2006 Fiscal Year Annual Research Report
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17207010
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
饗場 弘二 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (20025662)
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| Keywords | small RNA / Hfq / RNase E / グルコーストランスポーター / 解糖系 / 翻訳抑制 / mRNA分解 / ribonucleoprotein complex |
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| Research Abstract |
SgrS RNAはHfqと結合して代謝ストレス応答を担うsmallアンチセンスRNAである。SgrS RNAはHfqを介してRnase Eとリボヌクレオタンパク複合体を形成し、標的であるグルコーストランスポーター遺伝子ptsGを転写後段階で発現抑制する。SgrS RNAは部分的な塩基対形成によりptsG mRNAに作用すると予想できる。そこで、ptsG mRNAの発現制御機構におけるSgrS RNAとptsG mRNAの塩基対形成の重要性について検討した。その結果、ptsG mRNAのShine-Dalgarno (SD)配列付近に、SgrS RNAの働きを減少させる点変異体を同定した。また、その点変異体と相補的になるようSgrS RNA側の変異体を構築し解析した結果、SgrS RNAの機能が回復した。これらの解析により、ptsGの転写後の発現抑制におけるSgrS RNAとptsG mRNAの塩基対形成の重要性が示された。また、ptsG mRNAのSD配列付近の6塩基対がSgrS RNAの働きにとりわけ重要であることが明らかになった。同時に、in vitroにおいて、SgrS RNAがptsG mRNAと安定的なRNA-RNA結合を形成し、HfqがRNA間の結合を著しく促進することを明らかにした。
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[Journal Article] Yeel, a novel protein involved in modulation of the activity of the glucose-phosphotransferase system in Escherichia coli K-12.2006
Author(s)
Becker.A.K., Zeppenfeld, T., Staab, A., Seitz, S., Boos, W., Morita T., Aiba H., Mahr, K., Titgemeyer, F., Jahreis, K.
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Journal Title
J Bacteriol. 188
Pages: 5439-5449
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