2007 Fiscal Year Annual Research Report
創薬シーズ探索のための「Cancer Cell Informatics」の開発と応用
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17390032
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| Research Institution | Japanese Foundation For Cancer Research |
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Principal Investigator |
矢守 隆夫 Japanese Foundation For Cancer Research, 癌化学療法センター・分子薬理部, 部長 (60200854)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
旦 慎吾 財団法人癌研究会, 癌科学療法センター分子薬理部, 研究員 (70332202)
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| Keywords | Cancer Cell Informatics / 分子標的予測 / がん / がん細胞パネル / PI3K / 薬剤感受性 / 抗がん剤探索 / データベース |
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| Research Abstract |
がん細胞パネルについて化合物感受性情報とゲノム情報を集積し、化合物とその分子標的の対応関係の予測ならびに抗がん剤分子薬理研究に有用な情報を得るための基盤情報システム(Cancer Cell Infomatics、CCIと略)の構築と応用を行った。
1、CCIの構築本研究の中心となるJFCR39(9臓器由来のがん39株からなるがん細胞パネル)について新たに123種の阻害剤に対する感受性情報を取得した。JFCR45(胃がん21株、肝がん12株、乳がん12株からなるがん細胞パネル)について新たにGeneChipを用いゲノムワイドな遺伝子発現情報を取得した。以上の惰報を、昨年度作成した化合物感受性情報とゲノム情報の統合データベース(DRAMA)に加えた。DRAMAに登録された各々の化合物、遺伝子およびその産物は、いずれもがん細胞パネルを介したフィンガープリント(FPと略、詳細は調書参照)として描出される。FPの類似性を評価するプログラム(COMAPREおよびBIOCOMPARE)をバージョンアップした。FPの相互比較により、分子標的に共通性のある化合物の組み合わせ、あるいは、ミサイルと標的の関係にある化合物と遺伝子産物の組み合わせを予測することが本研究の狙いである。本年度もDRAMAのデータ量は着実に増加し、予測能力が向上した。
2、CCIの成果と応用CCIを155種の毒性化学物質評価に応用した。評価可能であった90化合物をFPに基づきクラスター解析した結果、同一クラスターに属するものは共通の作用メカニズムをもつ傾向が見られた。よって、CCIは毒性化学物質の作用メカニズム予測にも有用と考えられる。一方、CCIによって新たなメカニズムを持つことが示唆される新規抗がん剤候補物質が見出された。
次年度はDRAMAをさらに充実させ本研究を発展させる計画である。
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Research Products
(45 results)
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[Journal Article] Synthesis and structure-activity relationships of taxuyunnanine C derivatives as multidrug resistance modulator in MDR cancer cells2007
Author(s)
Hasegawa T, Bai J, Dai J, Bai L, Sakai J, Nishizawa S, Bai Y, Kikuchi M, Abe M, Yamori T, TomidaA, Tsuruo T, Hirose K, Ando M.
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Journal Title
Bioorganic&medicinal chemistry letters 17(13)
Pages: 3722-3728
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of JTP-70902,a p15(INK4b)-inductive compound,as a novel MEK1/2 inhibitor2007
Author(s)
Yamaguchi T, Yoshida T, Kurachi R, Kakegawa J, Hori Y, Nanayama T, Hayakawa K, Abe H, Takagi K, Matsuzaki Y, Koyama M, Yogosawa S, Sowa Y, Yamori T, Tajima N, Sakai T.
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Journal Title
Cancer science 98(11)
Pages: 1809-1816
Peer Reviewed
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[Presentation] EGFR signal pathways selectively activated in lung adenocarcinoma2007
Author(s)
Hiramatsu M, Ninomiya H, Inamura K, Okui M, Satoh Y, Fujiwara M, Yamori T, Kitagawa T, Ishikawa Y.
Organizer
The 98-th Am Assoc Cancer Res(AACR)Annual Meeting
Place of Presentation
Los Angeles,CA,U.S.A.
Year and Date
20070414-18
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[Book] 特集・制がん剤の分子標的スクリーニング成績「新しい戦略による抗がん剤のスクリーニングのための委員会」報告-制がん候補物質のスクリーニング成績・第11報-2007
Author(s)
矢守 隆夫, 安藤 俊夫, 上原 至雅, 小野 真弓, 河野 通明, 済木 育夫, 内藤 幹彦, 早川 洋一, 鶴尾 隆, 吉田 稔, 杉本 芳一, 馬島 哲夫
Total Pages
1-111
Publisher
癌と化学療法
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