臨床型DNAチップを用いた生検標本による大腸癌臨床診断システムの構築

2006 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17591396
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 竹政 伊知朗 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (50379252)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184) ; 池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356) ; 関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
• Keywords: 大腸癌 / DNAチップ / 遺伝子発現プロファイル / 遺伝子診断システム / 生検標本

Research Abstract

本研究の目的は、DNAチップが持つ技術面、金銭面での問題点を改善し、これまでにわれわれが培ってきたcDNAマイクロアレイのノウハウを基に一般臨床への汎用化により、内視鏡下生検標本を対象とした個々の癌の生物学的特性に対応した体系的診断・医療を実践化することである。これまでに、ヒト全遺伝子に対して特異的配列をもったオリゴDNA(30000種類)を搭載したヒト全遺伝子型DNAチップを用い200例以上の大腸癌の遺伝子発現情報を取得し、転移・再発予後・再発形式の予測診断システムを確立するとともに、それぞれ関連遺伝子群の同定を行っている。
具体的には、1)平成17年度より術前内視鏡標本とその隣接生検病理情報、および手術切除標本と臨床病理学的情報を集積し、2)収集された大腸癌切除標本からmRNAを抽出し、超微量mRNA分析用マイクロラボチップによるquality checkを行なった上で、target DNA(臨床検体)の調整を進め、3)予備検討により決定されたプロトコールに従い一定条件下でヒト全遺伝子型オリゴDNAチップおよび臨床診断用DNAチップによる遺伝子情報を取得し、予測モデル式の構築と検証を繰り替えしすすめている。現在までに同一症例の腫瘍と正常部分から採取された2ヶ所の生検標本の解析より、腫瘍内組織不均性は腫瘍間組織差異より小さく、一ヶ所の生検でその腫瘍の代表的遺伝子発現プロファイルを取得できること、また正常、腺腫、癌の違いはほぼ完全に判別可能であることがわかった。

Research Products

• [Journal Article] Hypoxia-induced up-regulation of angiopoietin-2 in colorectal cancer. (2006)
  • Author(s): Gu J., Yamamoto H., Ogawa M., Ngan C.Y., Danno K., Hemmi H., Kyo N., Takemasa I., Ikeda M., Sekimoto M., Monden M.
  • Journal Title: Oncol Rep 15(4) Pages: 779-783
• [Journal Article] Central genetic alterations common to all HCV-positive, HBV-positive and non-B, non-C hepatocellular carcinoma : a new approach to identify novel tumor markers. (2006)
  • Author(s): Kurokawa Y., Honma K., Takemasa I., Nakamori S., Kita-Matsuo H., Motoori M, Nagano H, Dono K, Ochiya T., Monden M, Kato K.
  • Journal Title: Int J Oncol 28(2) Pages: 383-391
• [Journal Article] Construction of a novel DNA decoy that inhibits the oncogenic beta-catenin/T-cell factor pathway. (2006)
  • Author(s): Seki Y, Yamamoto H, Yee Ngan C, Yasui M, Tomita N, Kitani K, Takemasa I, Ikeda M, Sekimoto M, Matsuura N, Albanese C, Kaneda Y, Pestell RG, Monden M.
  • Journal Title: Mol Cancer Ther 5(4) Pages: 985-994
• [Journal Article] Antisense to cyclin D1 inhibits vascular endothelial growth factor-stimulated growth of vascular endothelial cells : implication of tumor vascularization. (2006)
  • Author(s): Yasui M, Yamamoto H., Ngan CY., Damdinsuren B., Sugita Y., Fukunaga H., Gu J., Maeda M., Takemasa I., Ikeda M., Fujio Y., Sekimoto M., Matsuura N., Weinstein IB., Monden M.
  • Journal Title: Clin Cancer Res 12(15) Pages: 4720-4729
• [Journal Article] Prediction of peritoneal metastasis in advanced gastric cancer by gene expression profiling of the primary site. (2006)
  • Author(s): Motoori M., Takemasa I., Doki Y., Saito S., Miyata H., Takiguchi S., Fujiwara Y., Yasuda T., Yano M., Kurokawa Y., Komori T., Yamasaki M., Ueno N., Oba S., Ishii S., Monden M., Kato K.
  • Journal Title: Eur J Cancer 42 Pages: 1897-1903
• [Journal Article] Expression and Mutation of SMAD4 in poorly Differentiated Carcinoma and Signet-ring Cell Carcinoma of the Colorectum. (2006)
  • Author(s): Seshimo I, Yamamoto H., Mishima H., Kurata A., Suzuki R., Ezumi K., Takemasa I., Ikeda M., Fukushima T., Tujinaka T., Sekimoto M., Kikkawa N., Takenoshita S., Monden M
  • Journal Title: J. Exp. Clin. Cancer Res 25 Pages: 433-442
• [Journal Article] Low-dose oxaliplatin enhances the antitumor efficacy of paclitaxel in human gastric cancer cell lines. (2006)
  • Author(s): Gu J., Yamamoto H., Lu X., Ngan CY., Tsujino T., Konishi K., Takemasa I., Ikeda M., Nagata H., Hashimoto S., Matsuzaki T., Sekimoto M., Takagi A., Monden M.
  • Journal Title: Digestion 74(1) Pages: 19-27
• [Journal Article] Expression of PPARdelta in multistage carcinogenesis of the colorectum : implications of malignant cancer morphology. (2006)
  • Author(s): Takayama O., Yamamoto H., Damdinsuren B., Sugita Y., Ngan CY., Xu X., Tsujino T., Takemasa I, Ikeda M., Sekimoto M., Matsuura N., Monden M.
  • Journal Title: Br J Cancer 95(7) Pages: 889-895
• [Journal Article] Correlation of GLUT-1 Overexpression, Tumor Size, and Depth of Invasion with 18F-2-fluoro-2-deoxy-D : -glucose Uptake by Positron Emission Tomography in Colorectal Cancer. (2006)
  • Author(s): Gu J., Yamamoto H, Fukunaga H, Danno K, Takemasa I, Ikeda M, Tatsumi M, Sekimoto M, Hatazawa J, Nishimura T, Monden M.
  • Journal Title: Dig Dis Sci 11(3) Pages: 2198-2205
• [Journal Article] Involvement of ribonucleotide reductase M1 subunit overexpression in gemcitabine resistance of human pancreatic cancer. (2006)
  • Author(s): Nakahira S, Nakamori S., Tsujie M., Takahashi Y., Okami J., Yoshioka S., Yamasaki M., Marubashi S., Takemasa I., Miyamoto A., Takeda Y., Nagano H., Dono K., Umeshita K., Sakon M., Monden M.
  • Journal Title: Int J Cancer 27 120(6) Pages: 1355-1363