2017 Fiscal Year Annual Research Report
既成概念を打破する血清網羅的糖ペプチド解析による卵巣癌早期診断・予後診断法の開発
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17H04340
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| Research Institution | Tokai University |
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Principal Investigator |
三上 幹男 東海大学, 医学部, 教授 (30190606)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
信田 政子 東海大学, 医学部, 講師 (10338717)
池田 仁惠 東海大学, 医学部, 講師 (20365993)
平澤 猛 東海大学, 医学部, 講師 (70307289)
柴田 健雄 東海大学, 医学部, 講師 (30366033)
宮澤 昌樹 東海大学, 医学部, 特定研究員 (30624572)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 卵巣癌 / 血清バイオマーカー / 糖ペプチド / 質量分析 / 人工知能 / 深層学習 / リキッドバイオプシー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
卵巣癌例39例、婦人科良性疾患例45例の血清を用いて、網羅的血清糖ペプチドプロファイル解析にて糖ペプチドピークを得て、両群を分離する分析をOPLS-DA (Orthogonal partial least squares Discriminant Analysis )法及びDeep learning（Mathworks 社MATLAB）にて行った。
OPLS-DA法及びDeep learningにて両群を判別することは可能であった。つまり血清のみを用いて婦人科良性疾患患者と初期卵巣癌患者を分けることが可能であった。これは採血による卵巣癌検診の可能性を示している。しかし問題点として、統計手法による過学習（Over fitting）の可能性があることが指摘された。この問題点を解決するのは多数の血清サンプルを必要とするために症例の集積を行うと同時に、現在手元にある卵巣癌例300例と健常人＋婦人科良性疾患群300例をtest set200＋200例 とvalidation set100＋100例に分けて、網羅的血清糖ペプチド解析を行い糖ペプチドのピークデータを収集している。 網羅的糖ペプチドプロファイル解析による新たな疾患特異的な糖ペプチドマーカーの探索については、マーカー候補となる糖タンパク分子が同定されており、構造解析を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
卵巣癌例39例、婦人科良性疾患例45例の血清を用いて、網羅的血清糖ペプチドプロファイル解析にて糖ペプチドピークを得て、両群を分離する分析をOPLS-DA (Orthogonal partial least squares Discriminant Analysis )法及びDeep learning（Mathworks 社MATLAB）にて行った。
OPLS-DA法及びDeep learningにて両群を判別することは可能であったが、過学習（Over fitting）の可能性があることが指摘された。そこで現在卵巣癌例300例と健常人＋婦人科良性疾患群300例をtest set200＋200例 とvalidation set100＋100例に分けて、網羅的血清糖ペプチド解析を行い糖ペプチドのピークデータを収集している。網羅的糖ペプチドプロファイル解析による新たな疾患特異的な糖ペプチドマーカーの探索については、マーカー候補となる糖タンパク分子が同定されており、構造解析を行っている。すでに4つの糖ペプチドについて構造解析を終了しており、糖たんぱく質を同定した。そのたんぱくの持つ糖鎖構造によって癌マーカーとしてのAUC（良性疾患と癌との判別能力）に違いがあることが判明した。
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| Strategy for Future Research Activity |
さらなる卵巣癌、婦人科疾患、健常人の血液を収集するために、全国11施設の協力を得るべく、日本産科婦人科学会学術講演会（仙台）おいてmeetingを開催する予定である。また申請者は教育講演の機会を与えられ今回の成果を多くの産婦人科医に知ってもらい協力を要請する。
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Research Products
(21 results)
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[Journal Article] Multicenter Clinicopathological Study of High-Grade Serous Carcinoma Presenting as Primary Peritoneal Carcinoma.2018
Author(s)
Komiyama S, Nishijima Y, Kondo H, Nomura H, Yamaguchi S, Futagami M, Arai H, Yokoyama Y, Suzuki N, Mikami M, Kubushiro K, Aoki D, Udagawa Y, Nishimura R.
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Journal Title
Int J Gynecol Cancer
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Significance of abnormal peritoneal cytology on survival of women with stage I-II endometrioid endometrial cancer.2018
Author(s)
Matsuo K, Yabuno A, Hom MS, Shida M, Kakuda M, Adachi S, Mandelbaum RS, Ueda Y, Hasegawa K, Enomoto T, Mikami M, Roman LD.
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Journal Title
Gynecol Oncol
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] Comprehensive serum glycopeptide spectra analysis might be a new tool for the Early detection of ovarian cancer2018
Author(s)
Mikio Mikami, Kazuhiro Tanabe, Koji Matsuo, Masae Ikeda, Masaki Miyazawa, Mariko Miyazawa, Masaru Hayashi, Hiroko Machida, Masako Shida, Lynda D.Roman,Takeshi Hirasawa
Organizer
SGO2017 Annual Meeting on Women's Cancer
Int'l Joint Research
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[Presentation] Significance of malignant and atypical cells in peritoneal cytology on survival of women with stage I-Ⅱ endometrioid endometrial cancer2018
Author(s)
Koji Mastuo, Marianne.S.Hom, Akira Yabuno, Masako Shida, Mamoru Kakuda, Sosuke Adachi, Yutaka Ueda, Kosei Hasegawa, Takayuki Enomoto, Mikio Mikami, Lynda D. Roman
Organizer
SGO2017 Annual Meeting on Women's Cancer
Int'l Joint Research
