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2005 Fiscal Year Annual Research Report

代謝制御におけるRNAの新たな役割

Research Project

Project/Area Number 17207010
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

饗場 弘二  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (20025662)

Keywordssmall RNA / Hfq / RNase E / グルコーストランスポーター / 解糖系 / 翻訳抑制 / mRNA分解 / ribonucleoprotein complex
Research Abstract

解糖系代謝産物であるglucose-6-Pの蓄積(代謝ストレス)に応答して、glucose透過酵素をコードするptsG mRNAがRNase Eに依存して不安定化すること、degradosome複合体の形成に必須なRNase EのC末端領域(scaffold domain)がptsG mRNAの分解に重要であることを見いだしている。また、ptsG mRNAの分解応答に関与する因子として、RNAシャペロンであるHfqとsmall RNA(sRNA)であるSgrS RNAが同定されている。これらの知見から、代謝ストレスによりSgrS RNAが発現誘導され、Hfqと協調してptsG mRNAと相互作用することで、RNase EによりptsG mRNAが分解される、という経路が明らかになってきた。
今回、ptsG mRNAの分解応答におけるRNase Eのscaffold domainの作用について検討する目的で、RNase EとHfq/SgrSとの相互作用について共沈実験により検討した。その結果、RNase E-FLAGにおいてHfqとの結合が観察され、scaffold domainを欠失したRNase E701-FLAGにおいてはHfqとの結合は観察されなかった。同様に、代謝ストレス時においてはscaffold domain依存にRNase EとSgrS RNAとの結合が観察された。また、Hfq-FLAGを精製した結果、RNase Eは共沈したが、他のRNA degradosomeの構成因子は共沈しなかった。以上の結果からsRNAを介すmRNA分解制御を担うRNase E/Hfq/sRNA複合体の存在を明らかにした。この複合体は、miRNAあるいはsiRNAを含む真核生物におけるRISCと類似していることを新たに提唱した。

  • Research Products

    (5 results)

All 2006 2005

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] Protein tagging at rare codons is caused by tmRNA action at the 3' end of nonstop mRNA generated in response to ribosome stalling.2006

    • Author(s)
      Li, X., Hirano, R., Tagami, H, Aiba, H.
    • Journal Title

      RNA 12

      Pages: 248-255

  • [Journal Article] Translational repression is sufficient for gene silencing by bacterial small non-coding RNAs in the absence of mRNA destruction.2006

    • Author(s)
      Morita, T., Mochizuki, Y., Aiba, H.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. (in press)

  • [Journal Article] Implication of membrane localization of target mRNA in the action of a small RNA : mechanism of post-transcriptional regulation of glucose transporter in Escherichia coli.2005

    • Author(s)
      Kawamoto, H., Morita, T., Shimizu, A., Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev. 19

      Pages: 328-338

  • [Journal Article] Translation of aberrant mRNAs lacking a termination codon or with a shortened 3'-UTR is repressed after initiation in yeast.2005

    • Author(s)
      Inada, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      EMBO J. 24

      Pages: 1584-1595

  • [Journal Article] RNase E-based ribonucleoprotein complexes : mechanical basis of mRNA destabilization mediated by bacterial noncoding RNAs.2005

    • Author(s)
      Morita, T., Maki, K., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev. 19

      Pages: 2176-2186

URL: 

Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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