2007 Fiscal Year Annual Research Report
シロイヌナズナのタグラインを用いた核コードの葉緑体タンパク質遺伝子の網羅的解析
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17681022
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| Research Institution | Shizuoka University |
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Principal Investigator |
本橋 令子 Shizuoka University, 農学部, 准教授 (90332296)
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| Keywords | 葉緑体 / アルビノ / シロイヌナズナ / メタボローム解析 / プロテオーム解析 |
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| Research Abstract |
1)得られたalbino orpale green(apg)変異体の多くの原因遺伝子がmRNAの安定性、プロセッシングに関与するものであった。今後、これらの原因遺伝子の機能解析を進め、核コード葉緑体タンパク質による葉緑体ゲノム遺伝子の転写後調節の研究に大きく貢献する。また、収集した葉緑体タンパク質遺伝子の破壊株を用いて、様々なスクリーニングを行った結果、老化やクロロフィル分解に関係する変異体は単離することはできなかったが、共同研究者によって、葉緑体遺伝子のeditingfactorとクロロフィル合成系に関与する変異体が単離された。
2)メタボロミクス解析:フーリエ変換イオンサイクロトロン型質量分離装置FT-MSを用い、apg変異体の網羅的な代謝物プロファイリングにより、フェノタイピングを行なった。さらに、GC-MSを用いapg変異体よりメタボロームデータを得、メタボロオームデーターとアジレントのマイクロアレーを用いたトランスクリプトームデータの統合し、アルビノ原因遺伝子の機能解析を行なった。apg変異体のメタボロミクスデータにより、グループ分けし、その分類体系が想定される当該遺伝子機能と一致するか検討したが、代謝系の遺伝子の変異体と葉緑体の形態形成に関与する遺伝子の変異体をわけることができたが、葉緑体の形態形成遺伝子間の顕著なメタボロミクスデータの違いは検出できなかった。
3)プロテオーム解析:apg変異体のプラスチドを単離し、野生型の葉緑体タンパク質と比較を行い、原因遺伝子の機能を類推する。植物体から単離したプラスチドより、タンパク質を抽出し2D-PAGEを用い、変異体と野生型の葉緑体タンパク質の比較を行ない、異なるタンパク質のスポットの同定をMALDI-TOF MS法により行った。
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Research Products
(16 results)
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[Journal Article] Chloroplast ribosome release factor 1 (AtcpRF1) is essential fcr chloroplast development2007
Author(s)
Reiko MOTOHASHI, Takanori YAMAZAKI, Fumiyoshi MYOUGA, Takuya ITO, Koichi ITO, Masakazu SATOU, Masatomo KOBAYASHI, Noriko NAGATA, Shigeo YOSHIDA, Akitomo NAGASHIMA, Kan TANAKA, Seiji TAKAHASHI, and Kazuo SHINOZAKI
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Journal Title
Plant Molecular Biology 64
Pages: 481-497
Peer Reviewed
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[Presentation] アルビノ変異体の解析から探る葉緑体機能2007
Author(s)
本橋令子^1, 板山俊一^1, 加藤智子^1, 高橋祥子^1, 松浦匡輔^1, 原美由紀^1, 及川彰^2, 太田大策^2, 佐藤将一^3, 明賀史純^3, 篠崎一雄^3
Organizer
第7回日本光合成研究会 シンポジュウム
Place of Presentation
岡山
Year and Date
20070525-26
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