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2019 Fiscal Year Annual Research Report

回転軸のないV1モーターが一方向に回転運動する分子機構の解明

Research Project

Project/Area Number 17H03638
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

村田 武士  千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (80415322)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
KeywordsV-ATPase / 分子モーター / 構造解析
Outline of Annual Research Achievements

V型ATPaseは、触媒頭部(A3B3複合体)でATPを加水分解し、軸部分の回転エネルギー変換を介してイオンを輸送するナノ分子モーター/イオンポンプである。我々は、腸球菌A3B3複合体の結晶構造を明らかにし、高速原子間力顕微鏡(高速AFM)によりA3B3複合体がATP依存に一方向へ回転運動することを見出した。そこで本研究では、A3B3複合体が一方向に回転運動する分子機構の解明を目的に、各種ヌクレオチド存在下でのA3B3複合体のX線結晶構造解析、生化学的解析、高速AFM観測を遂行する。以下に当該年度の研究成果を記載した。
(1)A3B3複合体の重要残基変異体の構造機能解析---昨年度の研究により活性に重要と示唆されたR350K変異体を発現精製し、結晶化およびX線結晶構造解析を行った。得られた構造は野生型と異なり対称構造を形成しており、R350がA3B3複合体の非対称構造形成に重要な役割を担っていることが明らかとなった。
(2)A3B3複合体が一方向に回転運動する分子機構モデルの提案--- ATPの結合が律速となる条件では、A3B3複合体の一方向回転運動の頻度が低下していた。また、ATPase活性は回転軸があるV1複合体と比べ、1.5倍に上昇していた。本研究で得られた構造生物学的・生化学的・生物物理学的解析結果のすべてを総括することにより、A3B3複合体の協同的な分子機構のモデルを提案した。
(3)V1複合体とA3B3複合体の分子機構モデルの比較---回転軸がないA3B3複合体とV1複合体の分子機構の大枠は同じであるが、回転軸が存在することで加水分解する場所が固定され、正確な一方向回転運動を達成していることが示唆された。回転軸はA3B3複合体の構造変化の中でただ単に回転しているだけでなく、回転分子機構を制御していることが明らかとなった。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Arizona State University/University of Illinois
  • [Int'l Joint Research] University de Lorraine(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      University de Lorraine
  • [Journal Article] Single-molecule analysis reveals rotational substeps and chemo-mechanical coupling scheme of Enterococcus hirae V1-ATPase2019

    • Author(s)
      Iida Tatsuya、Minagawa Yoshihiro、Ueno Hiroshi、Kawai Fumihiro、Murata Takeshi、Iino Ryota
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 294 Pages: 17017~17030

    • DOI

      10.1074/jbc.RA119.008947

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] バンコマイシン耐性腸球菌に存在するV-ATPaseを分子標的とした新規抗菌薬の開発2019

    • Author(s)
      清水 康輝、薬師寺 リカ ファビアナ、森山 克彦、後藤 義幸、村田 武士
    • Organizer
      第92回日本細菌学会総会
  • [Presentation] Na+-transporting V-ATPase is a new target for drug development against Vancomycin-resistant Enterococcus (VRE)2019

    • Author(s)
      Kouki Shimizu, Fabiana Lica Yakushiji, Katsuhiko Moriyama, Yoshiyuki Goto, Takeshi Murata
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Bioenergetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of new antibacterial drug targeting V-ATPase in Vancomycin-resistant Enterococcus2019

    • Author(s)
      Takeshi Murata
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Bioenergetics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The combination of high-speed atomic force microscopy and X-ray crystallography reveals rotary catalysis of a shaftless V1 motor2019

    • Author(s)
      Shintaro Maruyama, Motonori Imamura, Takayuki Uchihashi, Kazuya Nakamoto, Mizutani Kenji, Lica Fabiana Imai, Kano Suzuki, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Tomomi Someya-Kimura, Mikako Shirouzu, Ichiro Yamato, Toshio Ando, Takeshi Murata
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Chemo-mechanical coupling scheme of rotary molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase revealed by single-molecule analysis2019

    • Author(s)
      Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, Ryota Iino
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] The off-axis rotor of Enterococcus hirae V-type ATPase by Volta phase contrast cryo-EM2019

    • Author(s)
      Burton-Smith Raymond. N, Tsunoda Jun, Yamamori Yu, Miyazaki Naoyuki, Imai Fabiana L., Song Chihong, Tomii Kentaro, Iwasaki Kenji, Takagi Junichi, Ueno Hiroshi, Murata Takeshi, Iino Ryota, Murata Kazuyoshi
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 回転分子モータータンパク質によるプロトン輸送メカニズム2019

    • Author(s)
      村田武士
    • Organizer
      第92回日本生化学会
    • Invited
  • [Presentation] 薬剤耐性腸球菌V-ATPaseを標的とした新規抗菌薬の開発2019

    • Author(s)
      清水 康輝、森山 克彦、後藤 義幸、村田 武士
    • Organizer
      第45回生体エネルギー研究会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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