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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Synthetic strategy for chemical methylome analyses

Research Project

Project/Area Number 17H02213
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

五月女 宜裕  国立研究開発法人理化学研究所, 袖岡有機合成化学研究室, 研究員 (50431888)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2022-03-31
Keywordsタンパク質メチル化 / メチローム解析 / 検出プローブ / 阻害剤 / 触媒反応
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、合成化学・生命化学を有機的に結びつけ、タンパク質メチル化反応の解析と制御を革新させることである。具体的には、[課題1] 新検出プローブの創出、[課題2] 酵素及び基質選択的阻害剤の開発、[課題3] 酵素/基質/メチル化サイトの同定、[課題4] 階層を超えたエピゲノム制御への展開に取り組む。それぞれの課題を相乗的に融合させ、独自の合成手法・検出・解析・阻害剤開発に立脚した分野融合型-ケミカルメチローム解析研究を提示することを目指している。
我々は、生体反応ではS-アデノシルメチオニンがメチル源として用いられることに着目し、その誘導体をメチル化基質検出プローブとして用いる方法論の開拓を進めてきた。これまでに検出プローブProSeAM は、基質動物細胞抽出液を用いた場合、約300のタンパク質基質をプロパルギル化できることを示した。しかしながら、ヒトゲノムには全遺伝子の約1%を占める200以上のタンパク質メチル化酵素が存在し、また多様なタンパク質基質、官能基およびメチル化度 (K, R: mono-, di, tri) が内在することを考慮すると未だ検出できないメチル化が埋もれている可能性が高い。本年度は、研究計画に従い、[課題1] 新検出プローブの創出に力点を置き、様々なS-アデノシルメチオニン誘導体とその前駆体の合成を行なった。また、[課題2] 酵素及び基質選択的阻害剤の開発では、これまで取り組んできたエピジチオジケトピペラジン型阻害剤に加え、[課題1]で合成するSAM誘導体型阻害剤、触媒反応を駆使した多官能基型化合物群の構築に焦点を当て、阻害剤の候補化合物群を合成することができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究計画に従い、[課題1] 新検出プローブの創出、[課題2] 酵素及び基質選択的阻害剤の開発を目指し設計した分子群の合成を進めることができたため。

Strategy for Future Research Activity

本年度得られた知見を基盤に、[課題1] 新検出プローブの創出、[課題2] 酵素及び基質選択的阻害剤の開発へ向けて、化合物ライブラリーを拡張する。それぞれの課題で構築した化合物について、そのタンパク質メチル化への影響について検討を開始し、構造活性相関についての基礎的知見を得る。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of North Carolina(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of North Carolina
  • [Journal Article] Naked d-orbital in a centrochiral Ni(II) complex as a catalyst for asymmetric [3+2] cycloaddition2017

    • Author(s)
      Yoshihiro Sohtome, Genta Nakamura, Atsuya Muranaka, Daisuke Hashizume, Sylvain Lectard, Teruchira Tsuchimoto, Masanobu Uchiyama, Mikiko Sodeoka
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 8 Pages: 14875

    • DOI

      DOI: 10.1038/ncomms14875

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Catalytic Enantioselective [3+2] Cycloaddition of a‐Keto Ester Enolates and Nitrile Oxides2017

    • Author(s)
      Samuel L. Bartlett, Yoshihiro Sohtome, Daisuke Hashizume, Peter S. White, Miki Sawamura, Jeffrey S. Johnson, Mikiko Sodeoka
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 139 Pages: 8661-8666

    • DOI

      DOI: 10.1021/jacs.7b03782

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Centrochiral transition metal complexes for catalytic asymmetric [3+2] cycloaddition of alpha-ketoester enolates2018

    • Author(s)
      Yoshihiro Sohtome, Mikiko Sodeoka
    • Organizer
      International Congress on Pure & Applied Chemistry (ICPAC) 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Controlling regioselectivity in the aerobic oxidative hetero-coupling of catechols2018

    • Author(s)
      Masumi Sugawara, Daiki Hojo, Miki Sawamura, Daisuke, Hashizume, Yoshihiro Sohtome, Mikiko Sodeoka
    • Organizer
      日本化学会第98回春季年会
  • [Presentation] Catalytic Asymmetric [3+2] Cycloaddition of a-Ketoester Enolates and Nitrile Oxides2018

    • Author(s)
      Samuel L. Bartlett, Yoshihiro Sohtome, Daisuke Hashizume, Peter S. White, Miki Sawamura, Jeffrey S. Johnson, Mikiko Sodeoka
    • Organizer
      日本化学会第98回春季年会
  • [Presentation] 安定な炭素ラジカル種を用いたヘテロカップリング反応の基質展開2018

    • Author(s)
      大西理華子、菅原真純、五月女宜裕、袖岡 幹子
    • Organizer
      日本化学会第98回春季年会
  • [Presentation] ProSeAMを用いるケミカルメチローム解析及びタンパク質メチル化阻害剤探索2017

    • Author(s)
      五月女宜裕、島津忠広、Barjau Joaquin、藤城信哉、赤壁麻依、寺山直樹、どど孝介、伊藤昭博、吉田稔、眞貝洋一、袖岡幹子
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会
  • [Presentation] ラジカル-ラジカルヘテロカップリング反応を基軸とする連続四級炭素の構築: N-Bocオキシインドール二量体の構造解析2017

    • Author(s)
      菅原真純、五月女宜裕、橋爪大輔、 北條大樹、澤村 美紀、村中厚哉、内山真伸、袖岡 幹子
    • Organizer
      第6回JACI/GSCシンポジウム
  • [Presentation] Centrochiral Ni(II) complex that enables the merger of enolate formation and H-bonding activation2017

    • Author(s)
      Yoshihiro Sohtome, Genta Nakamura, Atsuya Muranaka, Daisuke Hashizume, Sylvain Lectard, Teruchira Tsuchimoto, Masanobu Uchiyama, Mikiko Sodeoka
    • Organizer
      29th International Symposium on Chirality (Chirality 2017; ISCD-29)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 歪みを内包するNi(II)錯体の創製と触媒的不斉[3+2]環化付加型反応への展開2017

    • Author(s)
      五月女宜裕、中村元太、村中厚哉、橋爪大輔、レクターシルバン、土本晃久、内山真伸、袖岡幹子
    • Organizer
      第64回有機金属化学討論会
  • [Presentation] ケミカルエピゲノムの新展開2017

    • Author(s)
      五月女宜裕
    • Organizer
      新領域研究グループ『精密物質変換のための分子空間化学』 2017山形シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 特異な不斉空間制御を可能とする有機触媒・遷移金属錯体触媒2017

    • Author(s)
      五月女宜裕
    • Organizer
      新化学技術推進協会、先端化学・材料技術部会、高選択性反応分科会
    • Invited
  • [Presentation] 分野、研究室の垣根を超えた異分野融合型-有機合成化学2017

    • Author(s)
      五月女宜裕
    • Organizer
      中堅・若手リーダーのためのYUGOKAFE NExT
    • Invited
  • [Book] 実験医学別冊 エピジェネティクス実験スタンダード: もう悩まない!ゲノム機能制御の読み解き方/メ チル化酵素の新規標的分子の網羅的解析2017

    • Author(s)
      島津忠広、五月女宜裕、袖岡幹子、眞貝洋一
    • Total Pages
      398
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      475810199X

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-05-20  

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