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2006 Fiscal Year Annual Research Report

高次クロマチン構造による染色体機能ドメイン構築機構の解明

Research Project

Project/Area Number 17080012
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

中山 潤一  独立行政法人理化学研究所, クロマチン動態研究チーム, チームリーダー (60373338)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村上 洋太  京都大学, ウィルス研究所, 助教授 (20260622)
沖 昌也  福井大学, 工学研究科, 助教授 (60420626)
Keywordsヘテロクロマチン / RNAi / バウンダリー / 出芽酵母 / 分裂酵母 / CAF1 / HMR
Research Abstract

1.ヘテロクロマチン構造確立のメカニズムの解明
1)siRNAの動態解析(中山):分裂酵母では、ヘテロクロマチン構造の確立過程にRNAiと良く似た機構が関与し、Ago1はその中心的な役割を果たす因子である。本年度我々は、このAgo1と相互作用する、新規の因子として単離されたArb2の機能解析を進めた。その結果、Arb2の遺伝子破壊株は他のRNAi因子欠損株と同様の表現型を示すこと、またArb2はクロマチン上には局在せず、二本鎖RNAを取り込んだAgo1が一方のRNA鎖を切断する過程に、特に重要な役割を果たすことを明らかにした。
2.ヘテロクロマチン構造維持・動態のメカニズムの解明
1)クロマチンアッセンブリー因子の機能解析(村上):これまでに分裂酵母のCAF1がヘテロクロマチンの維持に関わることを明らかにしてきた。本年度我々は、胞子形成の際におこる接合過程が、CAF1破壊株では著しく阻害されていることを見いだした。接合には窒素源枯渇にともなうG0期移行が必要であるが、このG0期においてヒストンH3の量がCAF1欠損株では野生株に比較し顕著に減少していた。G0期は核構造・クロマチン構造の大きな変化が起こると思われるがその実態は明らかにされておらず、我々の知見はこの過程にCAF1が関与することを示唆している。
2)ヘテロクロマチン境界領域決定機構の解明(沖):出芽酵母のHMR遺伝子座では、Sir2p, Sir3p, Sir4p蛋白質複合体により高次クロマチン構造が形成されていることが知られている。本年度我々は、Sir3p抗体を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP)を行うことで、HMR左側境界領域の解析を行った。その結果、HMR左側の境界領域にはトランスポゾンであるTy1-LTRとTy5-LTRが存在する事が明らかになり、これらの因子が境界形成に重要な役割を果たすことが示唆された。

  • Research Products

    (12 results)

All 2007 2006

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] Faster and easier chromatin immunoprecipitation assay with high sensitivity.2007

    • Author(s)
      Hidetsugu Kohzaki
    • Journal Title

      Proteomics 4

      Pages: 10-14

  • [Journal Article] Temperature-sensitive defects of the GSP1 gene, yeast Ran homologue, activate the Tel1-dependent pathway.2007

    • Author(s)
      Naoyuki Hayashi
    • Journal Title

      BBRC 353

      Pages: 330-336

  • [Journal Article] MRG-1, an autosome-associated protein, silences X-linked genes and protects germline immortarity in C. elegans.2007

    • Author(s)
      Teruaki Takasaki
    • Journal Title

      Development 134

      Pages: 757-767

  • [Journal Article] Acetylated YY1 regulates Otx2 expression essential to anterior neuroectoderm development at two cis-regulatory sites 90 kb apart.2007

    • Author(s)
      Nobuyoshi Takasaki
    • Journal Title

      EMBO J. (in press)

  • [Journal Article] Transscription factor, Runx1 recruits the polyomavirus replication origin to replication factories.2007

    • Author(s)
      Yota Murakami
    • Journal Title

      J Cell Biochem. (in press)

  • [Journal Article] The novel gene mus7^+ is involved in the repair of replication-associated DNA damage in fission yeast.2007

    • Author(s)
      Mika Yokoyama
    • Journal Title

      DNA Repair (in press)

  • [Journal Article] Two different Argonaute complexes are required for siRNA generation and heterochromatin assembly in fission yeast.2007

    • Author(s)
      Shane M. Buker
    • Journal Title

      Nat Struct Mol Biol. (in press)

  • [Journal Article] Runx3 expression during mouse tongue and palate development.2006

    • Author(s)
      Hiromitsu Yamamoto
    • Journal Title

      Discov Mol Cell Evol Biol. 288

      Pages: 695-699

  • [Journal Article] Different Mating Type-Regulated Genes Affect the DNA Repair Defects of Saccharomyces RAD51,R4D52and RAD55Mutants.2006

    • Author(s)
      Maria Valencia-Burton
    • Journal Title

      Genetics 174

      Pages: 41-55

  • [Journal Article] Maintenance of self-renewal ability of mouse embryonic stem cells in the absence of DNA methyltransferases Dnmt1, Dnmt3a and Dnmt3b.2006

    • Author(s)
      Akiko Tsumura
    • Journal Title

      Genes to Cells 11

      Pages: 805-814

  • [Journal Article] Cytoplasmic siRNA-degrading ribonuclease, Eril, negatively regulates heterochromatin assembly in fission yeast.2006

    • Author(s)
      Tetsushi lida
    • Journal Title

      Current Biology 16

      Pages: 1459-1464

  • [Journal Article] The CENP-B homolog, Abp1, interacts with the initiation protein Cdc23 and is required for efficient DNA replication in fission yeast.2006

    • Author(s)
      Alexandra M Locovei
    • Journal Title

      Cell Division 1

      Pages: 27

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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