2006 Fiscal Year Annual Research Report
細胞性粘菌の発生分化を制御する遺伝子ネットワークの解析
| Project/Area Number |
17310112
|
|---|
| Research Institution | University of Tsukuba |
|---|
Principal Investigator |
漆原 秀子 筑波大学, 大学院生命環境科学研究科, 教授 (00150087)
|
|---|
| Keywords | 細胞性粘菌 / 遺伝子発現制御 / 遺伝子ネットワーク / マイクロアレイ / 有性生殖 / シグナル伝達 / 遺伝子ファミリー |
|---|
| Research Abstract |
本研究はモデル生物として知られる細胞性粘菌Dictvostelium. discoideumにおいて発生分化を支配する遺伝子間の制御関係をゲノムウイドに解析することを目指し、上流プロモーター領域の取得とデータベース化、遺伝子の発現特性による階層的グループ化、発現グループに特徴的な制御エレメントの抽出等による遺伝子間の制御ネットワークの解析を行った。プロモーター領域については転写開始点のばらつきを考慮してORF開始点を基準にとることとし、全予測遺伝子についてその配列を取得してデータベース化した。遺伝子発現特性を解析するための全遺伝子アレイは当初本研究において作製することを計画していたが、研究経費との関係上、Rob Kay(MRC)との共同研究でSanger Centerで作製されたアレイを利用した。情報量の不足していた有性生殖期を中心にRNAを調製してハイブリダイゼーションを行い、これまで発現が確認されていなかった新規遺伝子約1,300個についての発現パターンを取得した。そのうち、性的成熟に伴って発現レベルが2倍以上に誘導される遺伝子が40個、1/2以下に抑制される遺伝子が123個、1/5以下になるものが51個であった。2倍以上に誘導される遺伝子と1/5以下に抑制される遺伝子についてリアルタイム定量PCRを行い、各々24個、13個について発現レベルの変化を確認することができた。これらの発現グループに特徴的な制御エレメントの抽出と1/2以下に抑制される残りの72遺伝子については作業中である。また、細胞内シグナル伝達に関わるras、遺伝子ファミリーの発現解析を行い、これまでに解析されているRasGグループとはやや系統的に隔たったRasXグループの6遺伝子が有性生殖期に特異的に発現することを見出し、シグナル伝達の仕分けが示唆された。
|
