Studies on the distribution of chlorophyll d and the microbial ecology of Acaryochloris spp

2008 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17370009
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Ecology/Environment
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: MIYASHITA Hideaki Kyoto University, 大学院・人間環境学研究科, 准教授 (50323746)
• Project Period (FY): 2005 – 2008
• Keywords: クロロフィル d / Acaryochloris / PCR-DGGE / 分布 / 多様性 / 微生物生態

Research Abstract

本研究では, クロロフィルdを有する唯一のシアノバクテリアAcaryochloris spp.が, 海藻などへの付着生物, あるいは浮遊生物として世界中の海洋沿岸に広範に分布すること, 2種程度に分けることのできる遺伝的多様性をもつこと、地理的な遺伝的分化がみられないことなどを明らかにした。さらに、海洋沿岸環境ではクロロフィルdの量が,クロロフィルaの量に対して平均1%前後存在し一次生産に一定の寄与をしていることを明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] nique photosystems in Acaryochloris marina (2008)
  • Author(s): Ohashi, S., Miyashita, H., Okada, N., Iemura, T., Watanabe, T., & Kobayashi, M
  • Journal Title: Photosynth Res 98 Pages: 141-149
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evidence for global Chlorophyll d (2008)
  • Author(s): Kashiyama, Y., Miyashita, H., Ohkubo, S., Ogawa,N. O., Chikaraishi, Y., Takano, Y., Suga, H., Toyohuku, T., Nomaki, H., Kitazato, H., Nagata, T., & Ohkouchi,N
  • Journal Title: Science 321 Pages: 658
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Niche adaptation and genome expansion in the chlorophyll d-producing cyanobacterium Acaryochloris marina (2008)
  • Author(s): Swingley, W.D., Chen, M., Cheung, P.C., Conrad, A.L., Dejesa, L.C., Hao, J., Honchak, B.M., Karbach, L.E., Kurdoglu, A., Lahiri, S., Mastrian, S.D., Miyashita, H., Page, L., Ramakrishna, P., Satoh, S., Sattley, W.M., Shimada, Y., Taylor, H.L., Tomo, T., Tsuchiya, T., Wang, Z.T., Raymond, J., Mimuro, M., Blankenship, R.E., & Touchman, J.W
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci USA 105 Pages: 2005-2010
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular detection of epiphytic Acaryochloris spp. on marine macroalgae. (2006)
  • Author(s): Ohkubo, S., Miyashita, H., Murakami, A., Takeyama, H., Tsuchiya, T., Mimuro, M
  • Journal Title: Appl. Environ. Microbiol 72 Pages: 7912-7915
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] シアノバクテリアに見られるクロロフィルの多様性 (2006)
  • Author(s): 宮下英明
  • Journal Title: 遺伝 6巻6号 Pages: 33-39
• [Journal Article] Detection of cyanobacteria in Antarctic samples using PCR-DGGE (2005)
  • Author(s): Miyashita, H., Ohkubo, S., Naganuma, T., Imura S
  • Journal Title: Proceedings of the Seminar on Antarctic Research in the University of Malaya
• [Journal Article] クロロフィルdを使うシアノバクテリアAcaryochlorisの光合成と系統発生過程の推定 (2005)
  • Author(s): 宮下英明
  • Journal Title: 光合成研究会会報 44号
• [Presentation] Possible impacts of chlorophyll d on global carbon cycle (2008)
  • Author(s): Miyashita, H., Ohkubo, S., Kashiyama, Y., & Ohkouchi, N.
  • Organizer: 8th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  • Place of Presentation: Busan, Korea
  • Year and Date: 2008-11-15
• [Presentation] Ecological distribution of Acaryochloris spp. and chlorophyll d (2008)
  • Author(s): Ohkubo, S., & Miyashita, H
  • Organizer: 12th International Symposium on Microbial Ecology
  • Place of Presentation: Cairns, Australia
  • Year and Date: 2008-08-17
• [Presentation] 海藻から抽出されるクロロフィルdの検出と定量 (2008)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明
  • Organizer: 第11回マリンバイオテクノロジー学会
  • Place of Presentation: 京都大学
  • Year and Date: 2008-05-24
• [Presentation] 海藻に検出されるクロロフィルdの定量 (2008)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明
  • Organizer: 日本藻類学会第32回大会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学
  • Year and Date: 2008-03-23
• [Presentation] クロロフィルdを主要色素とするシアノバクテリアAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性 (2007)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • Organizer: 第27回微生物系統分類研究会年次大会
  • Place of Presentation: 地方職員共催組合富士保養所富士桜荘
  • Year and Date: 2007-11-16
• [Presentation] Acaryochloris spp.の分布 (2007)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • Organizer: 第23回日本微生物生態学会
  • Place of Presentation: 愛媛大学
  • Year and Date: 2007-09-16
• [Presentation] Wide dsitribution of Acaryochloris spp., chlorophyll d-dominating cyanobacteria (2007)
  • Author(s): Miyashita, H., Ohkubo, S., Tsuchiya, T, & Mimuro, M.
  • Organizer: 21st Pacific Science Congress(PSC21)
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan
  • Year and Date: 2007-06-14
• [Presentation] Acaryochloris spp. の地理分布と生態分布 (2007)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 三室守
  • Organizer: 日本藻類学会第31回大会
  • Place of Presentation: 神戸大学
  • Year and Date: 2007-03-25
• [Presentation] シアノバクテリアの多様化 (2006)
  • Author(s): 宮下英明
  • Organizer: 大阪大学蛋白質研究所セミナー(共催 : 日本光合成研究会第6回ワークショップ)
  • Place of Presentation: 大阪大学
  • Year and Date: 2006-10-12
• [Presentation] 群体ホヤに検出されるAcaryochloris spp.の遺伝的多様性 (2006)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 竹山春子, 三室守
  • Organizer: 日本藻類学会第30回大会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
  • Year and Date: 2006-03-27
• [Presentation] PCR-DGGE 法を用いたAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性の解析 (2005)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • Organizer: かずさDNA 研究所研究会「ラン藻の分子生物学」
  • Place of Presentation: 木更津かずさアカデミアホール
  • Year and Date: 2005-12-05
• [Presentation] シアノバクテリアの多様性と不思議 (2005)
  • Author(s): 宮下英明
  • Organizer: かずさDNA研究所研究会「ラン藻の分子生物学」
  • Place of Presentation: 木更津かずさアカデミアホール
  • Year and Date: 2005-12-05
• [Presentation] Acaryochloris spp.の光化学系I反応中心タンパク質の進化速度は速い (2005)
  • Author(s): 宮下英明, 細谷直史, 土屋徹, 三室守
  • Organizer: 第21回日本微生物生態学会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
  • Year and Date: 2005-11-02
• [Presentation] Palauの群体ホヤから検出されるAcaryochloris spp.の遺伝的多様性 (2005)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • Organizer: 第21回日本微生物生態学会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
  • Year and Date: 2005-10-31
• [Presentation] Wide distribution of epiphytic Acaryochloris on red macroalgae (2005)
  • Author(s): Miyashita, H., Ohkubo, S., Tsuchiya, T, & Mimuro, M.
  • Organizer: The 8^<th> International Phycological Congress
  • Place of Presentation: Durban, South Africa
  • Year and Date: 2005-08-16
• [Presentation] 日本沿岸に生息するAcaryochloris spp.の分布と遺伝的多様性 (2005)
  • Author(s): 大久保智司, 宮下英明, 村上明男, 土屋徹, 竹山春子, 三室守
  • Organizer: 第12回日本光生物学協会年会
  • Place of Presentation: 京都大学
  • Year and Date: 2005-08-06
• [Presentation] パパインによるクロロフィルa → クロロフィルd 変換の発見-Acaryochloris marina でのChl d 生合成との関連 (2005)
  • Author(s): 小泉創, 細田定正, 宮下英明, 三室守, 白岩善博, 山下俊, 小林正美
  • Organizer: 第8回マリンバイオテクノロジー学会大会
  • Place of Presentation: 熊本大学
  • Year and Date: 2005-05-29
• [Remarks] 平成19年8月1日新聞掲載(朝日新聞、フジサンケイビジネスアイ、日経産業新聞、日刊工業新聞、化学工業日報,京都新聞)