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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Evaluating the affinity of membrane proteins and lipid raft using a patterned model membrane platform

Research Project

Project/Area Number 17H03666
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

森垣 憲一  神戸大学, バイオシグナル総合研究センター, 准教授 (10358179)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 文夫  神戸大学, 理学研究科, 名誉教授 (80093524)
鈴木 健一  岐阜大学, 研究推進・社会連携機構, 教授 (50423059)
笠井 倫志  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 助教 (20447949)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords生体膜 / 受容体 / 人工膜 / 膜小胞
Outline of Annual Research Achievements

細胞膜の微小ドメイン構造(ラフト)は、膜タンパク質の機能調節に重要な役割を果たすと考えられている。研究代表者は、ラフト領域と非ラフト領域が明確に分かれているパターン化人工膜を用いて、膜タンパク質のラフト親和性を定量する手法を開発した。本研究は、細胞膜小胞(blebs)を直接人工膜に導入することで、大量発現・精製が難しい哺乳類膜タンパク質のラフト親和性を定量する技術を開発することを目的とする。2019年度には、①人工膜とナノ空間を一体化したバイオチップ作製、②パターン化人工膜への膜タンパク質の再構成、に関する技術開発を行った。
① 人工膜とナノ空間を一体化したバイオチップ作製:光重合性リン脂質を光リソグラフィー技術でUV重合することでポリマー脂質膜を作製した。ナノ空間は、高密度な親水性高分子鎖(高分子ブラシ)を被覆したシリカ微粒子を用いて人工膜とPDMSを結合することで作製した。粒径100 nmのナノ粒子を、厚さの制御された接着層として用いることで、流動性脂質膜部位の膜とPDMSの間に同程度の厚さを持つナノ空間が形成され、膜タンパク質を導入して1分子蛍光観察することに成功した。
② パターン化人工膜への膜タンパク質の再構成:細胞由来の膜小胞(blebs)を用いて、哺乳類細胞の膜タンパク質を人工膜に直接導入する技術を開発した。精神疾患に関わる重要なGPCRであるドーパミン受容体(DRD2)をCHO細胞に発現し薬剤処理で膜小胞を形成した。膜小胞を平面膜化してDRD2が区画内で側方拡散していること、またPDMSとの境界領域において区画内に多量のD2R分子がが導入され2次元拡散していることを確認した。さらに、D2Rの配向性、受容体としての機能を検討することで、膜小胞を用いたナノ空間への膜タンパク質再構成、機能解析技術を確立することができると期待される。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (39 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 5 results) Presentation (26 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 13 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Affinity of rhodopsin to raft enables the aligned oligomer formation from dimers: Coarse-grained molecular dynamics simulation of disk membranes2020

    • Author(s)
      Kaneshige Y, Hayashi F, Morigaki K, Tanimoto Y, Yamashita H, Fuji M, Awazu A.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 15 Pages: e0226123

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0226123

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dynamic actin-mediated nano-scale clustering of CD44 regulates its meso-scale organization at the plasma membrane2020

    • Author(s)
      Parjat Sil, Nicolas Mateos, Sangeeta Nath, Somja Buschow, Carlo Manzo, Kenichi G. N. Suzuki, Takahiro Fujiwara, Akihiro Kusumi, Maria F. Garcia-Parajo, Satyajit Mayor
    • Journal Title

      Molecular Biological of the Cell

      Volume: 31 Pages: 561-579

    • DOI

      10.1091/mbc.E18-11-0715

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Defining Raft Domains in the Plasma Membrane2020

    • Author(s)
      Kusumi, A., T. K. Fujiwara, T. A. Tsunoyama, R. S. Kasai, A. A. Liu, K. M. Hirosawa, M. Kinoshita, N. Matsumori, N. Komura, H. Ando, and K. G. N. Suzuki.
    • Journal Title

      Traffic

      Volume: 21 Pages: 106-137

    • DOI

      10.1111/tra.12718

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Alteration of membrane physicochemical properties by two factors for membrane protein integration2019

    • Author(s)
      Nomura K, Yamaguchi T, Mori S, Fujikawa K, Nishiyama K, Shimanouchi T, Tanimoto Y, Morigaki K, Shimamoto K.
    • Journal Title

      Biophys. J.

      Volume: 117 Pages: 99-110

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2019.05.014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Raftophilic rhodopsin clusters offer stochastic platforms for G protein signalling in retinal discs2019

    • Author(s)
      Hayashi F, Saito N, Tanimoto Y, Okada K, Morigaki K, Seno K, Maekawa S.
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 2 Pages: 209

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0459-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] パターン化人工膜を用いた生体膜機能の解析2019

    • Author(s)
      森垣憲一
    • Journal Title

      生物物理

      Volume: 59 Pages: 188-191

    • DOI

      10.2142/biophys.59.188

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Self-spreading of phospholipid bilayer in a patterned framework of polymeric bilayer2019

    • Author(s)
      Tamura F,Tanimoto Y, Nagai R, Hayashi F, Morigaki K.
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 35 Pages: 14696-14703

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.9b02685

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of fluorescently labeled SSEA-3, SSEA-4 and Globo-H glycosphingolipids for elucidating molecular interactions in the cell membrane2019

    • Author(s)
      Sachi Asano, Rita Pal, Hide-Nori Tanaka, Akihiro Imamura, Hideharu Ishida, Kenichi G.N. Suzuki*, Hiromune Ando*
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 20 Pages: 6187

    • DOI

      10.3390/ijms20246187

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] AMPA receptors in the synapse turnover by monomer diffusion2019

    • Author(s)
      Jyoji Morise, Kenichi G. N. Suzuki*, Ayaka Kitagawa, Yoshihiko Kitazono, Kogo Takamiya, Takaaki A. Tsunoyama, Hiromu Takematsu, Akihiro Kusumi* and Shogo Oka*
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 5245

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13229-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hybrid soft nanomaterials composed of DNA microspheres and supermolecular nanostructures of semi-artificial glycopeptides2019

    • Author(s)
      Sayuri L. Higashi, Aya Shibata, Yoshiaki Kitamura, Koichiro M. Hirosawa, Kenichi G. N. Suzuki, Kazunori Matsuda, Masato Ikeda
    • Journal Title

      Chemistry

      Volume: 25 Pages: 11955-11962

    • DOI

      10.1002/chem.201902421

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Hybrid photosynthetic system of natural plant thylakoids and synthetic lipids reconstituted into a supported microscale membrane array2020

    • Author(s)
      Kenichi Morigaki, Fuyuko Tamura, Yasushi Tanimoto, Rurika Nagai, Misato Yamada, Fumio Hayashi
    • Organizer
      ACS National meeting & Expo
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] パターン化人工膜への膜タンパク質の再構成2020

    • Author(s)
      永井るりか、谷本泰士、笠井倫志、鈴木健一、林 文夫、森垣憲一
    • Organizer
      光・量子デバイス研究会
  • [Presentation] 1分子観察によるガングリオシド会合機構とEGF受容体化成制御機構の解明2020

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      日本農芸化学会2020大会
    • Invited
  • [Presentation] N型糖鎖によるエクソソームの取り込み制御機構の解明2020

    • Author(s)
      磯貝樹、廣澤幸一朗、木塚康彦、鈴木健一鈴木健一
    • Organizer
      日本農芸化学会2020大会
  • [Presentation] 蛍光1分子観察法による膜分子の動態観察と機能の解明:G蛋白質共役型受容体の動的なモノマー・ダイマー変換2020

    • Author(s)
      笠井倫志
    • Organizer
      日本化学会 第100春季年会 (2020) シンポジウム発表 (コロナウイルス禍のため予稿集上での開催)
    • Invited
  • [Presentation] Patterned model biological membrane on the solid substrate: Potentials for biophysical studies and biomedical applications2019

    • Author(s)
      Kenichi Morigaki
    • Organizer
      Okinawa Colloids 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Micropatterned model biological membrane: Potentials for biophysical studies and biomedical applications2019

    • Author(s)
      Kenichi Morigaki
    • Organizer
      MNP Reserch Seminar
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Micropatterned model biological membrane: Potentials for biophysical studies and biomedical applications2019

    • Author(s)
      Kenichi Morigaki
    • Organizer
      Bio-Nano-Summer school 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ガラス基板表面におけるチラコイド膜の再構成と光合成機能解析2019

    • Author(s)
      米田 卓郎、谷本 泰士、高木 大輔、森垣 憲一
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 網膜桿体細胞内円盤膜上での脂質-光受容タンパク質秩序形成の数理モデル2019

    • Author(s)
      金重 先人、谷本 泰士、西森 拓、森垣 憲一、林 文夫、粟津 暁紀
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] インクジェット塗布を用いたパターン化人工生体膜の開発2019

    • Author(s)
      谷本 泰士、山田 美紗登、林 文夫、森垣 憲一
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] ロドプシンクラスター上におけるトランスデューシンの動的過程の高速AFM観察2019

    • Author(s)
      干鰯谷 和彦、谷本 泰士、山下 隼人、森垣 憲一、林 文夫、阿部 真之
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] リン酸化ロドプシン・アレスチン複合体は視細胞円板膜切れ込み部に集まる2019

    • Author(s)
      林 文夫、杭田 扶子、 森垣 憲一、 妹尾 圭司
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 細胞膜断片ブレブを用いたモデル生体膜への膜タンパク質再構成2019

    • Author(s)
      永井るりか、谷本泰士、笠井倫志、鈴木健一、林 文夫、森垣憲一
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] パターン化モデル膜を用いたロドプシンリン酸化とアレスチン結合の解析2019

    • Author(s)
      杭田 芙子、谷本 泰士、林 文夫、森垣 憲一
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Reconstitution of a photosynthetic system into a two-dimensional patterned model membrane2019

    • Author(s)
      TakuroYoneda, Yasushi Tanimoto, Daisuke Takagi, Kenichi Morigaki
    • Organizer
      日米二国間セミナー
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] パターン化人工生体膜を用いた光合成機能評価技術の開発2019

    • Author(s)
      米田 卓郎、谷本 泰士、高木 大輔、森垣 憲一
    • Organizer
      第10回日本光合成学会年会
  • [Presentation] Single-molecule imaging study of dynamics of rafts and exosomes2019

    • Author(s)
      Kenichi G.N. Suzuki
    • Organizer
      International symposium on Bio-chains from single molecules to highly organized systems
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Regulation mechanisms of EGF receptor activation by gangliosides as revealed by single-molecule imaging2019

    • Author(s)
      Kenichi G.N. Suzuki
    • Organizer
      60th International Conference on the Bioscience of Lipids
    • Invited
  • [Presentation] Single-molecule imaging study of regulation mechanisms of EGF receptor activity by gangliosides2019

    • Author(s)
      Kenichi G.N. Suzuki
    • Organizer
      Glyco25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Regulation mechanisms of EGF receptors by gangliosides as revealed by single-molecule imaging2019

    • Author(s)
      Kenichi G.N. Suzuki
    • Organizer
      1st japan-Europe Workshop on Glycosphingolipids and Membrane Homeastasis
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Uptake mechanism of exosomes on the recipient cells: Superresolution and single particle tracking study2019

    • Author(s)
      Koichiro M. Hirosawa, Takaaki A. Tsunoyama, Yasunari Yokota, Kenichi G.N. Suzuki
    • Organizer
      The 57th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • [Presentation] 1分子イメージングによるエクソソーム膜動態の解明2019

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] エクソソーム膜動態の1分子可視化解析2019

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Examining the transiently formed GPCR dimer: An approach by single fluorescent molecule observation in living cells2019

    • Author(s)
      笠井倫志
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会 シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Examining the transiently formed GPCR dimer: An approach by single fluorescent molecule observation in living cells2019

    • Author(s)
      笠井倫志
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
  • [Book] 膜タンパク質工学ハンドブック 第1編 膜タンパク質の基礎 第2章 構造・物性・分析・解析 第17節 1分子計測2020

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      978-4-86043-537-0 C3045
  • [Book] The Lipid 見る脂質のページ 第3回1分子観察によるラフト組織化と機能の解明2020

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      メデイカルレビュー社
    • ISBN
      978-4-7792-2386-0
  • [Remarks] 神戸大学 森垣研究室

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~morigaki/

URL: 

Published: 2021-01-27  

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