2019 Fiscal Year Annual Research Report
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17H04151
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
人見 次郎 岩手医科大学, 医学部, 教授 (00218728)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
三上 貴浩 岩手医科大学, 医学部, 助教 (90804419)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 老化 / エピゲノム / メチローム / 生物学的年齢 / 末梢血単核球 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、「東北メディカル・メガバンク計画」の地域住民コホート８万人のうち、全ゲノム範囲のジェノタイピングを行った25年度の岩手県での登録者5740人から性・年齢層化抽出した約500人を対象に、探索群と検証群の２群に分けて、個人間バリエーションが20%以上を示す2MCpGサイトをターゲットとするキャプチャシークエンス法により、DNAメチル化プロファイルを取得し、正則化回帰モデル（Elastic net）を用いて、「細胞年齢尺度」を開発することを目指した。
2019年度は検証群の144人について、2MCpGサイトをターゲットとするキャプチャシークエンスを行い、全ゲノムワイドのDNAメチル化情報を取得した。これにより探索群384人と合わせて、528人の末梢血単核球の全ゲノム情報と全ゲノムワイドのDNAメチル化情報を確保できた。一方、「細胞年齢尺度」の開発では、当初予定していた正則化回帰モデル（regularized regression model）のElastic Netとbootstrapを用いた手法では、計算できないことが分り、新たな手法を開発中である。
「細胞年齢尺度」は、血液細胞のエピジェネティックな経年変化を表す指標であり、個人の生物学的年齢を示すDNA領域を明らかにするものである。この「細胞年齢尺度」を（年齢）x（メチル化DNA情報）x（ゲノム情報）で捉えることが出来る新たな手法を開発し、より統合的で多角的なデータ解析の実現を目指す。さらに、健康調査アンケート、血液検査結果、生理機能検査結果との相関解析も同時に行う予定である。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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