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2005 Fiscal Year Annual Research Report

低分子量Gタンパク質Rabをゲノムワイドで網羅的に解析するツールの開発

Research Project

Project/Area Number 17657067
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

福田 光則  独立行政法人理化学研究所, 福田独立主幹研究ユニット, 独立主幹研究員 (50311361)

Keywords低分子量G蛋白質 / Rab / Rabエフェクター / 膜輸送 / dominant active / dominant negative / ゲノムワイド / 網羅的解析
Research Abstract

真核細胞生物の細胞内はさらに膜で包まれたオルガネラにより満たされており、主に膜輸送を介してオルガネラ同士で頻繁に物質のやり取りを行っている。低分子量Gタンパク質Rabファミリーは膜輸送に関与する分子群としては最大のもので、哺乳動物においては約60種類ものアイソフォームが存在している。各々のRabは特定の膜輸送を制御すると考えられているが、12番以降のRabアイソフォームになるといつどこで何を運ぶのかに関してはほとんど解明されていない。Rabは活性化型固定化(dominant active, DA)変異体あるいは不活性化型固定化(dominant negative, DN)変異体を作成することが出来るため、特定の膜輸送に対する影響を検討することが可能であるが、ある種の受容体が未知のRabにより細胞膜に輸送される場合には、60種類全てのRabクローンに対してDA/DN変異体を作成する必要があり、60種類のうちどのRabが関与するのかを調べることはこれまで不可能であった。このため世界的にRabを網羅的に解析するツールのニーズが高まってきている。そこで本研究ではマウス及びヒトに存在する60種類のRabを全てクローニングし、これらのRabの機能を網羅的に解析するツール(「Rab bank」)を作成することを目指した。本年度は60種類のRabに対するDA変異体及びDN変異体を全て作成し、緑色蛍光蛋白質(GFP)タグ、FLAGタグを付加した発現ベクター、及び酵母two-hybrid用のベクターを構築した。

  • Research Products

    (24 results)

All 2006 2005

All Journal Article (23 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Distinct developmental expression of synaptotagmin I and IX in the mouse brain.2006

    • Author(s)
      Fukuda, M.
    • Journal Title

      NeuroReport 17

      Pages: 179-182

  • [Journal Article] O-glycosylation is essential for intracellular targeting of synaptotagmins I and II in non-neuronal specialized secretory cells.2005

    • Author(s)
      Atiya-Nasagi, Y., Cohen, H., Medalia, O., Fukuda, M., Sagi-Eisenberg, R.
    • Journal Title

      J.Cell Sci. 118

      Pages: 1363-1372

  • [Journal Article] Classical protein kinase C(s) regulates targeting of synaptotagmin IX to the endocytic recycling compartment.2005

    • Author(s)
      Haberman, Y, Ziv, I., Gorzalczany, Y., Fukuda, M., Sagi-Eisenberg, R.
    • Journal Title

      J.Cell Sci. 118

      Pages: 1641-1649

  • [Journal Article] Functional analysis of Slac2-c/MyRIP as a linker protein between melanosomes and myosin VIIa.2005

    • Author(s)
      Kuroda, T.S., Fukuda, M.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 28015-28022

  • [Journal Article] AS160, the Akt substrate regulating GLUT4 translocation, has a functional Rab GTPase activating protein domain.2005

    • Author(s)
      Miinea, C.P., Sano, H., Kane, S., Sano, E., Fukuda, M., Peranen, J., Lane, W.S., Lienhard, G.E.
    • Journal Title

      Biochem.J. 391

      Pages: 87-93

  • [Journal Article] Protein Kinase C-mediated phosphorylation of the two polybasic regions of synaptotagmin VI regulates their function in acrosomal exocytosis.2005

    • Author(s)
      Roggero, C.M., Tomes, C.N., De Blas, G.A., Castillo, J., Michaut, M.A., Fukuda, M., Mayorga, L.S.
    • Journal Title

      Dev.Biol. 285

      Pages: 422-435

  • [Journal Article] Adenovirus-mediated silencing of Synaptotagmin 9 inhibits Ca^<2+>-dependent insulin secretion in islets.2005

    • Author(s)
      Iezzi, M., Eliasson, L., Fukuda, M., Wollheim, C.B.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 579

      Pages: 5241-5246

  • [Journal Article] Rab proteins regulate epithelial sodium channel activity in colonic epithelial HT-29 cells.2005

    • Author(s)
      Saxena, S., Singh, M., Engisch, K., Fukuda, M., Kaur, S.
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 337

      Pages: 1219-1223

  • [Journal Article] The short apical membrane half-life of rescued ΔF508-cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) CFTR results from accelerated endocytosis of ΔF508-CFTR in polarized human airway epithelial cells.2005

    • Author(s)
      Swiatecka-Urban, A., Brown, A., Moreau-Marquis, S., Renuka, J., Coutermarsh, B., Barnaby, R., Karison, K.H., Flotte, T.R., Fukuda, M., Langford, G.M., Stanton, B.A.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 36762-36772

  • [Journal Article] Slp4-a/granuphilin-a interacts with syntaxin-2/3 in a Munc18-2-dependent manner.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M., Imai, A., Nashida, T., Shimomura, H.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 39175-39184

  • [Journal Article] The C2B domain of rabphilin directly interacts with SNAP-25 and regulates the docking step of dense core vesicle exocytosis in PC12 cells.2005

    • Author(s)
      Tsuboi, T., Fukuda, M.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 280

      Pages: 39253-39259

  • [Journal Article] Cloning and genomic characterization of sytdep, a new synaptotagmin XIV-related gene.2005

    • Author(s)
      Herrero-Turrion, M.J., Fukuda, M., Mollinedo, F.
    • Journal Title

      Biocheim.Biophys.Res.Commun. 340

      Pages: 386-394

  • [Journal Article] Slp homology domain : A novel protein motif that specifically binds small GTPase Rab27.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M.
    • Journal Title

      Recent Res.Dev.Biochem. 6

      Pages: 13-29

  • [Journal Article] Versatile role of Rab27 in membrane trafficking : Focus on the Rab27 effector families.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M.
    • Journal Title

      J.Biochem. 137

      Pages: 9-16

  • [Journal Article] Functional analysis of Slac2-a/melaonophilin as a linker protein between Rab27A and myosin Va in melanosome transport.2005

    • Author(s)
      Kuroda, T.S., Itoh, T., Fukuda, M.
    • Journal Title

      Methods Enzymol. 403

      Pages: 419-431

  • [Journal Article] Identification and biochemical analysis of Slac2-c/MyRIP as a Rab27-, myosin Va/VIIa-, and actin-binding protein.2005

    • Author(s)
      Kuroda, T.S., Fukuda, M.
    • Journal Title

      Methods Enzymol. 403

      Pages: 431-444

  • [Journal Article] Analysis of the role of Rab27 effector Slp4-a/granuphilin-a in dense-core vesicle exocytosis.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M., Kanno, E.
    • Journal Title

      Methods Enzymol. 403

      Pages: 445-457

  • [Journal Article] Assay and functional interactions of Rim2 with Rab3.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M.
    • Journal Title

      Methods Enzymol. 403

      Pages: 457-468

  • [Journal Article] Assay of Rab binding specificity of rabphilin and Noc2 : Target molecules for Rab27.2005

    • Author(s)
      Fukuda, M., Yamamoto, A.
    • Journal Title

      Methods Enzymol. 403

      Pages: 469-481

  • [Journal Article] Slac2-aとSlp2-a:メラニン色素輸送のしくみ2005

    • Author(s)
      福田光則
    • Journal Title

      医学のあゆみ 212

      Pages: 769-770

  • [Journal Article] シナプトタグミンと類似タンパク質による膜輸送制御の分子メカニズム2005

    • Author(s)
      福田光則
    • Journal Title

      生化学 77

      Pages: 603-618

  • [Journal Article] 「メラニン色素」輸送の分子メカニズム:肌や髮の毛が黒くなる仕組み2005

    • Author(s)
      福田光則
    • Journal Title

      日皮協ジャーナル 54

      Pages: 60-66

  • [Journal Article] 美白への新たなアプローチ-メラニン輸送をストップさせる-2005

    • Author(s)
      黒田垂歩, 福田光則
    • Journal Title

      BIONICS 2(11)

      Pages: 68-71

  • [Book] アンチ・エイジングシリーズ1「白髪・脱毛・育毛の実際」メラニン色素輸送メカニズムの解明2005

    • Author(s)
      福田光則, 黒田垂歩
    • Total Pages
      221-235
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス

URL: 

Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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