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2007 Fiscal Year Annual Research Report

異なる反応を示す糖質酵素の新規な立体構造に基づく分子解析と応用

Research Project

Project/Area Number 17380060
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

木村 淳夫  Hokkaido University, 大学院・農学研究科, 教授 (90186312)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 森 春英  北海道大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (80241363)
奥山 正幸  北海道大学, 大学院・農学研究院, 助教 (00344490)
Keywords酵素反応 / 糖 / 蛋白質工学
Research Abstract

近年の糖質酵素の分類は、構造の類似性からなされる。研究対象は、α-グルコシダーゼと相同する酵素グループであり、産業界で重要な酵素が属する。すなわちα-グルコシダーゼ、グルカンリアーゼ、環状4糖合成酵素とα-キシロシダーゼであり、4つの反応(加水分解・糖転移・環状化・脱離反応)を触媒する。本研究の目的は、我々が解析した本グループの立体構造に基づき、多様な反応の分子機構を明らかにし、得られた知見を応用研究に結びつけることにある。具体的には、a)X線解析法で得られた酵素-基質の分子認識を検討し、実験的に基質とアミノ酸の相互作用を調べる。b)触媒アミノ酸の置換酵素の反応を解析し、触媒残基の機能を究明する。c)4酵素は構造が類似するが全く異なる作用を示すので、個々の反応を発揮させる構造因子を解明する。d)得られた知見から産業に重要な酵素を作製する。
本年度の成果を以下に示す。環状化反応の2つ特徴を検証した。すなわち、1)反応中間体への水分子の攻撃が起らずに転移反応が優先、2)基質分子内での転移である。・α-グルコシダーゼの触媒水を立体構造から予測し、触媒水を固定するアミノ酸を置換した。変異酵素は分解能を失い転移活性のみを示し、1)の特徴に対する触媒水の寄与を示す画期的なデータを得た。触媒水の存在部位から転移に関わる触媒アミノ酸の機能を知ることができた。2)の性質について構造因子を解析中である。昨年度に明らかにした細菌α-グルコシダーゼの糖転移作用に関する分子解析の結果を受け、糸状菌酵素のサブサイト+1にあるアミノ酸に着目し変異導入を行った。変異酵素は、加水分解における基質の結合認識のみならず、糖転移の結合生成能を変えた。親酵素になかった新規な転移能力を示す変異酵素が得られ、産業に有用なオリゴ糖の取得に成功した。

  • Research Products

    (16 results)

All 2008 2007

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Glycoside hydrolase family 31 Escherichia coli α-xylosidase2008

    • Author(s)
      M. S. Kang
    • Journal Title

      Biocatal. Biotransfor. 26

      Pages: 96-103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rice α-glucosidase isozymes and isoforms showing different starch granules-binding and -degrading ability2008

    • Author(s)
      H. Nakai
    • Journal Title

      Biocatal. Biotransfor. 26

      Pages: 104-110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular cloning of cDNAs for three α-glucosidases from European honeybee, Apis mellifera L.2007

    • Author(s)
      M. Nishimoto
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71

      Pages: 1703-1716

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Function-unknown glycoside hydrolase family 31 proteins expressed in rice ripening and germinating stages are α-glucosidase and α-xylosidase2007

    • Author(s)
      H. Nakai
    • Journal Title

      J. Biochem. 142・4

      Pages: 491-500

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of thermo- and acid-stable novel oligosaccharides by using dextransucrase with high concentration of sucrose2007

    • Author(s)
      S. H. Nam
    • Journal Title

      J. Appl. Glycosci. 54

      Pages: 147-155

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel cyclic isomaltooligosaccharide(cycloisomaltodecaose, CI-10)produced by Bacilluscirculans T-3040 displays remarkable inclusion ability compared with cyclodextrins2007

    • Author(s)
      K. Funane
    • Journal Title

      J. Biotechnol. 130

      Pages: 188-192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of Streptococcus mutans dextranglucosidase2007

    • Author(s)
      W. Saburi
    • Journal Title

      Acta Cryst. F 63

      Pages: 774-776

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular cloning of cDNA for trehalase from European honeybees, Apis mellifera L., and its heterologous expression in Pichia pastoris2007

    • Author(s)
      J. H. Lee
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71

      Pages: 2256-2265

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aglycone specificity of Escherichia coli α-xylosidase investigated by transxylosylation2007

    • Author(s)
      M. S. Kang
    • Journal Title

      FEBS J. 274

      Pages: 6074-6084

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic synthesis and characterization of arbutin glucosides using glucansucrase from Leuconostoc mesenteroides B-1299CB2007

    • Author(s)
      Y. H. Moon
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biot. 77

      Pages: 559-567

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Starch-binding function of C-terminal region of plant α-glucosidase2007

    • Author(s)
      H. Nakai
    • Organizer
      7th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Braunschweig(Germany)
    • Year and Date
      20070423-24
  • [Presentation] Aglycone specificity of Escherichia coli α-xylosidase investigated by transxylosylation2007

    • Author(s)
      M. S. Kang
    • Organizer
      7th Carbohydrate Bioengineering Meeting
    • Place of Presentation
      Braunschweig(Germany)
    • Year and Date
      20070423-24
  • [Presentation] Structure-function relationship and engineering of dextran glucosidase from Streptococcus mutans2007

    • Author(s)
      W. Saburi
    • Organizer
      3rd Symposium on the Alpha-Amylase Family
    • Place of Presentation
      Smolenice(Slovakia)
    • Year and Date
      2007-09-24
  • [Presentation] 大腸菌YicI(α-xylosidase)の基質認識機構の解析2007

    • Author(s)
      奥山正幸
    • Organizer
      第15回糖質関連酵素化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本大学(藤沢)
    • Year and Date
      2007-08-31
  • [Presentation] Molecular analysis of α-glucosidase and its application2007

    • Author(s)
      M. Okuyama
    • Organizer
      Summer International Symposium on Biotechnology and Modern Agriculture
    • Place of Presentation
      Qingdao(China)
    • Year and Date
      2007-07-28
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 改変デキストラングルコシダーゼ及びその製造方法2007

    • Inventor(s)
      木村淳夫
    • Industrial Property Rights Holder
      北海道大学
    • Industrial Property Number
      特許出願2007-188323
    • Filing Date
      2007-07-19

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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