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2009 Fiscal Year Annual Research Report

染色体複製開始タンパク質の機能制御因子とその作動メカニズムの解析

Research Project

Project/Area Number 17080005
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

片山 勉  Kyushu University, 大学院・薬学研究院, 教授 (70264059)

KeywordsDNA複製 / DnaA / 複製開始 / タンパク質高次複合体 / DARS / 試験管内再構成系 / DiaA / ヘリカーゼ
Research Abstract

本研究計画では、大腸菌の複製開始タンパク質DnaAの機能制御メカニズムを解析した。大腸菌細胞内では、通常、不活性型のADP-DnaAが活性型のATP-DnaAより高濃度で存在する。複製開始前特異的にATP-DnaA濃度が上昇し、ADP-DnaA濃度を超える(過去に発表済み、EMBO J.,1999)。本研究で初めて、ゲノム上のDNA因子がDnaAのヌクレオチド交換を進め、ADP-DnaAをATP-DnaAに変換することが解明された(Genes Dev.,2009)。このDNA因子をDARSと命名した。DARS上では複数のDnaAが特異的な多量体を形成する。このときDnaAの構造が変化しヌクレオチド交換が進むと思われる。DARS制御因子の存在も明らかになった。
ATP-DnaA分子は複製起点上で多量体となり、複製開始複合体を形成する。この複合体には、新規因子DiaAが含まれる(Genes Dev.,2007)。本年度は、DnaA-DiaA相互作用機構およびDnaA-DnaBヘリカーゼ相互作用機構を詳細に解明し、複製開始複合体の構造と動態を説明する新たなモデルを提出した。さらに、DnaAからDiaAを解離させる新たな制御因子の存在も明らかになった(JBC,2009)。DiaA解離は、複製開始反応後のヘリカーゼ装着に必要と思われる。
複製開始後、DNAポリメラーゼIIIホロ酵素によりDNA合成が進められる。この過程でDNA上に装着されたクランプ因子とHdaタンパク質により、DnaA-ATP加水分解が進められ、ADP-DnaA濃度が高まる。この制御系は過剰開始抑制に必須であり、過去にRIDAと命名した(Ce11,1998;EMBO J.,2001)。本研究では、Hda-Dna相互作用のメカニズムを詳細に解明した(Mol.Microbiol.,2010)。

  • Research Products

    (33 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (24 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Regulation of the replication cycle : Conserved and diverse regulatory systems for DnaA and oriC2010

    • Author(s)
      Katayama, T., ほか
    • Journal Title

      Nature Rev.Microbiol. 8

      Pages: 163-170

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DnaA, ORC, and Cdc6 : Similarity beyond the domains of life and diversity2010

    • Author(s)
      Kawakami, H., ほか
    • Journal Title

      Biochem.Cell Biol. 88

      Pages: 49-62

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel essential residues of Hda for interaction with DnaA in the regulatory inactivation of DnaA : Unique roles for Hda AAA+ Box VI and VII motifs2010

    • Author(s)
      Nakamura, K., ほか
    • Journal Title

      Mol.Microbiol 76

      Pages: 302-317

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DnaA structure, function, and dynamics in the initiation at the chromosomal Origin2010

    • Author(s)
      Ozaki, S., ほか
    • Journal Title

      Plasmid 62

      Pages: 71-82

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific genomic sequences of E. coli promote replicational initiation by directly reactivating ADP-DnaA2009

    • Author(s)
      Fujimitsu, K, ほか
    • Journal Title

      Genes Dev. 23

      Pages: 1221-1233

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DiaA dynamics are coupled with changes in initial origin complexes leading tohelicase loading2009

    • Author(s)
      Keyamura, K, ほか
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 284

      Pages: 25038-25050

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of Hda activity stimulates replication initiation from I-box, but not R4 mutant origins in Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Riber, L., ほか
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 71

      Pages: 107-122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 大腸菌の染色体複製開始制御機構2009

    • Author(s)
      片山勉
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 54

      Pages: 343-349

  • [Presentation] 染色体複製開始タンパク質の機能制御因子とその作動メカニズムの解析:まとめと展望2010

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      特定領域「染色体サイクル」最終領域会議
    • Place of Presentation
      霧島
    • Year and Date
      20100301-20100303
  • [Presentation] 大腸菌染色体の複製開始を制御する新たな基本分子機構2009

    • Author(s)
      片山勉, ほか
    • Organizer
      第1回P&P合同公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] 染色体複製開始点で形成される超高次DnaA複合体による2重鎖DNA開裂のメカニズム2009

    • Author(s)
      尾崎省吾, ほか
    • Organizer
      第1回P&P合同公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] 大腸菌のDnaA結合因子DiaAにより形成された複製開始複合体へのDnaBヘリカーゼ装着メカニズムの解析2009

    • Author(s)
      毛谷村賢司, ほか
    • Organizer
      第1回P&P合同公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] 片山勉,DnaAを再活性化する染色体領域とその活性化因子の探索2009

    • Author(s)
      藤光和之, ほか
    • Organizer
      第1回P&P合同公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      20091222-20091223
  • [Presentation] Novel fundamental mechanism regulating the replicational initiation in E.coli2009

    • Author(s)
      Katayama, T., et al.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会ワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] 開始複合体の活性化に必要なATP-DnaA特異的DnaA間相互作用の解析2009

    • Author(s)
      林靖久, ほか
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Hda相互作用因子の探索とその機能解析2009

    • Author(s)
      平井麻美, ほか
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] CysB protein binds specifically to DARS2, a genomic sequence of E.coli that promotes replicational initiation by directly reactivating ADP-DnaA2009

    • Author(s)
      Asmaa, B.M.A., et al.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] DnaA再活性化因子DARS2を抑制する因子の探索2009

    • Author(s)
      加生和寿, ほか
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] DARS : the chromosomal locus for reactivation of the replication initiator DnaAin E.coli2009

    • Author(s)
      Fujimitsu, K., et al.
    • Organizer
      International Symposium on Chromosomal Cycie and Genome Dynamics
    • Place of Presentation
      Nasu, Tochigi
    • Year and Date
      20091110-20091112
  • [Presentation] DnaAと複製クランプに依存したDnaA不活性化因子Hdaの活性制御2009

    • Author(s)
      中村賢太、末次正幸、片山勉
    • Organizer
      第20回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Place of Presentation
      彦根市
    • Year and Date
      20091101-20091103
  • [Presentation] DnaAによる2本鎖開裂を制御するための複製開始点の新規機能構造特性2009

    • Author(s)
      尾崎省吾, ほか
    • Organizer
      第20回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • Place of Presentation
      彦根市
    • Year and Date
      20091101-20091103
  • [Presentation] Functional mechanism and regulation for the E.coli chromosomal replication initiator DnaA2009

    • Author(s)
      Katayama, T.(招待)
    • Organizer
      12th Asia-Pacific International Molecular Biology Network Conference
    • Place of Presentation
      Penang, Malaysia
    • Year and Date
      20091027-20091028
  • [Presentation] 大腸菌染色体複製イニシエーターDnaAは特異的なDNA配列上で高次複合体を形成し活性化される2009

    • Author(s)
      藤光和之, ほか
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 複製開始点の2本鎖開裂を制御するDnaA複合体の最小機能構造2009

    • Author(s)
      尾崎省吾, ほか
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] ATP結合型DnaAと複製クランプによるDnaA不活性化因子Hdaの活性制御2009

    • Author(s)
      中村賢太, ほか
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 大腸菌の複製開始複合体形成におけるDiaA-DnaA相互作用メカニズムの解析2009

    • Author(s)
      毛谷村賢司、東雅裕、片山勉
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] 大腸菌の複製開始因子DnaAの構造、機能、および制御2009

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      信州大学
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] DARS:大腸菌DnaAを活性化する新規染色体DNA因子2009

    • Author(s)
      片山勉
    • Organizer
      特定領域「染色体サイクル」第5回領域会議
    • Place of Presentation
      伊豆市
    • Year and Date
      20090615-20090617
  • [Presentation] The replication initiator DnaA is reactivated in a specific nucleoprotein complex2009

    • Author(s)
      Fujimitsu, K., et al.(招待)
    • Organizer
      8th International Conference on AAA Protein
    • Place of Presentation
      Tronto,Canada
    • Year and Date
      20090612-20090616
  • [Presentation] AAA+ domain-specific interaction of Hda with DnaA in the replicaseclamp-mediated DnaA-ATP hydrolysis2009

    • Author(s)
      Nakamura, K., et al
    • Organizer
      8th International Conference on AAA Protein
    • Place of Presentation
      Tronto, Canada
    • Year and Date
      20090612-20090616
  • [Presentation] DnaA再活性化因子DARS2に対するマルチコピーサプレッサーの分離2009

    • Author(s)
      加生和寿, ほか
    • Organizer
      第6回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熱海市
    • Year and Date
      20090611-20090612
  • [Presentation] DNA分配に関与する新規因子RisAに相互作用する因子の探索2009

    • Author(s)
      永田小桃, ほか
    • Organizer
      第6回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熱海市
    • Year and Date
      20090611-20090612
  • [Remarks]

    • URL

      http://210.233.60.66/~bunsei/

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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