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2007 Fiscal Year Annual Research Report

時間分解紫外共鳴ラマン分光法による光センサータンパク質の構造ダイナミクスの解明

Research Project

Project/Area Number 17350009
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

水谷 泰久  Osaka University, 大学院・理学研究科, 教授 (60270469)

Keywords共鳴ラマン分光法 / 時間分解分光法 / タンパク質ダイナミクス
Research Abstract

発色団の光励起にともなうイエロープロテイン(PYP)の構造変化を調べるために、タンパク質中のチロシンおよびトリプトファン残基とペプチド結合に由来する振動バンドについて、それぞれの観測に適したプローブ光の波長を選択し、ピコ秒時間分解紫外共鳴ラマン測定を行った。PYPの光励起後3psの時間分解紫外共鳴ラマン差スペクトルには、チロシン残基についてY8a、Y7a、およびY9aバンドに、トリプトファン残基についてW3、W7、W16、およびW18バンドに明らかな強度減少が観測された。また、ペプチド結合については、アミドIIIバンドに強度減少が観測された。PYP分子中に、チロシン残基は5個、トリプトファン残基は1個存在している。チロシン残基のスペクトル変化は、発色団と直接水素結合しているチロシン残基であるY42の寄与の可能性が最も高い。このため、観測されたスペクトル変化は、発色団周辺の水素結合強度の変化を示している。すなわち、発色団の電子励起状態(寿命<3ps)において、発色団とY42の間の水素結合強度は強化されていることを表している。一方、トリプトファン残基のスペクトル変化は、唯一のトリプトファン残基であるW119の構造変化に帰属される。W119は発色団から12Å離れた位置にあるため、そのスペクトル変化は、発色団から比較的遠くに離れた位置において高速構造変化があることを示している。アミド振動バンドのスペクトル変化は、発色団の光励起に応答して二次構造を含むタンパク骨格構造が非常に速く変化していることを示している。このスペクトル変化は、W119周辺の高速構造変化の観測結果と矛盾しない。これらの結果により、光応答による構造変化の高速伝播がPYP中で起きていることが初めて示された。

  • Research Products

    (15 results)

All 2007 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Picosecond Protein Response to the Chromophore Isomerization of Photoactive Yellow Protein: Selective Observation of Tyrosine and Tryptophan Residues by Time-Resolved Ultraviolet Resonance Raman Spectroscopy2007

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B 111

      Pages: 6293-6296

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 時間分解振動分光法によるタンパク質のダイナミクス解析2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Journal Title

      光学 36

      Pages: 516-523

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 時間分解共鳴ラマン分光法で観るヘムタンパク質の構造ダイナミクスと機能発現機構2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Journal Title

      Biochemistry 46

      Pages: 6086-6096

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イエロープロテインにおける光誘起構造変化の高速伝播:ピコ秒時間分解紫外共鳴ラマン分光による観測2007

    • Author(s)
      水野操
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] 時間分解共鳴ラマン分光法で観たタンパク質ダイナミクス:ピコ秒からミリ秒まで、可視領域から紫外領域まで2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会シンポジウム「振動分光法が拓く生命科学;分子から細胞まで」
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      20071221-23
  • [Presentation] タンパク質ダイナミクスと水素結合2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      北大低温研共同利用研究集会「低温凝縮系における水素の化学と物性」
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      20071213-15
  • [Presentation] ピコ秒時間分解紫外共鳴ラマン分光によるタンパク質二次構造の高速変化の観測2007

    • Author(s)
      水野操
    • Organizer
      第1回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東北大学
    • Year and Date
      20070917-20
  • [Presentation] Primary protein responses of myoglobin after ligand dissociation revealed by time-resolved resonance Raman spectroscopy2007

    • Author(s)
      Yasuhisa, Mizutani
    • Organizer
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • Place of Presentation
      Telluride, Colorado, USA
    • Year and Date
      20070730-0803
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [Presentation] Ultrafast protein dynamics of myoglobin revealed by time-resolved resonance Raman spectroscopy2007

    • Author(s)
      Yasuhisa Mizutani
    • Organizer
      12th Korea-Japan Joint Symposium on Frontiers of Molecular Science, "Leading-Edge and the Future of Photo-Molecular Science"
    • Place of Presentation
      Jeju, Korea
    • Year and Date
      20070705-07
  • [Presentation] Observation of Primary Structural Changes of Photoreactive Proteins by Picosecond Time-Resolved Ultraviolet Resonance Raman Spectroscopy2007

    • Author(s)
      Misao Mizuno
    • Organizer
      Thirteenth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Freising, Germany
    • Year and Date
      20070519-25
  • [Presentation] Structural dynamics of hemoglobin encapsulated in silica gels2007

    • Author(s)
      Atsushi Inagaki
    • Organizer
      Thirteenth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Freising, Germany
    • Year and Date
      20070519-25
  • [Presentation] Picosecond protein dynamics of myoglobin upon ligand dissociation studied by ultraviolet resonance Raman spectroscopy2007

    • Author(s)
      Y. Mizutani
    • Organizer
      Thirteenth International Conference on Time-Resolved Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Freising, Germany
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 時間分解共鳴ラマン分光法によるタンパク質ダイナミクスの観測:構造変化と機能2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Organizer
      第20回九州分析化学若手の会春の講演会
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2007-05-12
  • [Book] みず学への誘い2007

    • Author(s)
      水谷泰久
    • Total Pages
      88-97
    • Publisher
      大阪大学出版会
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.chem.sci.osaka-u.ac.jp/lab/mizutani/index-jp.html

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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