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2007 Fiscal Year Annual Research Report

複製フォーク複合体の構築、維持、変換の研究

Research Project

Project/Area Number 17080006
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

釣本 敏樹  Kyushu University, 理学研究院, 教授 (30163885)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石野 良純  九州大学, 農学研究院, 教授 (30346837)
Keywords複製フオーク / 複製装置 / DNA 損傷 / 染色体 / クランプ / ATPase
Research Abstract

複製フォーク複合体を染色体サイクルでの複製と染色体恒常性維持との共役点としてとらえ、ヒトおよび古細菌の複製因子PCNAを中心とする機能的複製フオーク複合体の構築原理の解明を進め、次の研究成果を得た。
1. Ctf18複合体によって特異的に促進されるDNAポリメラーゼとしてヒトPol etaを同定した。さらに、pol etaはCtf18-RFCだけでなくRFC複合体とも物理的に相互作用する事を明らかにした。このことからクラプだけでなくローダーP複合体もDNAポリメラーゼの機能制御因子である事を示した。
2. 複数のローダー相互作用困子の網羅的解析をしたところ、RFC複和体、Ctf18複合体およびチェックポイント因子Rad17複合体がいくつかの複製因子と共通の相互作用を持つ事を明らかにした。つまりローダー複合体はいくつもの複製因子の機能制御に関わる中心的因子であることを示唆している。
3. チェックポイントクランプRad9-Hus1-Rad1複合体のRad9タンパク質のC末端がCKIIキナーゼにより特異的にリン酸化され、その変異がDNA損傷応答に重要であることを明らかにした(釣本)。
4. 古細菌DNAリガーゼ全分子の結晶構造を解明し、DNAリガーゼ活性がPCNAによって促進されること、両蛋白質間の新しい相互作用様式があることを発見した。またこのDNAリガーゼが岡崎フラグメントを連結する過程の複合体の電子顕微鏡による単粒子解析を行った(石野)。
5. 古細菌の修復系因子Hef蛋白質のヒトオルソログでファゴニ貧血症の原因遺伝子(FANGM)であるヒトHef(hHef)の発現系を構築しその機能解析を行った。またHef以外にもフォーク構造特異的なヘリカーゼを古細菌から発見し、Hjmと名付けて、その性質解析を行った(石野)。

  • Research Products

    (45 results)

All 2008 2007

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (31 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] DNA damage induced ubiquitylation of RFC2 subunit of RFC complex.2008

    • Author(s)
      Tomida, J., et. al.
    • Journal Title

      J Biol Chem (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recognition of forked and single-stranded DNA structures by human RAD18 complexed with RAD6B Protein triggers its recruitment to stalled replication forks.2008

    • Author(s)
      Tsuji, Y., et. al.
    • Journal Title

      Genes Cells (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The GINS complex from Pyrocoocus furiosus stimulatates the MCM helicase activity.2008

    • Author(s)
      Yoshimochi, T., et. al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 1601-1609

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A second PCNA loader loader complex, Ctf18-RFC, stmulates DNA polymerase h activity2007

    • Author(s)
      Shiomi, Y., et. al.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 282

      Pages: 20906-20914

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of human replication factors in the elongation phase of DNA replication2007

    • Author(s)
      Masuda, Y., et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 35

      Pages: 6904-6916

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA polymerase Bl and D from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus bind to PCNA at the C-terminal PIP box motifs.2007

    • Author(s)
      Tori, K., et. al.
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 189

      Pages: 5652-5657

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A single amino acid substitution in the DNA-binding domain of Aeropyrum pernix DNA ligase impairs its interaction with proliferating cell nuclear antigen.2007

    • Author(s)
      Kiyonari, S., et. al.
    • Journal Title

      Extremophiles 11

      Pages: 675-684

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary crystallographic study of DNA polymerase from Pyrococcus fuiosus2007

    • Author(s)
      Nishida, H., et. al.
    • Journal Title

      Protein Pept Lett. 14

      Pages: 403-405

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomewide and Biochemical Analyses of DNA-binding activity of Cdc6/Orc1 and Mcm proteins in Pyrococcus sp2007

    • Author(s)
      Matsunaga, F., et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 35

      Pages: 3214-3222

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific interactions of three PCNAs with replication-related proteins in Aeropyrum pemix2007

    • Author(s)
      Imamura, K.
    • Journal Title

      Mol. Microbiol. 64

      Pages: 308-318

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Functional interaction of clamp loader complexes with DNA polymeraseeta.2008

    • Author(s)
      Tsurimoto, T.
    • Organizer
      Eukaryotic DNA Replication & Genome Maintenance
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor Lab. NY,USA
    • Year and Date
      20080905-09
  • [Presentation] クランプローダーとDNAポリメラーゼE 間の相互作用の解析2008

    • Author(s)
      村上武司
    • Organizer
      組換え・複製合同ワークシヨツプ
    • Place of Presentation
      静岡県伊豆市
    • Year and Date
      20080304-07
  • [Presentation] ローダー複合体とPolε、RPA間あ相互作用の解析2008

    • Author(s)
      村上武司
    • Organizer
      第25何染色体ウーグジゴシプ
    • Place of Presentation
      静岡県熱海市
    • Year and Date
      20080130-0201
  • [Presentation] Regulation of DAN polymerase eta activity by Clamp Loader Complexes.2008

    • Author(s)
      Tsurimoto, T.
    • Organizer
      elMBL Workshop on DNA replication.
    • Place of Presentation
      Tokyo University, Japan
    • Year and Date
      2008-04-16
  • [Presentation] PCNAを中心としたDNA複製装置複合体の形成と再編に関する研究2007

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      生体超分子構造 公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪府 豊中市
    • Year and Date
      20071218-19
  • [Presentation] クランプローダーとDNA複製因子の相互作用の解析2007

    • Author(s)
      村上武司, 釣本敏樹
    • Organizer
      日本分子生物学・生化学会合同年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-20071215
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosus Cdc6/Orc1の生化学的解析2007

    • Author(s)
      秋田真季, 石野良純
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-20071215
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosusのRecJ様エキソヌクレアーゼの機能解析2007

    • Author(s)
      今村馨, 石野良純
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-20071215
  • [Presentation] ユビキチン化 PCNA によるDNA polymeraseの活性促進2007

    • Author(s)
      廣川雅人
    • Organizer
      日本分子生物学・生化学会合同年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] 超好熱古細歯パイロコツカスにおけるグロマチシ構成蛋白質のプロテオーム解析2007

    • Author(s)
      松永藤彦
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] 温泉土壌アグノム情報を利用したTaq ポリメラーゼの創製2007

    • Author(s)
      山上健
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] 沖縄近海海底土壌の遺伝子資源を利用したTaq DNA Polymerasの改変による新規有用酵素の創製2007

    • Author(s)
      鍋 健吾
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] Pyorcoccus furiosus由来ウラシルDNAグリコシラーゼーPCNA 間の機能的相互作用2007

    • Author(s)
      清成信一
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来DNAリがーゼ遺伝子の同定と酵素の特性2007

    • Author(s)
      上河内徹
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] Aeropyrum pernix由来DNAポリメラーゼとPCNA間の相互作用解析2007

    • Author(s)
      松川博昭
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosusにおけるDNA 複製起点の二重鎖解裂反応の解析2007

    • Author(s)
      竹村貴恵
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosusのDNA複製開始・伸長段階で機能するGINS複合体について2007

    • Author(s)
      吉用武弘
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosus由来複製開始因子Cdc6/Orc1の生化学的解析2007

    • Author(s)
      秋由真季
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] Aeropyrum pernix由来PCNAの多量体形成に関する研究2007

    • Author(s)
      内村真伊子
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] 沖縄近海海底土壌の遺伝子資源を利用したTaq DNA Polymerasの改変による新規有用酵素の創製2007

    • Author(s)
      鍋 健吾
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] Pyorcoccus furiosusのDNA組換え関連蛋白質Rad54の生化学的解析2007

    • Author(s)
      石野園子
    • Organizer
      第8回極限環境微生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      20071128-29
  • [Presentation] DNAリガーゼ-PCNA-DNA複合体の単粒子解析2007

    • Author(s)
      真柳浩太
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      20071121-23
  • [Presentation] Anotomy of replisome from the hyperthermophilic archaea-structure and functions of the complexes as replisome compeonents2007

    • Author(s)
      Ishino, Y.
    • Organizer
      Thermophiles
    • Place of Presentation
      Bergen, Norway
    • Year and Date
      20070924-27
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosus のDNA複製開始、伸長過程で機能するGINS複合体について2007

    • Author(s)
      吉用武弘
    • Organizer
      日本農芸化学会2007年度中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      山口県山口市
    • Year and Date
      20070914-15
  • [Presentation] 超好熱性アーキアAeropyrum pernix由来DNAリガーゼの構造と機能に関する研究2007

    • Author(s)
      上河内徹
    • Organizer
      日本農芸化学会2007年度中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      山口県山口市
    • Year and Date
      20070914-15
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyorcoccus furiosusにおける塩基除去修復系の酵素学研究2007

    • Author(s)
      内村真伊子
    • Organizer
      日本農芸化学会2007年度中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      山口県山口市
    • Year and Date
      20070914-15
  • [Presentation] アーキアの耳Hef蛋白質に関する研究〜Aeropyrum pernix 由来のHefヌクレアーゼの解析を中心に〜2007

    • Author(s)
      跡部朋美
    • Organizer
      日本農芸化学会2007 年度中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      山口県山口市
    • Year and Date
      20070914-15
  • [Presentation] 環境遺伝子資源を利用したTaqDNAポリメラーゼの蛋白質工学的改変2007

    • Author(s)
      鍋 健吾
    • Organizer
      日本農芸化学会2007年度中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      山口県山口市
    • Year and Date
      20070914-15
  • [Presentation] Variation of PCNA-interacting Site in the Archaeal DNA Replication/Repair Proteins2007

    • Author(s)
      Ishino, Y.
    • Organizer
      Gordon Research Confernce, Archaea:Ecology, Methabolism & Molecular Biology
    • Place of Presentation
      Andover, NH, USA
    • Year and Date
      20070819-24
  • [Presentation] P. furioususにおけるPNA複製フォーク進行の分子機構解析〜GINS複合体について2007

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      日本アーキア研穽会第20回講演会
    • Place of Presentation
      東京都八王子市
    • Year and Date
      20070712-13
  • [Presentation] DNA ライゲーション反応におけるDNAリガーゼの動的構造変化〜アーキア由来DNAリガーゼを用いた研究2007

    • Author(s)
      清成信一
    • Organizer
      日本アーキア研穽会第20回講演会
    • Place of Presentation
      東京都八王子市
    • Year and Date
      20070712-13
  • [Book] 複製フォークの舵取り役、クランプとランプローダータンパク質(実験医学、25巻5号 増刊「染色体サイクル」)2007

    • Author(s)
      釣本 敏樹
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] 環境バイオテクノロジー学会誌2007

    • Author(s)
      石野良純
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      メタゲノムを利用した新規DNA合成酵素の創製
  • [Book] 化学と生物2007

    • Author(s)
      清成信一
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      DNAリガーゼの構造と機能〜アーキアからの発見〜
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規 DNAポリメラーゼ2007

    • Inventor(s)
      石野良純
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人九州大学、プレシジョンシステムサイエンス(株)
    • Industrial Property Number
      2007-314385
    • Filing Date
      2007-12-05

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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