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2009 Fiscal Year Annual Research Report

高次クロマチン構造による染色体機能ドメイン構築機構の解明

Research Project

Project/Area Number 17080012
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

中山 潤一  The Institute of Physical and Chemical Research, クロマチン動態研究チーム, チームリーダー (60373338)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村上 洋太  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (20260622)
沖 昌也  福井大学, 工学研究科, 准教授 (60420626)
Keywordsヘテロクロマチン / 分裂酵母 / 出芽酵母 / クロモドメイン / クロマチンアッセンブリー / バウンダリー / サイレンシング
Research Abstract

1. 高次クロマチン構造の確立と維持のメ力ニズムの解析:(1)HP1/Swi6はヘテロクロマチン形成の中心的役割を果たす因子である。昨年までの分裂酵母の成果を基に、本年度は哺乳類HP1の機能とその動態解析を進めた。そして哺乳類HP1が様々な種類のリン酸化修飾を受けること、またその修飾がK9メチル化H3の認識に重要であることを明らかにした。さらにHP1のアイソフォームが、独自の相互作用因子と結合し、高次クロマチン構造維持に寄与していることを明らかにした(中山)。(2)分裂酵母ヘテロクロマチン領域には、Swi6依存的にコヒーシンが局在し、姉妹染色分体接着をおこなっている。我々はSwi6と相互作用しヘテロクロマチン内の転写を活性化するEpe1と、転写を抑制するSHREC複合体が、コヒーシンの局在を制御する事を見いだした。この結果よりコヒーシンのヘテロクロマチンへの局在、さらには姉妹染色体分体接着を確立・維持する過程を、ヘテロクロマチン内の転写が制御するという、新しいメ力ニズムの存在が示唆された(村上)。
2. 高次クロマチン構造境界形成機構の解析:(3)スクリーニングにより分離された境界形成因子であるGIC1、SGF73のドメイン解析を行い、境界形成能を持つ最小領域を決定に成功した。GIC1はそれぞれ約20アミノ酸からなる離れた2ケ所のドメインが境界形成に必要であった。SGF73は28アミノ酸で境界形成能を持ち、その領域特異的にヒストンアセチル化酵素複合体が結合することが明らかとなった(沖)。(4)レポーター遺伝子EGFPを境界領域に挿入し、EGFPの発現状態を指標に単一細胞における境界領域切り替わりメ力ニズムを解析した。境界領域は分裂を繰り返すと変動し、老化すると発現状態が ON の細胞が増加することを発見した(沖)。

  • Research Products

    (17 results)

All 2010 2009

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] MRG15 directly binds to PALB2 and stimulates homology-directed repair of chromosomal breaks2010

    • Author(s)
      Tomohiro Hayakawa
    • Journal Title

      Journal of Cell Science (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic regulation of heterochromatin via phosphorylation of HP1-family proteins2010

    • Author(s)
      Athsushi Shimada
    • Journal Title

      Epigenetics (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Property of cold inducible DEAD-box RNA helicase in hyperthermophilic archaea2009

    • Author(s)
      Yoko Shimada
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications 389

      Pages: 622-627

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient in vitro synthesis of cis-polyisoprenes using a thermostable cis-prenyltransferase from a hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis2009

    • Author(s)
      Yosuke Yamada
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 143

      Pages: 151-156

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reconstitution of Arabidopsis thaliana SUMO Pathways in E.coli : Functional Evaluation of SUMO Machinery Proteins and Mapping of SUMOylation Sites by Mass Spectrometry2009

    • Author(s)
      Sachiko Okada
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology 50

      Pages: 1049-1061

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression in Escherichia coli of an Unnamed Protein Gene from Aspergillus oryzae RIB40 and Cofactor Analyses of the Gene Product as Formate Oxidase2009

    • Author(s)
      Yoshifumi Maeda
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 73

      Pages: 2645-2649

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] エピジェネティックな遺伝子発現切り替わりメカニズムの解析2010

    • Author(s)
      沖昌也
    • Organizer
      第27回 染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      静岡県 御殿場市
    • Year and Date
      2010-01-20
  • [Presentation] Dynamic Regulation of heterochromatin sturucture/function in the cell cycle2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県 横浜市
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Dynamic Regulation of Heterochrimatin2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      The Fifth International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      20091026-20091031
  • [Presentation] トランスポゼース由来の分裂酵母CENP-Bホモログはキネトコアとヘテロクロマチンの境界で機能する2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      兵庫県 神戸市
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] Dynamic Regulation of Heterochrimatin2009

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      第24回 内藤カンファレンス"Nuclear Dynamics and RNA[II]
    • Place of Presentation
      北海道 札幌市
    • Year and Date
      20090623-20090626
  • [Presentation] Chromodomain Protein and RNAi-mediated Heterochromatin Assembly2009

    • Author(s)
      中山潤一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県 横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Analysis of the heredity change of the boundary2009

    • Author(s)
      沖昌也
    • Organizer
      UNIA Current Trends in Biomedical Workshop 2009 on : Chromatin Domains and Insulators
    • Place of Presentation
      Baeza, Spain
    • Year and Date
      2009-11-09
  • [Presentation] Distinct Roles of Chromodomain Proteins in the Formation of Higher-Order Chromatin Structure2009

    • Author(s)
      中山潤一
    • Organizer
      The Fifth International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-10-29
  • [Presentation] 分裂酵母のSETドメインタンパク質はリボソームタンパク質のメチル化修飾してリボソーム機能を制御する2009

    • Author(s)
      中山潤一
    • Organizer
      第11回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      新潟県 新潟市
    • Year and Date
      2009-07-29
  • [Presentation] Analysis of the heredity change of the gene expression in the single cell2009

    • Author(s)
      沖昌也
    • Organizer
      FASEB Summer Research Conference
    • Place of Presentation
      Colorado, USA
    • Year and Date
      2009-07-13
  • [Presentation] 単一細胞におけるエピジェネティックな遺伝子発現切り替わりメカニズムの解析2009

    • Author(s)
      沖昌也
    • Organizer
      第8回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      静岡県 伊豆市
    • Year and Date
      2009-06-19

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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