2019 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of rDNA copy number monitoring system
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17H01443
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小林 武彦 東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (40270475)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 相同組換え / リボソームRNA遺伝子 / 遺伝子増幅 / ゲノムの安定性 / 転写抑制 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
翻訳を担うリボソームは細胞内のタンパク質の半分以上を占め、その量を安定に維持することはすべての細胞にとって重要である。リボソームRNAをコードする遺伝子（リボソームRNA遺伝子）は、真核細胞では100コピー以上がタンデムに連なった巨大反復遺伝子群を形成している。リボソームを安定供給するためにはリボソームRNA遺伝子のコピー数の維持は必須である。しかしコピー間での組換えにより常にコピーを失っている。本申請研究では、コピー数の低下を感知して、増幅組換えを誘導し、そして一定のコピー数で増幅を停止させるコピー数調節機構の解明を目指す
前年度までにリボソームRNA遺伝子のコピー数をカウントする因子として、リボソームRNA遺伝子の転写の活性化因子UAF複合体を同定した。さらにリボソームRNA遺伝子の低コピー株で、UAF複合体がSIR2のプロモーターに結合していることを見出している。本年度は当初の計画通り、UAF複合体がSIR2の転写を抑制する作用機序について解析した。方法としては、それぞれのUAFにマイクロコッカスのヌクレアーゼドメインを融合したタンパク質を細胞内で発現させ、切断断片の長さから結合領域を同定した。その結果、UAF複合体はSIR2のORFから-200bpのTATA box上流付近に集中していることがわかった。さらにプロモーターの欠損解析を行ったところ、-200bp付近の20bpの領域を削ったプロモーターではrDNA低コピー株でもSIR2の転写を抑制しないことが判明した。また、その20bpの配列は、SIR2以外の遺伝子のプロモーターでも転写抑制効果を示すことが判明した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
UAFが結合してSIR2の転写を抑えるプロモーター配列の同定に成功した。さらにその配列が他の遺伝子でも同様の抑制機能をもつことを発見した。
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| Strategy for Future Research Activity |
今回同定した配列が、実際にリボソームRNA遺伝子のコピー数が低下した株でSIR2の発現を抑制し、コピー数の回復を誘導しているのか検証する。
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Research Products
(12 results)
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[Journal Article] rDNA condensation promotes rDNA separation from nucleolar proteins degraded for nucleophagy after TORC1 inactivation.2019
Author(s)
Mostofa M.G, Morshed, S.,Shibata, R., Takeichi, Y., Rahman, M.A., Hosoyamada, S, Kobayashi T, and Ushimaru T.
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Journal Title
Cell Reports
Volume: 28, 3423-3434
Pages: 3423-3434
DOI
Peer Reviewed
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