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2009 Fiscal Year Annual Research Report

SNP解析支援体制の確立と疾患関連遺伝子の同定

Research Project

Project/Area Number 17020003
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

徳永 勝士  The University of Tokyo, 大学院・医学系研究科, 教授 (40163977)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大橋 順  筑波大学, 大学院・人間総合科学研究科, 准教授 (80301141)
宮寺 浩子  東京大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (40361464)
本多 真  財団法人 東京都医学研究機構, 東京都精神医学総合研究所, 副参与研究員(研究職) (50370979)
慶長 直人  国立国際医療センター研究所, 呼吸器疾患研究部, 部長(研究職) (80332386)
KeywordsSNP(単一塩基多型) / 疾患関連遺伝子 / ゲノムワイド関連分析 / パニック障害 / アルツハイマー病 / 2型糖尿病 / ナルコレプシー / 結核
Research Abstract

本研究は、疾患グループを大規模なSNP解析によって支援する研究と、研究代表者らが独自に進める個別研究からなる。
SNP解析支援:パニック障害について、900K SNP arrayを用いた大規模なゲノムワイド関連解析(GWAS)タイピングを実施した。アルツハイマー病についても大規模なGWASタイピングの一部を分担、遂行した。また、IgA腎症のゲノムワイド連鎖分析のためのSNPタイピングを終了した。2型糖尿病については、連鎖分析から検出された候補領域において、非肥満糖尿病患者に関連する新規感受性遺伝子を見出し、マウスを用いた機能解析を行った。さらに、本研究によって整備された設備を利用して、C型肝炎のインターフェロンα/リバビリン療法への応答性に強く関連する遺伝子IL28Bを特定した。
個別的研究:ナルコレプシーに関しては、国際共同GWASによってTCRA(T細胞リセプターα)を新たな感受性遺伝子として同定した。また前年度に見出した新規感受性遺伝子CPT1Bは脂肪酸β酸化の律速酵素で、ナルコレプシー患者では血中アシルカルニチンが異常低値を示す場合が多いことを見出した。マラリアに関しては、マラリア抗原と結合して感染赤血球の凝集を起こすCR1遺伝子のプロモーター多型が脳性マラリア抵抗性と関連し、赤血球表面上のCR1分子の発現量にも影響を与えることを見出した。結核に関しては、ゲノムワイド連鎖分析によって5番染色体と感受性の連鎖が示唆され、さらに若年発症同胞対では17番および20番染色体と感受性の連鎖を検出した。また、SLC11A1と結核の関連に集団差が報告された背景として、アジア系集団とヨーロッパ系集団は異なるハプロタイプ構造を持つことを明らかにし、ハプロタイプ特異的な遺伝子発現の定量系を構築した。

  • Research Products

    (14 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Polymorphism located in TCRA locus confers susceptibility to essential hypersomnia with HLA-DRB1*1501-DQB1*0602 haplotype2010

    • Author(s)
      Miyagawa T, Honda M, et al.
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics 55

      Pages: 63-65

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of KCNJ15 as a susceptibility gene in Asian patients with type 2 diabetes mellitus2010

    • Author(s)
      Okamoto K, Iwasaki N, et al.
    • Journal Title

      American Journal of Human Genetics 86

      Pages: 54-64

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] IGFBP3 colocalizes with and regulates hypocretin(orexin)2009

    • Author(s)
      Honda M, Eriksson K, et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE 4

      Pages: e4254(電子ジャーナル)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polymorphism located between CPT1B and CHKB, and HLA-DRB1*1501-DQB1*0602haplotype independently confer susceptibility to CNS hypersomnias(Essential Hyhpersomnia)2009

    • Author(s)
      Miyagawa T, Honda M, et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE 4

      Pages: e5394(電子ジャーナル)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Association of HLA-class II alleles with SARS in the Vietnamese population2009

    • Author(s)
      Keicho N, Itoyama S, et al.
    • Journal Title

      Human Immunology 70

      Pages: 527-531

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prevalence and risk factors for tuberculosis infection among hospital workers in Hanoi, Viet Nam2009

    • Author(s)
      Lien LT, Hang NTL, et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE 4

      Pages: e6798(電子ジャーナル)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study of panic disorder in the Japanese population2009

    • Author(s)
      Otowa T, Yoshida E, et al.
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics 54

      Pages: 122-126

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of a prediction model for type 2 diabetes mellitus in the Japanese population based on eleven genes with strong evidence of the association2009

    • Author(s)
      Miyake K, Yang W, et al.
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics 54

      Pages: 236-241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Narcolepsy is strongly associated with the TCR alpha locus2009

    • Author(s)
      Hallmayer J, Faraco J, et al.
    • Journal Title

      Nature Genetics 41

      Pages: 708-711

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C2009

    • Author(s)
      Tanaka Y, Nishida N, et al.
    • Journal Title

      Nature Genetics 41

      Pages: 1105-1109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping Human Genetic Diversity in Asia2009

    • Author(s)
      Abdulla MA, Ahmed I, et al.
    • Journal Title

      Science 326

      Pages: 1541-1545

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 疾患のゲノムワイド関連分析(GWAS)とHLA2009

    • Author(s)
      徳永勝士
    • Organizer
      日本組織適合性学会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2009-09-27
  • [Presentation] ナルコレプシーのゲノムワイド関連解析:発症機序の解明を目指して2009

    • Author(s)
      徳永勝士、宮川卓, ほか
    • Organizer
      日本人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル高輪
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.genome-sci.jp/

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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