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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Does gene flow along environmental gradient inhibit adaptation? An approach using the optimality theory

Research Project

Project/Area Number 17H03727
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

彦坂 幸毅  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (10272006)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 花田 耕介  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 准教授 (50462718)
藤井 伸治  東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (70272002)
森長 真一  日本大学, 生物資源科学部, 助教 (80568262)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords局所適応 / 遺伝子流動 / 標高適応
Outline of Annual Research Achievements

同一種内でも、局所適応により環境勾配にそった形質や遺伝子の変異が生じる。しかし、別の環境からの非適応遺伝子の流入によって局所適応が阻害される場合がある。標高傾度は、空間的距離が近い割に環境変化の勾配が大きく、遺伝子流動による適応阻害が起こりやすい系であると考えられる。本研究では、滋賀県伊吹山の広い標高範囲に生育し、標高に沿った形質変異が見られるハクサンハタザオを材料とし、遺伝子解析、形質評価、数理モデルなどの手法を駆使し、各エコタイプがそれぞれの生育環境にどれだけ最適に近く適応しているかを評価することを試みた。
1)ゲノム解析:伊吹山の連続的な48地点からハクサンハタザオの個体の一部を採取し、全ゲノム解析を行った。試行的に10遺伝子を選択し、その塩基置換にどのような標高依存性があるかを詳細に解析した。その結果、遺伝子間や遺伝子内の塩基によって標高依存パターンが異なり、標高依存的な選択のかかり方が遺伝子によって異なることを見出した。今後はこれら解析をより多くの遺伝子に行い、変異と選択のパターンをより詳細に解析する予定である。
2)形質評価:現地の高・低標高で採取した種子から個体を同じ人工気象室内で異なる栄養条件で育成した。数理モデルを用いて解析した結果、高標高由来の個体が富栄養環境に適応していることを示唆する実験結果を得た。一般に、高標高ほど貧栄養条件であることが多いため、予想に反した結果であった。そこで現地の土壌栄養条件を調べた結果、これも予想に反して高標高ほど富栄養であり、高標高由来の個体は富栄養条件に適応していることが明らかとなった。
3)遺伝子解析:高標高個体や低標高個体に特徴的に見られる塩基置換をもつ遺伝子をシロイヌナズナで強制発現させる実験を行っている。導入がうまくいかない遺伝子があり難航している。うまくいった遺伝子については、実験のために種子を繁殖させている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

野外調査と遺伝子導入に若干の遅れが認められるが、繰越により問題なく進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

ゲノム解析は、10遺伝子で行った解析を100遺伝子以上に拡張し、論文にまとめる予定である。
形質評価については、低温耐性の実験を進めている。
遺伝子導入個体について形質評価を行い、各遺伝子の機能と適応性について研究を進める。

  • Research Products

    (10 results)

All 2019 2018 2017

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Plasticity of functional traits and optimality of biomass allocation in elevational ecotypes of Arabidopsis halleri grown at different soil nutrient availabilities2019

    • Author(s)
      Wang Qing-Wei、Daumal Maya、Nagano Soichiro、Yoshida Naofumi、Morinaga Shin-Ichi、Hikosaka Kouki
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 132 Pages: 237~249

    • DOI

      10.1007/s10265-019-01088-9

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Acclimation and adaptation components of the temperature dependence of plant photosynthesis at the global scale2019

    • Author(s)
      Kumarathunge Dushan P.、et al.
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 222 Pages: 768~784

    • DOI

      10.1111/nph.15668

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Modeling leaf CO2 assimilation and Photosystem II photochemistry from chlorophyll fluorescence and the photochemical reflectance index2018

    • Author(s)
      Hikosaka Kouki、Noda Hibiki M.
    • Journal Title

      Plant, Cell & Environment

      Volume: 42 Pages: 730~739

    • DOI

      10.1111/pce.13461

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Physiological validation of photochemical reflectance index (PRI) as a photosynthetic parameter using Arabidopsis thaliana mutants2018

    • Author(s)
      Kohzuma Kaori、Hikosaka Kouki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 498 Pages: 52~57

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2018.02.192

  • [Journal Article] Dependence of functional traits related to growth rates and their CO2 response on multiple habitat climate factors across Arabidopsis thaliana populations2018

    • Author(s)
      Ozaki Hiroshi、Oguchi Riichi、Hikosaka Kouki
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 131 Pages: 987~999

    • DOI

      10.1007/s10265-018-1058-1

  • [Journal Article] Functional divergence of duplicate genes several million years after gene duplication in Arabidopsis2018

    • Author(s)
      Hanada Kousuke、Tezuka Ayumi、Nozawa Masafumi、Suzuki Yutaka、Sugano Sumio、Nagano Atsushi J、Ito Motomi、Morinaga Shin-Ichi
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 25 Pages: 327~339

    • DOI

      10.1093/dnares/dsy005

  • [Presentation] 標高間変異における自然選択と遺伝子流動と影響力の評価:ハクサンハタザオの全ゲノム解析から2018

    • Author(s)
      吉田直史・若宮健・鳥居怜平・小口理一・石井悠 ・藤井伸治・久保田渉誠・森長真一・花田耕介・ 河田雅圭・彦坂幸毅
    • Organizer
      東北植物学会第8回大会
  • [Presentation] Optimality and plasticity of biomass allocation in elevational ecotypes of Arabidopsis halleri at different soil nutrient availabilities2018

    • Author(s)
      Qingwei WANG, Maya Daumal, Soichiro Nagano, Naofumi Yoshida, Shin-Ichi Morinaga, Kouki Hikosaka
    • Organizer
      第65回日本生態学会大会
  • [Presentation] 侵入種ミチタネツケバナと在来種タネツケバナの葉の機能形質の種内変異とその生息地環境依存性2018

    • Author(s)
      代抒凝・小口理一・森長真一・彦坂幸毅
    • Organizer
      東北植物学会第8回大会
  • [Presentation] ハクサンハタザオの局所適応解析:機能遺伝子の観点から2017

    • Author(s)
      吉田直史・小口理一・藤井伸治・久保田渉誠・森長真一・花田耕介・彦坂幸毅
    • Organizer
      東北植物学会第7回大会

URL: 

Published: 2019-12-27  

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