Holder
      東海大学
    • Industrial Property Number
      2009-143600
    • Filing Date
      2009-06-16

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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