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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Photonic and electrochemical based dengue serotype-specific detection using carbon quantum dots

Research Project

Project/Area Number 17F17359
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

朴 龍洙  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 教授 (90238246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) DUTTA CHOWDHURY ANKAN  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2017-11-10 – 2020-03-31
Keywordsカーボン量子ドット / ウイルス検出 / デングウイルス / 示差パルスボルタンメトリー / 蛍光検出 / DNA
Outline of Annual Research Achievements

デングウイルス(DENV)は蚊によって媒介され、東南アジアを始め世界的感染が広がる可能性の高い感染症の原因ウイルスである。しかしDENVの検出法は、主に逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)に頼っている。一般にリアルタイムPCR法は、高価で、複雑な操作が必要なため高度の経験者でないと使用できない場合が多い。DENVの場合、4種類の血清型が存在し、2回目に異なる血清型のDENVに感染された場合、病状が重篤化されるため、ウイルスの検出と同時に血清型の判別は非常に大事である。
本研究では、DENVの定量と血清型の判別を同時に行う2重検出手法の開発を目指した。金ナノ粒子(AuNP)と窒素、硫黄を塗布したグラフェン量子ドット(N、S-GQDs)から成るナノ複合体(N、S-GQDs @ AuNP)を作製し、N、S-GQDs @ AuNPの表面にはアデニン10残基を修飾した。一方、4種類の血清型特異的20塩基配列にそれぞれ異なる4つの蛍光色素を標識した4種類のDENVプローブを作製した。血清型に合う塩基配列の存在下では、N、S-GQDs @ AuNPとDENVプローブはハイブリダイズするので、未反応のプローブを洗浄することで、特異的な蛍光を得ることができる。また、酸化還元指示薬としてメチレンブルーを用いた示差パルスボルタンメトリー(DPV)によるDNAを定量化することができる。この様な手法で、N、S-GQD @ AuNPが4つのDENV血清型を効率的に判別することができ、さらにその検出限界は、9.4 fMであった。本検出法は、臨床的に分離されたDENV DNAにも適用され、満足できる性能を示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本研究が成功するために、ナノ複合体(N、S-GQDs @ AuNP)と4種類のDENVプローブのどちらのプローブにDENVの遺伝子が結合し、未反応の蛍光プローブを完全に洗浄する必要がある。作製したN、S-GQDs @ AuNPの諸性質は各種機器を用いて求める性質が確認できた。さらに示差パルスボルタンメトリーの応答が明確であり、その応答がDNAの結合量に比例したので定量化が可能であった。本研究のDENVの検出の成果は、血清型の判別と同時に検出可能な検出系として、世界初めてであり、計画以上の進捗であると判断できる。

Strategy for Future Research Activity

本検出システムを用いてウイルスを検出し、問題点を改善し、キット化を目指す。
1.ウイルス検出に必要なパラメーターを設定し、定量的に検出できる手法を確立する。検出感度、ウイルスに対する選択性及び抗体の交差反応を確認しながら、最適検出条件を確立する。
2.上記の研究で確立したプロトコールに従い、デングウイルス様粒子をウイルス材料として検出を行う。検出が可能であれば、検出系の安定性をチェックしながら、臨床用ウイルスを検出する。このような検出の成果を特許や論文に発表しながら、民間企業とキット化を目指す。

  • Research Products

    (14 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Femtomolar detection of dengue virus DNA with serotype identification ability2018

    • Author(s)
      Ankan Dutta Chowdhury, Akhilesh Babu Ganganboina, Fahmida Nasrin, Kenshin Takemura, Ruey-an Doong, Doddy Irawan Setyo Utomo, Jaewook Lee, Indra Memdi Khoris, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      ACS Anal. Chem.

      Volume: 90 Pages: 12464-12474

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.8b01802

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of an effective electrochemical platform for highly sensitive DNA detection using MoS2-polyaniline nanocomposites2018

    • Author(s)
      Shibsankar Dutta, Ankan Dutta Chowdhury, Sangita Biswas, Enoch Y. Park, Nidhi Agnihotri, Amitabha De, Sukanta De
    • Journal Title

      Biochem. Eng. J.

      Volume: 140 Pages: 130-139

    • DOI

      10.1016/j.bej.2018.09.016

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Single-step detection of norovirus tuning localized surface plasmon resonance-induced optical signal between gold nanoparticles and quantum dots2018

    • Author(s)
      Nahmida Nasrin, Ankan Dutta Chowdhury, Kenshin Takemura, Jaewook Lee, Oluwasesan Adegoke, Vipin Kumar Deo, Fuyuki Abe, Tetsuro Suzuki, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      Biosens. Bioelectron.

      Volume: 122 Pages: 16-24

    • DOI

      10.1016/j.bios.2018.09.024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impedimetric biosensor for detection of cancer cells employing carbohydrate targeting ability of Concanavalin A2018

    • Author(s)
      Ankan Dutta Chowdhury, Akhilesh Babu Ganganboina, Enoch Y. Park, Ruey-an Doong
    • Journal Title

      Biosens. Bioelectron.

      Volume: 122 Pages: 95-103

    • DOI

      10.1016/j.bios.2018.08.039

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Highly sensitive detection of Influenza virus based on LSPR by fluorescent quantum dots and adjacent peptide conjugated gold nanoparticles2019

    • Author(s)
      Fahmida Nasrin, Ankan Dutta Chowdhury, Kenshin Takemura, Hiroyuki Honda, Enoch Y. Park
    • Organizer
      The 5th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of electrochemical sensing platform for Hepatitis E virus (HEV) using graphene quantum dots and gold-polyaniline nanocomposites2019

    • Author(s)
      Kenshin Takemura, Ankan Dutta Chowdhury, Tian-Cheng Li, Tetsuro Suzuki, Enoch Y. Park
    • Organizer
      The 5th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電気化学バイオセンサーによるE型肝炎ウイルス様粒子の高感度かつ迅速な検出法の開発2019

    • Author(s)
      Kenshin Takemura, Ankan Dutta Chowdhury, Tian-Cheng Li, Tetsuro Suzuki, Enoch Y. Park
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] A fluorometric biosensor for serotype specific Dengue detection2019

    • Author(s)
      Ankan Dutta Chowdhury, Kenshin Takemura, Fahmida Nasrin, Indra M Khorish, Enoch Y. Park
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] Detection of Influenza virus by controlling the distance of fluorescent quantum dots and adjacent gold nanoparticles2019

    • Author(s)
      Fahmida Nasrin, Ankan Dutta Chowdhury, Kenshin Takemura, Hiroyuki Honda, Enoch Y. Park
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] Ultrasensitive electrochemical immunoassay of Norovirus2019

    • Author(s)
      Kenshin Takemura, Ankan Dutta Chowdhury, Enoch Y. Park
    • Organizer
      Sakura-Bio Meeting 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A multi-functional binary nanoparticles/carbon nanomaterial hybrid structures for biosensing platforms2018

    • Author(s)
      Jaewook Lee, Kenshin Takemura, Ankan Dutta Chowdhur, Enoch Y Park
    • Organizer
      ナノ学会第16回大会
  • [Presentation] A label free sensing system for the detection of Dengue virus serotype2018

    • Author(s)
      Ankan Dutta Chowdhury, Nasrin Famida, 竹村謙信、Indra M. Khoris, Jaewook Lee、 朴 龍洙
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
  • [Presentation] Highly sensitive detection of norovirus-like particles using KSPR behavior CdSeTeS QDs and AuNPs2018

    • Author(s)
      Nasrin Famida, Ankan Dutta Chowdhury, 竹村謙信、Jaewook Lee、Oluwasesan Adegoke, Vipin Kumar Deo、鈴木哲朗、 朴 龍洙
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
  • [Remarks] 静岡大学生物工学研究室

    • URL

      http://www.agr.shizuoka.ac.jp/c/biotech/

URL: 

Published: 2019-12-27  

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