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2017 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト疾患を招く性染色体ゲノム脆弱性決定因子の解明

Research Project

Project/Area Number 17H03616
Research InstitutionNational Center for Child Health and Development

Principal Investigator

深見 真紀  国立研究開発法人国立成育医療研究センター, 分子内分泌研究部, 部長 (40265872)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 倉橋 浩樹  藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 教授 (30243215)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywordsゲノム / 遺伝子
Outline of Annual Research Achievements

研究項目1 ゲノム再構成の成立機序の解明:2000例以上の先天異常患者を対象に、アレイcomparative genomic hybridizationによるゲノムコピー数異常の検討を行った。特記すべき成果として、成長障害、多発奇形、新生児一過性糖尿病を認める男児において、5つの染色体の複雑構造異常を同定した。マイクロサテライト解析の結果、これらのゲノム再構成はいずれも父由来染色体上に存在するde novo異常であることが判明した。PLAGL1プロモーターのDNAメチル化は正常下限から軽度低値であり、成長障害、新生児一過性糖尿病は父由来PLAGL1アリルのコピー数増加に起因するものと考えられた。患児のゲノム再構成は、胚細胞において複数の染色体に独立して同時に生じたものと推測された。これは従来想定されている非対立遺伝子間相同組換え 、非相同末端再結合、microhomology-mediated break-induced replication 、微小核を介したchromoanagenesisでは説明困難である。現在、全ゲノム解析やマイクロサテライト解析を行い、この多焦点性ゲノム再構成の発症メカニズムについて検討を行っている。
研究項目2 X染色体不活化解析:X染色体構造異常症患者10例を集積し、DNAメチル化パターンの検討を開始した。本年度は、偽常染色体領域内のX不活化を免れる遺伝子のメチル化について検討し、XIST重複を伴う大規模な構造変化症例で異常メチル化を同定した。
研究項目3 Y染色体不活化解析:MLPAを用いてY染色体構造多型の検証を行い、gr/gr欠失領域内にY特異的身長関連遺伝子がないことを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通りにX不活化解析とY染色体解析が進行した。また、既知のメカニズムでは説明困難なゲノム再構成を有する症例を同定した。

Strategy for Future Research Activity

性染色体については、計画に沿って研究を進める。また、新規ゲノム再構成発症機序の解明を目指して、全ゲノム解析などを推進する。

  • Research Products

    (6 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Somatically Acquired Isodicentric Y and Mosaic Loss of Chromosome Y in a Boy with Hypospadias2018

    • Author(s)
      Miyado M, Muroya K, Katsumi M, Saito K, Kon M, Fukami M
    • Journal Title

      Cytogenetic and Genome Research

      Volume: . Pages: .

    • DOI

      10.1159/000488162

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical Consequences of Chromothripsis and Other Catastrophic Cellular Events.2018

    • Author(s)
      Fukami M, Kurahashi H.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 1769 Pages: 21-33

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A de novo 50-bp <b><i>GNAS</i></b> Intragenic Duplication in a Patient with Pseudohypoparathyroidism Type 1a2017

    • Author(s)
      Suzuki Erina、Bo Ryosuke、Sue Kaori、Awano Hiroyuki、Ogata Tsutomu、Narumi Satoshi、Kagami Masayo、Sano Shinichiro、Fukami Maki
    • Journal Title

      Cytogenetic and Genome Research

      Volume: 153 Pages: 125~130

    • DOI

      10.1159/000485644

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 成長障害の分子基盤:ゲノム疾患としてのSHOX異常症2017

    • Author(s)
      深見真紀
    • Organizer
      第90回日本内分泌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] 染色体構造異常・片親性ダイソミーと疾患2017

    • Author(s)
      深見真紀
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第62回大会
    • Invited
  • [Remarks] 研究開発法人国立成育医療研究センター分子内分泌研究部

    • URL

      http://nrichd.ncchd.go.jp/endocrinology/

URL: 

Published: 2018-12-17  

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