2005 Fiscal Year Annual Research Report
臨床型DNAチップを用いた生検標本による大腸癌臨床診断システムの構築
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17591396
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
竹政 伊知朗 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (50379252)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184)
池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356)
関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
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| Keywords | 大腸癌 / DNAチップ / 遺伝子発現プロファイル / 遣伝子診断システム / 生検標本 |
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| Research Abstract |
本研究の目的は、DNAチップが持つ技術面、金銭面での問題点を改善し、これまでにわれわれが培ってきたcDNAマイクロアレイのノウハウを一般臨床に向け汎用化させて、内視鏡下生検標本を対象とした個々の癌の生物学的特性に対応した体系的診断・医療を実践することである。これまでに、ヒト全遺伝子に対して特異的配列をもったオリゴDNA(30000種類)を搭載したヒト全遺伝子型DNAチップを用い200例以上の大腸癌原発巣の遺伝子発現情報を取得するとともに、それぞれの症例の詳細な臨床病理情報をup dateしながら蓄積してきた。遺伝子発現情報と臨床病理情報のdata miningにより、従来の診断法では予測が困難であった転移・再発予後などの診断システムを確立するとともに、それぞれ関連遺伝子群の同定を行ってきた。
具体的には、1)平成17年度より術前内視鏡標本とその隣接生検病理情報、および手術切除標本と臨床病理学的情報を集積し、2)収集された大腸癌切除標本からmRNAを抽出し、超微量mRNA分析用マイクロラボチップによるquality checkを行なった上で、target DNA(臨床検体)の調整を進め、3)予備検討により決定されたプロトコールに従い一定条件下でヒト全遺伝子型オリゴDNAチップおよび臨床診断用DNAチップによる遺伝子情報を取得し、予測モデル式の構築と検証を繰り替えしその精度の向上を図るとともに、4)関連遺伝子群の同定による治療標的の抽出を行うことである。
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[Journal Article] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers.2006
Author(s)
Kurokawa Y, Honma K, Takemasa I, Nakamori S, Kita-Matsuo H, Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T, Monden M, Kato K.
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Journal Title
Int J Oncnl. 28(2)
Pages: 383-391
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[Journal Article] Prediction of recurrence in advanced gastric cancer patients after curative resection by gene expression profiling.2005
Author(s)
Motoori M, Takemasa I, Yano M, Saito S, Miyata H, Takiguchi S, Fujiwara Y, Yasuda T, Doki Y, Kurokawa Y, Ueno N, Oba S, Ishii S, Monden M, Kato K.
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Journal Title
Int J Cancer 114(6)
Pages: 963-968
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[Journal Article] DNAマイクロアレイを用いたトランスクリプトーム解析による腫瘍マーカーの探索2005
Author(s)
小森孝通, 竹政伊知朗, 山崎誠, 本告正明, 吉岡慎一, 小山太一, 池田正孝, 山本浩文, 関本貢嗣, (松原謙一), 門田守人
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Journal Title
日本分子腫瘍マーカー研究会誌 20
Pages: 76-77
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