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2007 Fiscal Year Annual Research Report

創発性を示す人工細胞モデル系の構築

Research Project

Project/Area Number 17076007
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

吉川 研一  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 教授 (80110823)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 瀬戸 秀紀  京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (60216546)
北畑 裕之  京都大学, 大学院・理学研究科, 助教 (20378532)
Keywordsリポソーム / 人工細胞モデル / その場観察 / DNA折り畳み転移 / 自己組織化 / ナノ構造制御 / ミクロ液滴 / レーザーピンセット
Research Abstract

本特定領域研究では、非平衡開放条件の下、自発的に時間発展するモデル人工細胞系の構築を最大の目的としている。そのために、試験管内における細胞機能複合体の再構築、およびそのイメージング・ハンドリング・物理化学的測定を可能にする系の確立などの基盤的研究も並行させて行う。具体的には,ナノからセンチメータ・スケールの階層的操作技術を活用することによる「試験管内における染色体再構成」、「DNA高次構造変化に伴う転写・翻訳活性の制御」、「モデル細胞系を使った核酸及びタンパク質のダイナミクス」の研究を進めている。
前年度に我々は油中水滴中でのアクチン重合反応の実施など、油中水滴を用いたモデル細胞系の研究成果を挙げている。本年度はそれら成果をさらに進展させ、油中水滴のマニピュレーション手法の確立や人工細胞モデル系としての有用性の証明を行うことができた。具体的な成果の一部を以下に示す。
(1) レーザーピンセットで1つの油中水滴をトラップして他油中水滴に衝突させて、油中水滴同士を融合させるマニピュレーション手法を確立したと共に、油中水滴における膜融合の容易さを証明した。
(2) 上記マニピュレーション手法を用いて「鋳型DNAを封入した油中水滴」と「無細胞転写・発現系を封入した油中水滴」とを融合させてタンパク発現を行うことに成功した。また、「カルセインを含む油中水滴」と「エステラーゼを含む油中水滴」との融合により酵素反応を進行させられることをも証明した。これらの結果は、本マニピュレーション手法を用いることで、in vitro生体反応の反応開始点を制御でき、また油中水滴中でスムーズにin vitro生体反応を進行させられることを示している。

  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] In situ analysis of the higher-order genome structure in a single Escherichia coli cell2008

    • Author(s)
      E. Shindo, K. Kubo, R. L. Ohniwa, K. Takeyasu and K. Yoshikawa
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 133

      Pages: 172-176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tilt control in optical tweezer2008

    • Author(s)
      M. Ichikawa, K. Kubo, K. Yoshikawa, and Y. Kimura
    • Journal Title

      Journal of Biomedical Optics Letters 13

      Pages: 0388011-3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pleiotrophic Functions of Epstein-Barr Virus Nuclear Antigen-1 (EBNA-1) and oriP Differentially Contribute to the Efficacy of Transfection/expression of Exogenous Gene in Mammalian Cells2008

    • Author(s)
      T. Kishida, H. Asada, K. Kubo, Y. Sato, M. Shin-Ya, J. Imanishi, K. Yoshikawa & O. Mazda
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 133

      Pages: 201-207

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Large-scale on-off switching of genetic activity mediated by the folding-unfolding transition in a giant DNA molecule: An hypothesis2008

    • Author(s)
      Y. Takenaka, H. Nagahara, H. Kitahata, and K. Yoshikawa
    • Journal Title

      Physical Review E 77

      Pages: 0319051-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Topoisomerase II, a scaffold component, promotes chromatin-compaction in vitro in a linker-histone H1-dependent manner2007

    • Author(s)
      K. Hizume, S. Araki, K. Yoshikawa and K. Takeyasu
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 35

      Pages: 2787-2799

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plastic bottle oscillator: Rhythmicity and mode bifurcation of fluid flow2007

    • Author(s)
      M. I. Kohira, N. Magome, H. Kitahata, and K. Yoshikawa
    • Journal Title

      American Journal of Physics 75

      Pages: 893-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Manipulation of Cell-Sized Phospholipid-Coated Microdroplets and Their Use as Biochemical Microreactors2007

    • Author(s)
      M. Hase, A. Yamada, T. Hamada, D. Baiel, and K. Yoshikawa
    • Journal Title

      Langmuir 23

      Pages: 348-352

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 半屈曲鎖の凝縮転移:contour length依存性2008

    • Author(s)
      樋口祐次
    • Organizer
      第63回日本物理学会年次大会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-25
  • [Presentation] 油水相間移行に伴って生成するリン脂質小胞のキャラクタリゼーション2008

    • Author(s)
      山中透
    • Organizer
      第63回日本物理学会年次大会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-25
  • [Presentation] DNAの階層的折りたたみ2008

    • Author(s)
      荒木須美子
    • Organizer
      特定領域「バイオ操作」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      法政大学市ケ谷キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-07
  • [Presentation] 生命科学と物理科学のキャッチボール:情報・運動・制御の視点からCross-Talk between Life Science and Physical Science: DNA, Motor, Computation, etc.2007

    • Author(s)
      吉川研一
    • Organizer
      分子生物学会・生化学学会合同大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • Year and Date
      2007-12-11
  • [Presentation] Self-emergence of Spatio-temporal Structure and Dyncamic Function2007

    • Author(s)
      Kenichi Yoshikawa
    • Organizer
      2nd International Workshop on Natural Computing (IWNC)
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依記念学術交流館
    • Year and Date
      2007-12-10
  • [Presentation] Cationic Silica Nanoparticles are Efficiently Transferred into Mammalian Cells2007

    • Author(s)
      L. Liu, S. Inagaki, K. Yoshikawa, Kyoto University, Japan, T. Takenaka, A. A. Zinchenko, N. Chen, H. Asada, T. Kishida, O. Mazda and S. Murata
    • Organizer
      MHS2007 & Micro-Nano COE
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依記念学術交流間
    • Year and Date
      2007-11-12
  • [Presentation] Modeling of Living Cell: Autonomous Motion, Micro-Reactor and Response to the Environment2007

    • Author(s)
      Kenichi Yoshikawa
    • Organizer
      2007 IEEE/RSJ International Conference on Intelligent Robots and Systems
    • Place of Presentation
      Sheraton Hotel, San Diego, CA, USA
    • Year and Date
      2007-10-31
  • [Presentation] ゲル状相生成に伴う油滴のbleb形成2007

    • Author(s)
      住野豊
    • Organizer
      第62回日本物理学会年次大会
    • Place of Presentation
      北海道大学札幌キャンパス
    • Year and Date
      2007-09-24
  • [Presentation] 動的細胞機能の時空間モデリング2007

    • Author(s)
      吉川研一
    • Organizer
      (社)日本機械学会 創立110周年記念 2007年度年次大会 Mechanical Engineering Congress, 2007 Japan (MECJ-07)
    • Place of Presentation
      関西大学千里丘キャンパス
    • Year and Date
      2007-09-10
  • [Presentation] Lamellar-Laraellar Phase Separation in Phospholipid/Salt/Water system2007

    • Author(s)
      Mafumi Hishida
    • Organizer
      YITP Soft Matter 2007
    • Place of Presentation
      京都大学基礎物理学研究所
    • Year and Date
      2007-07-29
  • [Presentation] Novel Hypothesis on the Self-Regulation of Genetic Information: Scenario from One-Dimensional DNA into Spatio-Temporal Order2007

    • Author(s)
      Kenichi Yoshikawa
    • Organizer
      The International Workshop on Complex Systems and Networks 2007
    • Place of Presentation
      Guilin Bravo Hotel、桂林、中国
    • Year and Date
      2007-07-19

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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