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2007 Fiscal Year Annual Research Report

原子レベルでの構造解析に基づくウィルスのDNAパッケージングモーターの動作基盤

Research Project

Project/Area Number 17687014
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

金丸 周司  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (50376951)

Keywords蛋白質 / ウイルス / 分子機械 / 複合体
Research Abstract

本研究は、T4ファージを対象として、DNAがウィルス頭殻に詰め込まれる現象を原子レベルで明らかにしようとするものである。本年度の成果は下記の通りである:
1.ネック蛋白質の発現・精製
ネック蛋白質(gp13,gp14)について、発現・精製を行った。gp13,gp14はそれぞれ、単独で精製することに成功し、それぞれが単量体で存在することがわかった。また、0.4M以上濃度の硫酸アンモニウム存在下で二つの蛋白質を混合すると、(gp13)_<10>-(gp14)_5からなる複合体が形成することがわかった。
2.ネック蛋白質の物理化学的解析
上記(gp13)_<10>-(gp14)_5の電子顕微鏡観察、超遠心分析を行いこの複合体が溶液中で均一のリング状の構造を持ち、ファージ粒子中に存在する複合体であることを示した。
3.結晶化、構造解析
gp13,(gp13)_<10>-(gp14)_5について、結晶化に適した精製試料を用いて結晶化を試みている。具体的には、市販のグローバルな結晶化条件スクリーニングキットを用いて、蒸気拡散法により結晶化条件の初期検索を行っている。現在、構造解析に向けて充分な質と大きさを持った結晶を得るための条件を探索中である。

  • Research Products

    (21 results)

All 2008 2007

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (15 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Molecular design of heteroprotein assemblies providing a bionanocup as a chemical reactor.2008

    • Author(s)
      Koshiyama T, Yokoi N, Ueno T, Kanamaru S, Nagano S, Shiro Y, Arisaka F, Watanabe Y.
    • Journal Title

      Small 4

      Pages: 50-54

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] From structure of the complex to understanding of the biology.2007

    • Author(s)
      Rossmann MG, Arisaka F, Battisti AJ, Bowman VD, Chipman PE, Fokine A, Hafenstein S, <Kanamaru S, Kostyuchenko VA, Mesyanzhinov VV, Shneider MM, Morais MC, Leiman PG, Palermo LM, Parrish CR, Xiao C.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 63

      Pages: 9-16

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The neck of bacteriophage T4 is a ring-like structure formed by a hetero-oligomer of gpl3 and gpl4.2007

    • Author(s)
      Akhter T, Zhao L, Kohda A, Mio K, Kanamaru S, Arusaka F.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta. 1774

      Pages: 1036-1043

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バクテリオファージの構造生物学2007

    • Author(s)
      金丸周司、有坂文雄
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 52

      Pages: 1069-1074

  • [Journal Article] ウイルスに見られる新しいβ構造モチーフ2007

    • Author(s)
      金丸周司、有坂文雄
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 49

      Pages: 161-170

  • [Presentation] T4ファージの構造生物学と感染機構2008

    • Author(s)
      金丸周司
    • Organizer
      第81回日本細菌学会年会
    • Place of Presentation
      京都国際会館
    • Year and Date
      20080324-26
  • [Presentation] PP01ファージの尾繊維タンパク質gp38,gp37の解析2007

    • Author(s)
      堀越祐介、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20071218-19
  • [Presentation] 長さ・太さの制御可能な三本鎖βヘリックスタンパク質の作製2007

    • Author(s)
      寺内允、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20071218-19
  • [Presentation] T4ファージ基盤蛋白質gp48の可溶化と性状解析2007

    • Author(s)
      伊藤麻砂子、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20071218-19
  • [Presentation] Foldon fusion to the C-tenninal-truncated mutant proteins of gp34, the proximal half tail fiber of bacteriophage T4 to facilitate trimer formation.2007

    • Author(s)
      Donny Sunanda、 金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20071218-19
  • [Presentation] 4ファージ基盤構成蛋白質gp7,gplO,gpllの相互作用部位の同定2007

    • Author(s)
      中尾朋子、長尾達也、金丸周司、 有坂文雄
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] T4ファージ基盤終結蛋白質gp48,gp54の大量発現系の構築と性状解析2007

    • Author(s)
      伊藤麻砂子、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071211-15
  • [Presentation] T4ファージ基盤蛋白質群の断片化複合体の結晶化の試み2007

    • Author(s)
      中尾朋子、長尾達也、金丸周司有坂文雄
    • Organizer
      第3回「生体超分子構造」ワークショップ.
    • Place of Presentation
      熱海.
    • Year and Date
      20070711-13
  • [Presentation] 可変長人工βヘリックス構造の性状解析2007

    • Author(s)
      寺内允、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      第3回「生体超分子構造」ワークショップ.
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      20070711-13
  • [Presentation] T4ファージ基盤終結蛋白質gp48、gp54の大量発現系の構築と性状解析2007

    • Author(s)
      伊藤麻妙子、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      第3回「生体超分子構造」ワークショップ
    • Place of Presentation
      熱海.
    • Year and Date
      20070711-13
  • [Presentation] Crystallization of the C-terminal-truncated mutant proteins of gp34, the proximal half tail fiber of bacteriophage T42007

    • Author(s)
      Donny Sunanda、金丸周司、有坂文雄
    • Organizer
      第3回「生体超分子構造」ワークショップ.
    • Place of Presentation
      熱海.
    • Year and Date
      20070711-13
  • [Presentation] T4類縁ファージのgp5ホモログ蛋白質の性状解析と結晶化2007

    • Author(s)
      根本舞、油井孔兵、金丸周司、 有坂文雄
    • Organizer
      第3回「生体超分子構造」ワークショップ.
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      20070711-13
  • [Presentation] バクテリオファージT4尾部の膜貫通機構2007

    • Author(s)
      二島渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会.
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] Consruction and purification of N terminal of the proximal long tail fiber, gp34, of Bacteriophage T42007

    • Author(s)
      Donny Sunanda、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会.
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Presentation] T4ファージ基盤構成蛋白質群のドメイン構造と相互作用部位の同定2007

    • Author(s)
      中尾朋子、長尾達也、金丸周司有坂文雄
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会.
    • Place of Presentation
      仙台国際センター
    • Year and Date
      20070524-26
  • [Book] バイオナノプロセスー溶液中でナノ構造を作るウェット・ナノテクノロジーの薦めー2008

    • Author(s)
      山下一郎、芝 清隆、河村秀樹、三浦篤志、金丸周司、鈴木治和、臼井健悟、林崎良英、岩場健治、安部 聡、上野隆史、小林未明、塚本里加子、杉本健二、柏木健司、佐野健一、梅津光央、芹澤 武、松野寿生、松浦和則、高谷 光、磯崎勝弘、芳賀祐輔、上杉 隆、中谷昭彦、直田 健、村田 智、齊藤博英、井上 丹、佐々木善浩、田 文杰、菊池純一、浦岡行治、桐村浩哉、冬木 隆、熊谷慎也、吉井重雄、寒川誠二、鈴木直毅、安立京一、李 奉局、川合知二、一木隆範、マニッシュ・ビヤニ、根本直人、松尾保孝、居城邦治、田畑 仁、松井 宏、松村幸子、湯田坂雅子、飯島澄男、南野 徹、難波啓一、北野宏明、木賀大介、上田昌宏、高木拓明、新井由之、冨樫祐一、柳田敏雄
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      シーエムシー出版

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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