2020 Fiscal Year Annual Research Report
| Project/Area Number |
17H01519
|
|---|
| Research Institution | University of Tsukuba |
|---|
Principal Investigator |
深水 昭吉 筑波大学, 生存ダイナミクス研究センター, 教授 (60199172)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
|
| Keywords | RNAメチル化 / 寿命 / tRNA / rRNA / 線虫 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
今年度の研究実績として、tRNA iMetおよびeMetの相補ssDNA配列を固相化し、細胞から調製したRNA抽出液と混合することで、各tRNAを特異的に精製する方法を確立した。この技術を線虫の分子遺伝学と組み合わせることで、W02A11.1遺伝子がコードするタンパク質が、tRNAの中でも特に翻訳効率に影響するiMetおよびeMetの58番目のアデニンの1位のメチル化を触媒することを見出した。一方、哺乳類で同部位を脱メチル化する酵素として知られるALKB-1の線虫オルソログalkb-1をノックダウンした線虫のm1Aを、上記の方法で定量的に解析したところ、若干の増加傾向が認められた。またW02A11.1遺伝子については、線虫のL1幼虫期および成虫期からのノックダウンでいずれも有意な寿命延長が認められていたが、同時に健康寿命の指標である運動機能の上昇やストレス耐性の亢進をもたらすことが示された。
昨年度に引き続き、既存のDNA/RNA脱メチル化酵素の一次構造からノックダウンライブラリーを構築し、tRNAを基質とする新規脱メチル化活性のスクリーニングを展開してきたが、有力な候補遺伝子は得られなかった。一方で新たな取り組みとして、RNAメチル化酵素自身のタンパク質メチル化による活性制御の可能性に着目し、任意のタンパク質を精製後に酸加水分解処理し、そこに含まれるメチルアミノ酸をLC-MS/MSで分析する方法を確立した。リジン、アルギニン、ヒスチジンの全てのメチル化について検出が可能となり、W02A11.1タンパク質およびrRNAのアデニンメチル化酵素RRAM-1については、現在解析を進めている。
|
| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] m6A-mediated alternative splicing coupled with nonsense-mediated mRNA decay regulates SAM synthetase homeostasis2021
Author(s)
Watabe, E., Togo-Ohno, M., Ishigami, Y., Wani, S., Hirota, K., Kimura-Asami, M., Hasan, S., Takei, S., Fukamizu, A., Suzuki, Y., Suzuki, T. and Kuroyanagi, H.
-
Journal Title
EMBO J.
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Age-dependent decline in remyelination capacity is mediated by apeline-APJ signaling2021
Author(s)
Ito, M., Muramastu, R., Kato, Y., Sharma, B., Uyeda, A., Tanabe, S., Fugimura, H., Kidoya, H., Takakura, N., Kawahara, Y., Takao, M., Mochizuki, H., Fukamizu, A. and Yamashita, T.
-
Journal Title
Nat. Aging
Volume: 1
Pages: 284-294
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Transcriptomic evaluation of pulmonary fibrosis-related genes: Utilization of transgenic mice with modifying p38 signal in the lungs2020
Author(s)
Matsuda, S., Kim, JD., Sugiyama, F., Matsuo, Y., Ishida, J., Murata, K., Nakamura, K., Namiki, K., Sudo, T., Kuwaki, T., Hatano, M., Tatsumi, K., Fukamizu, A., and Kasuya, Y.
-
Journal Title
Int. J. Mol. Sci.
Volume: 21
Pages: E6746
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Identification of a novel nucleolar protein complex required for mitotic chromosome segregation through centromeric accumulation of Aurora B2020
Author(s)
Fujimura, A., Hayashi, Y., Kato, K., Kogure, Y., Kameyama, M., Shimamoto, H., Daitoku, H., Fukamizu, A., Hirota, T., and Kimura, K.
-
Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 48
Pages: 6583-6596
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Loss of PRMT1 in the CNS induces reactive astrocytes and microglia during postnatal brain development2020
Author(s)
Hashimoto, M., Kumabe, A., Kim, JD., Murata, K., Sowmya, S., Williams, A., Lu, W., Ishida, J., Nakagawa, T., Endo, M., Minami, Y., and Fukamizu, A.
-
Journal Title
J. Neurochem.
Volume: 156
Pages: 834-847
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Transcriptomic changes involved in the dedifferentitation of myofibroblasts derived from the lung of a patient with idiopathic pulmonary fibrosis2020
Author(s)
Suzuki, K., Kim, JD., Ugai, K., Matsuda, S., Mikami, H., Yoshioka, K., Ikari, J., Hatano, M., Fukamizu A., Tatsumi, K. and Kasuya, Y.
-
Journal Title
Mol. Med. Rep.
Volume: 22
Pages: 1518-1526
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Region-specific upregulation of HNK-1 glycan in the PRMT1-deficient brain2020
Author(s)
Hashimoto, M., Hirata, T., Yonekawa, C., Takeichi, K., Fukamizu A., Nakagawa, T. and Kizuka, Y.
-
Journal Title
Biochim. Biophys. Acta. Gen. Subj.
Volume: 1864
Pages: 129509
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
