2018 Fiscal Year Annual Research Report
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17H03621
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
有田 正規 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (10356389)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 謙 立命館大学, 薬学部, 教授 (60418689)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | リピドミクス / 理論ライブラリ / メタボロミクス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
リピドミクス技術で一斉同定可能な脂質クラス約120について，以下の情報を整備した。1.国際標準に基づく構造略名，2. ポジティブおよびネガティブモードにおける主なアダクト，3. 標準的な理論スペクトルと主なフラグメントイオンと部分構造との関係。脂質クラスは大きく以下のカテゴリーに分けた。1. 脂肪酸 2.中性グリセロ脂質 3.グリセロリン脂質 4. プレノール脂質 5. スフィンゴ脂質 6. ステロール脂質。それぞれのカテゴリーにおいて，そのアミノ酸，コリン，エタノールアミン，糖などの付加体，グリセロ脂質の場合はエーテル結合型も考慮している。また，カルジオリピン，ビタミンA，ビタミンE，コエンザイムQ，リピッドA，ビタミンDについても，構造バリエーションを含めて理論スペクトルを作成した。胆汁酸と種々の植物ステロールにおける誘導体は，主要な母核構造のエステルと，ヘキソースホスファチジン酸付加体について作成した。
これらの情報はLipidBlastライブラリの拡張版として公開し，MS-DIALソフトウェアで利用可能にしている。また脂質の国際コンソーシアムに参加してこれらのライブラリ構築を共同で進めると同時に，論文報告時のメタデータ記載法について国際標準化を呼びかける提言を論文として発表した。ライブラリに基づく具体的な測定として，ヒト血漿サンプルを国際共同研究として測定し，血漿における脂質分布の標準づくりにも貢献した。ヒト血漿の具体的な測定もおこない，抱合体などの代謝物を効率よく同定する手法も検討した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
理論ライブラリを多くの脂質クラスについて作成し，公開した
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| Strategy for Future Research Activity |
作成した理論ライブラリを幅広く流通させる工夫をおこなう。またライブラリ構築の基本的な考え方も広めていく。
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[Journal Article] MS-based lipidomics of human blood plasma: a community-initiated position paper to develop accepted guidelines2018
Author(s)
Burla B, Arita M, Arita M, Bendt AK, Cazenave-Gassiot A, Dennis EA, Ekroos K, Han X, Ikeda K, Liebisch G, Lin MK, Loh TP, Meikle PJ, Oresic M, Quehenberger O, Shevchenko A, Torta F, Wakelam MJO, Wheelock CE, Wenk MR
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Journal Title
Journal of Lipid Research
Volume: 59
Pages: 2001-2017
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
