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2019 Fiscal Year Annual Research Report

高分子量蛋白質のための全自動NMR構造解析システムの開発

Research Project

Project/Area Number 17H03641
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

児嶋 長次郎  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (50333563)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
KeywordsNMR / 蛋白質 / 立体構造
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、世界最高感度のNMR装置群と独自開発の自動構造計算ソフトを駆使し、従来の分子量上限を超える分子量5万の蛋白質のNMR構造を「全自動」で決定するシステムの構築を目指す。具体的には、研究代表者らが開発中の全自動NMR構造解析プラットフォームMagROと独自のアミノ酸選択標識技術、既存のメチル基選択的軽水素標識等を駆使して分子量5万の花成ホルモン受容体の構造解析を行い、高分子量蛋白質のための全自動NMR構造解析システムの開発に取り組む。
令和元年度は、平成30年度から継続して、(2)メチル基に特化したNMRデータ取得法の確立、(3)メチル基に特化した全自動NMR構造解析ルーチンの開発、の技術開発を進めた。また、(4)花成ホルモン受容体の全自動NMR構造決定、(5)結晶化が困難な花成ホルモン受容体複合体や薬剤複合体の構造解析、にも取り組んだ。
令和元年度の主な成果としては、19F-NMRを利用した分子間距離情報を取得する手法の開発と、花成ホルモン受容体複合体や薬剤複合体の構造解析への適用が挙げられる。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] Rutgers University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Rutgers University
  • [Journal Article] Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal: Tim21 as the case study2020

    • Author(s)
      Bala Siqin、Shinya Shoko、Srivastava Arpita、Ishikawa Marie、Shimada Atsushi、Kobayashi Naohiro、Kojima Chojiro、Tama Florence、Miyashita Osamu、Kohda Daisuke
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      Volume: 1864 Pages: 129418~129418

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.129418

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In-cell NMR as a sensitive tool to monitor physiological condition of Escherichia coli2020

    • Author(s)
      Sugiki Toshihiko、Yamaguchi Yoshihiro、Fujiwara Toshimichi、Inouye Masayori、Ito Yutaka、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 2466~2466

    • DOI

      10.1038/s41598-020-59076-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural instability of lamin A tail domain modulates its assembly and higher order function in Emery?Dreifuss muscular dystrophy2019

    • Author(s)
      Mio Muneyo、Sugiki Toshihiko、Matsuda Chie、Mitsuhashi Hiroaki、Kojima Chojiro、Chan Siu Yuen、Hayashi Yukiko K.、Mio Kazuhiro
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 512 Pages: 22~28

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.02.138

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural characterization of the N-terminal kinase-interacting domain of an Hsp90-cochaperone Cdc37 by CD and solution NMR spectroscopy2019

    • Author(s)
      Ihama Futoshi、Yamamoto Mami、Kojima Chojiro、Fujiwara Toshimichi、Matsuzaki Katsumi、Miyata Yoshihiko、Hoshino Masaru
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics

      Volume: 1867 Pages: 813~820

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2019.06.007

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 19F-NMR for Fragment-Based Drug Discovery2019

    • Author(s)
      Chojiro Kojima
    • Organizer
      8th Asia-Pacific NMR Symposium 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMRで分子集団の構造を捉える2019

    • Author(s)
      児嶋長次郎
    • Organizer
      第20回若手NMR研究会
    • Invited
  • [Presentation] 19F-NMR for Drug Discovery2019

    • Author(s)
      Chojiro Kojima
    • Organizer
      Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2019
    • Invited

URL: 

Published: 2021-01-27  

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