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2008 Fiscal Year Annual Research Report

染色体複製開始タンパク質の機能制御因子とその作動メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 17080005
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

片山 勉  Kyushu University, 大学院・薬学研究院, 教授 (70264059)

KeywordsDNA複製 / DnaA / 複製開始 / タンパク質高次復合体 / DARS / 試験管内再構成系 / DiaA / ヘリカーゼ
Research Abstract

本計画研究では、精製タンパク質によるミニ染色体複製再構成系などの高度解析基盤をもつ大腸菌を対象として、複製開始に関わる制御システムの分子機構とネットワークを明らかにする。本年度は以下のような成果を得た。
新規DnaA結合因子DiaAが、複製起点上でのATP-DnaAの共同結合と多量体形成とを促進することとそのメカニズムを解明したこと(Genes & Development, 2007)に基づき、さらに、DnaA上のDiaA結合部位をアミノ酸レベルで同定することにも成功した(論文投稿中)。この部位は、DnaBヘリカーゼの相互作用部位としても重要であることが新たにわかった。これらの成果により開始複合体の動態変化のメカニズムの解明が進んだ。また、過剰開始を抑制するHdaの活性制御にADP結合が必要であった。ADPがHdaのホモ多量体解離に必要であることをまとめ論文発表した(Journal of Biological Chelnistry)。Hda遺伝子の新規な低温感受性変異株を構築し、抑制変異を分離解析した結果、過剰複製による細胞異常に応答する遺伝子群が同定され、新たな遺伝子制御系の存在が示唆された(Joumal of Bacteriology)。また、独自に見出したADP-DnaA再活性化因子が染色体上の特定DNA配列であり、DARS(DnaA Reactivating Sequence)と命名した。さらに、DARSが細胞周期特異的な複製開始反応に必須であることを証明した。この論文はGenes & Development誌に採択され、現在、印刷中である。並行して、DARS機能を促進するタンパク質画分の精製を進め、候補因子を数種同定した。加えて、DiaAの細胞内局在性解析と新規クランプ結合因子の機能解明のため、本領域第3班の仁木博士と共同研究を進め、DiaAと複製起点との同時観察できる系の構築に成功した(論文準備中)。

  • Research Products

    (37 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (30 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Specific genomic sequences of E. coli promote replicational initiation by directly reactivating ADP-DnaA2009

    • Author(s)
      Fujimitsu, Kほか
    • Journal Title

      Genes & Development 23(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of Hda activity stimulates replication initiation from I-box, but not R4 mutant origins in Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Riber, L. ほか
    • Journal Title

      Molecular Microbiogy 71

      Pages: 107-122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles for the AAA+ motifs of DnaA in the initiation of DNA replication2008

    • Author(s)
      Katayama. T.
    • Journal Title

      Biochem. Soc. Trans 36

      Pages: 78-82

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A common mechanism for the ATP-DnaA-dependent formation of open complexes at the replication origin2008

    • Author(s)
      Ozaki, S. ほか
    • Journal Title

      IJ. Biol. Chem 283

      Pages: 8351-8362

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hda monomerization by ADP binding promotes replicase clamp-mediated DnaA-ATP hydrolysis2008

    • Author(s)
      Su'etsugu, M. ほか
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 283

      Pages: 36118-36131

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modes of over-initiation, dnaA gene expression and the inhibition of cell division in a novel cold-sensitive hda mutant in Escherichia coli2008

    • Author(s)
      Fujimitsu, K., ほか
    • Journal Title

      J. Bacteriol 190

      Pages: 5368-5381

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 複製開始反応を適時的に制御するDiaA-DnaA相互作用機構の解析2009

    • Author(s)
      毛谷村賢司. ほか
    • Organizer
      遺伝研研究会「単細胞における複合システム系の連帯と統合」
    • Place of Presentation
      三島
    • Year and Date
      20090323-24
  • [Presentation] Functional regulation of Hda, a replicase clamp-binding protein that promotes the regulatory inactivation of DnaA in E. col2008

    • Author(s)
      Suletsugu, M, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] ADP型DnaAからめADP解離およびATP再結合を促す特異的DNA配列の促進因子のin vitro探索2008

    • Author(s)
      大山祐樹, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本隼化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 大腸菌の複製開始複合体形成を促進するDnaA結合因子DiaAの細胞内局在性の解析2008

    • Author(s)
      篠崎沙織, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 大腸菌DNAヘリカーゼ装着因子DnaCの変異体解析2008

    • Author(s)
      山野裕介, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 大腸菌hda低温感受性変異株からの多コピー抑圧遺伝子の探索2008

    • Author(s)
      藍原竜夫, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 複製クランプに依存する制御的DnaA不活性化機構におけるDIlaA-Hda間相互作用メカニズムの解析2008

    • Author(s)
      中村賢太, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 大腸菌の染色体分配におけるRisAのβクランプ結合の役割の解析2008

    • Author(s)
      付尼斯, ほか
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Multiple copies of the ribonucleotide reductase genes repress overinitiation of chromosomal replication caused by a novel cold-sensitive hda mutant in Escherichia coli2008

    • Author(s)
      Fujimitsu, K. ほか
    • Organizer
      6th 3R (Replication, Recombination, Repair) Symposium
    • Place of Presentation
      Kakegawa, Japan
    • Year and Date
      20081027-30
  • [Presentation] A common role of the DUE binding activity of DnaA for the initiation of chromosomal replication2008

    • Author(s)
      Ozaki, S. ほか
    • Organizer
      6th 3R (Replication, Recombination, Repair) Symposium
    • Place of Presentation
      Kakegawa, Japan
    • Year and Date
      20081027-30
  • [Presentation] Mechanism and Regulation for ATP-DnaA Assembly and Duplex DNA Unwinding on the E. coli Chromosomal Origin oriC2008

    • Author(s)
      Katayama, T.
    • Organizer
      6th 3R (Replication, Recombination, Repair) Symposium
    • Place of Presentation
      Kakegawa, Japan
    • Year and Date
      20081027-20081030
  • [Presentation] Brief Introduction to Reconstituted systems of the E. coli Minichromosomal Replication and the Regulation of Replicational Initiation2008

    • Author(s)
      Katayama, T. ほか
    • Organizer
      The 1st Annual Meeting of the Japanese Society for Cell Synthesis Research
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20081016-17
  • [Presentation] Mechanisms of ATP-DnaA Assembly and Duplex DNA Unwinding for the Initiation of DNA Replication in Reconstituted Systems2008

    • Author(s)
      Katayama, T.
    • Organizer
      The 17th RIKEN CDB Meeting "Towards Synthesis of Cells"
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      20081014-20081015
  • [Presentation] 1回性複製の制御に必要なHdaタンパク質の機能解析2008

    • Author(s)
      片山勉, ほか
    • Organizer
      2008年度「染色体サイクル」領域会議
    • Place of Presentation
      御殿場
    • Year and Date
      20080924-26
  • [Presentation] DnaAによる2重鎖開裂における複製起点の最小機能構造2008

    • Author(s)
      尾崎省吾, ほか
    • Organizer
      第80回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20080903-05
  • [Presentation] 大腸菌染色体の複製開始促進因子DiaAの細胞内局在性解析2008

    • Author(s)
      篠崎沙織, ほか
    • Organizer
      第80回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20080903-05
  • [Presentation] 大腸菌における複製開始不活性化機構におけるタンパク質問相互作用2008

    • Author(s)
      中村賢太
    • Organizer
      九州大学P&P「DNA複製研究の次世代育成プログラム」研究合宿
    • Place of Presentation
      九重
    • Year and Date
      20080731-0801
  • [Presentation] ADP型DnaAを再活性化する特異的DNA配列の促進因子のin vitro探索2008

    • Author(s)
      大山祐樹
    • Organizer
      九州大学P&P「DNA複製研究の次世代育成プログラム」研究合宿
    • Place of Presentation
      九重
    • Year and Date
      20080731-0801
  • [Presentation] 大腸菌の複製開始を促進する因子DiaAの細胞内局在性解析2008

    • Author(s)
      篠崎沙織
    • Organizer
      九州大学P&P「DNA複製研究の次世代育成プログラム」研究合宿
    • Place of Presentation
      九重
    • Year and Date
      20080731-0801
  • [Presentation] 大腸菌DNAヘリカーゼ装着因子DnaCの変異体解析2008

    • Author(s)
      山野裕介
    • Organizer
      九州大学P&P「DNA複製研究の次世代育成プログラム」研究合宿
    • Place of Presentation
      九重
    • Year and Date
      20080731-0801
  • [Presentation] Hda相互作用因子の探索2008

    • Author(s)
      平井麻美
    • Organizer
      九州大学P&P「DNA複製研究の次世代育成プログラム」研究合宿
    • Place of Presentation
      九重
    • Year and Date
      20080731-0801
  • [Presentation] 大腸菌DNAヘリカーゼ装着因子DnaCにおける高度保存性アミノ酸残基の機能解析2008

    • Author(s)
      山野裕介, ほか
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      藤枝
    • Year and Date
      20080728-29
  • [Presentation] ATP型DnaA間相互作用に関与するアミノ酸残基の同定2008

    • Author(s)
      林靖久, ほか
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      藤枝
    • Year and Date
      20080728-29
  • [Presentation] Analysis on Mechanisms of ATP-DnaA Assembly on oriC and Duplex Unwinding2008

    • Author(s)
      Katayama, T., Ozaki, S., Keyamura, K., Kawakami, H., Fujikawa, N., Kagawa, W., Nakamura, K., Fujimitsu, K., Su'etsugu, M., Yokoyama, S., Kurumizaka, H.
    • Organizer
      EMBO Workshop on Replication & Segregation of Chromosomes
    • Place of Presentation
      Geilo, Norway
    • Year and Date
      20080616-20080620
  • [Presentation] DiaA promotes the unwinding of oriC by directly stimulating the formation of ATP-DnaA-oriC complexes in E. coli.2008

    • Author(s)
      Keyamura, K. ほか
    • Organizer
      EMBO Workshop on Replication & Segregation of Chromosomes
    • Place of Presentation
      Geilo, Norway
    • Year and Date
      20080616-20
  • [Presentation] Specific E. coli chromosomal regions can reactivate replication initiation activity of DnaA by exchanging bound nucleotide from ADP to ATP in vitro2008

    • Author(s)
      Fujimitsu, K. ほか
    • Organizer
      EMBO Workshop on Replication & Segregation of Chromosomes
    • Place of Presentation
      Geilo, Norway
    • Year and Date
      20080616-20
  • [Presentation] 新規因子DiaA蛋白質を含む, 複製開始複合体の構造とメカニズム2008

    • Author(s)
      片山勉, ほか
    • Organizer
      第8回蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      20080610-12
  • [Presentation] 構造生物学的アプローチによる大腸菌複製開始因子DnaAの機能解析2008

    • Author(s)
      阿部義人, ほか
    • Organizer
      日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20080517-18
  • [Presentation] 大腸菌染染色体DNA複製のイニシエーターDnaAの構造と機能2008

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      福岡歯科大学シンポジウム---環境とゲノムをつなぐ細胞機能
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2008-12-08
  • [Presentation] Mechanism and Regulation for the Initiation of Chromosomal DNA Replication in Escherichia coil : ATP-DnaA assembly and duplex unwinding2008

    • Author(s)
      Katayama, T. ほか
    • Organizer
      PUSAN-KYUSHU JOINT SYMPOSIUM
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      2008-11-28
  • [Remarks]

    • URL

      http://210.233.60.66/~bunsei/

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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