2007 Fiscal Year Annual Research Report
ヒト糸球体の病態マイクロトランスクリプトームとマイクロプロテオーム解析
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17390247
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
山本 格 Niigata University, 医歯学系, 教授 (30092737)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
矢尾板 永信 新潟大学, 医歯学系, 准教授 (00157950)
吉田 豊 新潟大学, 医歯学系, 講師 (40182795)
田中 憲一 新潟大学, 医歯学系, 教授 (10126427)
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| Keywords | トランスクリプトーム / プロテオーム / 糸球体 / 遺伝子 / 蛋白質 / 二次元電気泳動 / データベース / 質量分析 |
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| Research Abstract |
1) マイクロトランスクリプトーム解析のヒト糸球体疾患腎生検試料への応用
ヒトIgA腎症などの慢性腎臓病の腎生検試料からマイクロダイセクション法により、糸球体RNAを抽出し、マイクロアレー法により、発現遺伝子解析を行い、平成18年度に作成した正常ヒト糸球体cDNAライブラリーの6,000クローンの遺伝子データベースと比較した。その結果、ヒト慢性腎臓病の糸球体でいくつかの興味深い新規の遺伝子が疾患関連遺伝子として検出された。
2) マイクロプロテオーム解析のヒト糸球体疾患腎生検試料への応用
ヒトIgA腎症などの慢性腎臓病の腎生検試料からマイクロダイセクション法により、糸球体タンパク質を抽出し、質量分析計を用いたショットガン法により、プロテオーム解析を行った。その結果を平成18年度に作成した正常糸球体タンパク質プロテオームと比較し、疾患に関連する可能性のあるタンパク質が挙げられた。
3) ヒト糸球体のトランスクリプトーム及びプロテオームデータベースの構築
マイクロトランスクリプトーム解析、マイクロプロテオーム解析で得られたデータを、従来から作成している正常ヒト糸球体トランスクリプトーム、プロテオームデータベースに統合し、IgA腎症などの慢性腎臓病の糸球体トランスクリプトーム、プロテオームデータベースを構築した。
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