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2019 Fiscal Year Annual Research Report

骨軟部腫瘍の網羅的ゲノム解析に基づく遺伝子異常の機能解析と新規治療薬探索

Research Project

Project/Area Number 17H03596
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

平田 真  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (50401071)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords骨軟部腫瘍 / ゲノム解析
Outline of Annual Research Achievements

i. 解析対象とする遺伝子異常の選定:脱分化型脂肪肉腫において遺伝子発現がコピー数依存的に変化している遺伝子群を対象として機能解析を進めた。コピー数依存的に発現の変化しているJUN、DNM3、DNM3OS、TAF9B、DGKQ、STX18に着目し、これらの遺伝子発現について高発現群と低発現群の2群に分け、予後との相関を確認した所、DGKQおよびTAF9Bにおいて、高発現群において有意に予後が悪いことが確認された。
ii. 遺伝子異常の細胞レベルでの機能解析:iで選定した遺伝子異常についてin vitroでの機能解析を引き続き行う。遺伝子発現の亢進により予後の悪化を認めたDGKQ、STX18について発現ベクターを作成し、マウス胎児線維芽細胞やヒト線維芽細胞肉腫細胞株HT1080などに強制発現させ、増殖能、浸潤能、遊走能等を評価した。コントロール群と比較し強制発現群では特にこれらの細胞機能の有意な変化を認めなかった。
iii. 遺伝子異常のマウスモデルでの機能解析:ヒトIDH1/2遺伝子変異を軟骨特異的に発現する軟骨肉腫モデルマウスより腫瘍組織および正常軟骨組織を採取し、20検体についてRNAシークエンス解析を実施した。対照群と比較して遺伝子変異群では成長板軟骨において軟骨細胞の肥大分化に関わる重要な遺伝子群の発現が変化していた。また、腫瘍組織においては軟骨組織と比較して、AKT/PI3KシグナルやIntegrinシグナルなどの経路が亢進していることが明らかとなった。特にAKT/PI3Kシグナルは転移巣においても亢進が確認され、同シグナル経路が腫瘍の進展に重要な役割を持っている可能性が示唆された。
iv. 新規治療標的候補となった遺伝子異常に対するドラッグスクリーニング:iiiで得られたシグナル経路解析の結果に基づいてAKT/PI3Kシグナルを中心とした分子標的薬の選定を行った。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (21 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 15 results,  Open Access: 12 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Trans-biobank analysis with 676,000 individuals elucidates the association of polygenic risk scores of complex traits with human lifespan2020

    • Author(s)
      Sakaue Saori、FinnGen、Kanai Masahiro、Karjalainen Juha、Akiyama Masato、Kurki Mitja、Matoba Nana、Takahashi Atsushi、Hirata Makoto、Kubo Michiaki、Matsuda Koichi、Murakami Yoshinori、Daly Mark J.、Kamatani Yoichiro、Okada Yukinori
    • Journal Title

      Nature Medicine

      Volume: 26 Pages: 542~548

    • DOI

      10.1038/s41591-020-0785-8

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dimensionality reduction reveals fine-scale structure in the Japanese population with consequences for polygenic risk prediction2020

    • Author(s)
      Sakaue Saori、Hirata Jun、Kanai Masahiro、Suzuki Ken、Akiyama Masato、Lai Too Chun、Arayssi Thurayya、Hammoudeh Mohammed、Al Emadi Samar、Masri Basel K.、Halabi Hussein、Badsha Humeira、Uthman Imad W.、Saxena Richa、Padyukov Leonid、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、Murakami Yoshinori、Kamatani Yoichiro、Okada Yukinori
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 1569

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15194-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of a novel uterine leiomyoma GWAS locus in a Japanese population2020

    • Author(s)
      Sakai Kensuke、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、et al.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 1024

    • DOI

      10.1038/s41598-020-58066-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GWAS of 165,084 Japanese individuals identified nine loci associated with dietary habits2020

    • Author(s)
      Matoba Nana、Akiyama Masato、Ishigaki Kazuyoshi、Kanai Masahiro、Takahashi Atsushi、Momozawa Yukihide、Ikegawa Shiro、Ikeda Masashi、Iwata Nakao、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、Murakami Yoshinori、Kubo Michiaki、Kamatani Yoichiro、Okada Yukinori
    • Journal Title

      Nature Human Behaviour

      Volume: 4 Pages: 308~316

    • DOI

      10.1038/s41562-019-0805-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Integrated exome and RNA sequencing of dedifferentiated liposarcoma2019

    • Author(s)
      Hirata Makoto、Matsuda Koichi、et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 5683

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13286-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Associations of autozygosity with a broad range of human phenotypes2019

    • Author(s)
      ClarkDW、Hirata M、Wilson JF、 et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 4957

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12283-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GWAS of mosaic loss of chromosome Y highlights genetic effects on blood cell differentiation2019

    • Author(s)
      Terao Chikashi、Momozawa Yukihide、Ishigaki Kazuyoshi、Kawakami Eiryo、Akiyama Masato、Loh Po-Ru、Genovese Giulio、Sugishita Hiroki、Ohta Tazro、Hirata Makoto、Perry John R. B.、Matsuda Koichi、Murakami Yoshinori、Kubo Michiaki、Kamatani Yoichiro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 4719

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12705-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Characterizing rare and low-frequency height-associated variants in the Japanese population2019

    • Author(s)
      Akiyama Masato、Hirata Makoto、Kamatani Yoichiro、 et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 4393

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12276-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional variants in ADH1B and ALDH2 are non-additively associated with all-cause mortality in Japanese population2019

    • Author(s)
      Sakaue Saori、Akiyama Masato、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、Murakami Yoshinori、Kubo Michiaki、Kamatani Yoichiro、Okada Yukinori
    • Journal Title

      European Journal of Human Genetics

      Volume: 28 Pages: 378~382

    • DOI

      10.1038/s41431-019-0518-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GWAS of five gynecologic diseases and cross-trait analysis in Japanese2019

    • Author(s)
      Masuda Tatsuo、Low Siew-Kee、Akiyama Masato、Hirata Makoto、Ueda Yutaka、Matsuda Koichi、Kimura Tadashi、Murakami Yoshinori、Kubo Michiaki、Kamatani Yoichiro、Okada Yukinori
    • Journal Title

      European Journal of Human Genetics

      Volume: 28 Pages: 95~107

    • DOI

      10.1038/s41431-019-0495-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Germline Pathogenic Variants in 7636 Japanese Patients With Prostate Cancer and 12?366 Controls2019

    • Author(s)
      Momozawa Yukihide、Iwasaki Yusuke、Hirata Makoto、Liu Xiaoxi、Kamatani Yoichiro、Takahashi Atsushi、Sugano Kokichi、Yoshida Teruhiko、Murakami Yoshinori、Matsuda Koichi、Nakagawa Hidewaki、Spurdle Amanda B、Kubo Michiaki
    • Journal Title

      JNCI: Journal of the National Cancer Institute

      Volume: 112 Pages: 369-376

    • DOI

      10.1093/jnci/djz124

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Massively parallel sequencing of tenosynovial giant cell tumors reveals novel CSF1 fusion transcripts and novel somatic CBL mutations2019

    • Author(s)
      Tsuda Yusuke、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、et al.
    • Journal Title

      International Journal of Cancer

      Volume: 145 Pages: 3276~3284

    • DOI

      10.1002/ijc.32421

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GWAS of smoking behaviour in 165,436 Japanese people reveals seven new loci and shared genetic architecture2019

    • Author(s)
      Matoba Nana、Akiyama Masato、Ishigaki Kazuyoshi、Kanai Masahiro、Takahashi Atsushi、Momozawa Yukihide、Ikegawa Shiro、Ikeda Masashi、Iwata Nakao、Hirata Makoto、Matsuda Koichi、Kubo Michiaki、Okada Yukinori、Kamatani Yoichiro
    • Journal Title

      Nature Human Behaviour

      Volume: 3 Pages: 471~477

    • DOI

      10.1038/s41562-019-0557-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome-wide meta-analysis identifies multiple novel loci associated with serum uric acid levels in Japanese individuals2019

    • Author(s)
      Nakatochi Masahiro、Hirata Makoto、Matsuo Hirotaka、 et al.
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 2 Pages: 115

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0339-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multi-ancestry genome-wide gene?smoking interaction study of 387,272 individuals identifies new loci associated with serum lipids2019

    • Author(s)
      Malik R、Hirata M、Dichgans M、et al.
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 51 Pages: 636~648

    • DOI

      10.1038/s41588-019-0378-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] NCCオンコパネルを用いたがん遺伝子プロファイリング研究(TOP-GEARプロジェクト第2期)における生殖細胞系列病的バリアント検出症例の特徴2019

    • Author(s)
      田辺記子,角南久仁子,市川仁,久保崇 ,加藤護,藤原豊, 下村昭彦,小山隆文,柿島裕樹,北見繭子,清水俊雄,菅野康吉, 平田真,平岡伸介,田村研治,吉田輝彦,藤原康弘,河野隆志 , 山本昇
    • Organizer
      第17回日本臨床腫瘍学会学術集会
  • [Presentation] Precision Medicineに向けて求められるチーム医療2019

    • Author(s)
      平田 真、田辺 記子、吉田 輝彦
    • Organizer
      第17回日本臨床腫瘍学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 脱分化型脂肪肉腫119例の網羅的ゲノム解析2019

    • Author(s)
      平田 真、浅野 尚文、片山 琴絵、中川 英刀、川井 章、 山口 類、市川 仁、松田 浩一、 骨軟部腫瘍ゲノムコンソーシアム
    • Organizer
      第52回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
  • [Presentation] Integrated Exome and RNA Sequencing of Dedifferentiated Liposarcoma2019

    • Author(s)
      Makoto Hirata, Naofumi Asano, Kotoe Katayama, Hidewaki Nakagawa, Akira Kawai, Rui Yamaguchi, Hitoshi Ichikawa, Koichi Matsuda, Japan Sarcoma Genome Consortium
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] がん関連遺伝子プロファイリング検査における 二次的所見の取り扱い2019

    • Author(s)
      平田 真
    • Organizer
      第1回遺伝性腫瘍アドバンスドセミナー
    • Invited
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.ncc.go.jp/jp/information/pr_release/2019/1212-02/index.html

URL: 

Published: 2021-01-27  

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