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2005 Fiscal Year Annual Research Report

耐熱性シトクロムCの作用機構の解明と精密分子設計への応用

Research Project

Project/Area Number 17350081
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

山本 泰彦  筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 教授 (00191453)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三田 肇  筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 講師 (00282301)
長友 重紀  筑波大学, 大学院・数理物質科学研究科, 講師 (80373190)
Keywordsタンパク質 / ヘム錯体 / 耐熱性 / 電気化学 / 電子移動 / NMR / 熱変性 / 非共有結合性相互作用
Research Abstract

耐熱性タンパク質を利用して、従来よりもはるかに系統的、詳細かつ高精度での解析により、電子伝達タンパク質シトクロムcの機能と構造との関係を解明する。そして、電子移動反応に伴う熱力学量を調節する構造化学的因子を明らかにし、得られた知見に基づいて、シトクロムcの酸化還元電位(E^<0'>)を調節する分子設計指針を提唱する。そのためには、電気化学測定によるE^<0'>の熱力学的解析、耐熱性シトクロムcのヘム近傍の立体構造解析および熱力学的安定性の評価、円二色性スペクトルによるタンパク質内部構造の安定性の評価、吸収スペクトルによるヘムの化学的環境およびヘム鉄配位構造の安定性の解析、シトクロムcのE^<0'>とヘム鉄配位構造およびヘムプロピオン酸側鎖の電離との関係の解明を行う。
本研究の目的の遂行は、単にシトクロムCの生物学的機能を物理化学的相互作用で理解するために役立つだけでなく、もっと一般的に生体高分子の機能と構造との相関関係を解明する観点からも重要である。調製済である一連のユニークな耐熱性シトクロムc実験系を利用すれば、電気化学測定により精度良く計測できるE^<0'>の変化を解析することにより、E^<0'>に影響を及ぼす構造化学的因子を決定することが可能となる。本研究の遂行には、私共の構築した一連の耐熱性シトクロムcの変異体の利用、高精度での電気化学計測技術、金属タンパク質立体構造解析手法、設計した生体高分子を利用して新規バイオ電池を構築する技術等が不可欠である。また、得られた知見を生体高分子を精密に分子設計する基本原理として活用する予定であるが、具体的な応用例としては、新規バイオ電池の創製等を考えている。

  • Research Products

    (12 results)

All 2006 2005

All Journal Article (12 results)

  • [Journal Article] Exogenous ligand binding property of a heme-DNA coordination complex2006

    • Author(s)
      T.Ohyama
    • Journal Title

      Chem.Lett. 35

      Pages: 126-127

  • [Journal Article] A spectroscopic index for estimating the age of amber2006

    • Author(s)
      H.Kimura
    • Journal Title

      Bull.Chem.Soc.Jpn. 79(in press)

  • [Journal Article] ^<19>F NMR Study of b-type haemoproteins2006

    • Author(s)
      Y.Yamamoto
    • Journal Title

      Modern Magnetic Resonance

      Pages: 1-8

  • [Journal Article] Control of the redox potential of pseudomonas aeruginosa cytochrome c_<511> through the Fe-Met coordination bond strength and pKa of a buried heme propionicacid side chain2005

    • Author(s)
      S.J.Takayama
    • Journal Title

      Biochemistry 44

      Pages: 5488-5494

  • [Journal Article] NMR studies of b-type haemoproteins reconstituted with a ring-fluorinated haem2005

    • Author(s)
      Y.Yamamoto
    • Journal Title

      Annu.Rep.NMR Spectrosc. 57

      Pages: 51-99

  • [Journal Article] Binding of 5,10,15,20-tetrakis(N-methylpyridinium-4-yl)-21H,23H-porphyrin to as AT-rich region of a duplex DNA2005

    • Author(s)
      T.Ohyama
    • Journal Title

      Biophys.Chem. 113

      Pages: 53-59

  • [Journal Article] ^<19>F NMR characterization of the thermodynamics and dynamics of the acid-alkline transition in a reconstituted sperm whale metmyoglobin2005

    • Author(s)
      S.Nagao
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 127

      Pages: 4146-4147

  • [Journal Article] Five amino acid residues responsible for the high stability of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c_<552> : reciprocal mutation analysis2005

    • Author(s)
      K.Oikawa
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 5527-5532

  • [Journal Article] Dynamics and thermodynamics of dimerization of parallel G-quadruplexed DNA formed from d(TTAGn) (n=3-5)2005

    • Author(s)
      Y.Kato
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 127

      Pages: 9980-9981

  • [Journal Article] Prebiotic formation of polyamino acids in molten urea2005

    • Author(s)
      H.Mita
    • Journal Title

      Int.J.Astrobiol. 4

      Pages: 145-154

  • [Journal Article] Structural and functional characterization of novel G-quadruplexed DNA-heme coordination complex2005

    • Author(s)
      T.Ohyama
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser. 49

      Pages: 245-246

  • [Journal Article] Characterization of Non-Native Heme Coordination Structures Emerging upon Guanidine Hydrochloric Acid-Induced Unfolding of Pseudomonas aeruginosa Ferricytochrome c_<551>2005

    • Author(s)
      H.Tai
    • Journal Title

      Bull.Chem.Soc.Jpn. 78

      Pages: 2019-2025

URL: 

Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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