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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of present status and comprehensive molecular epidemiology of emerging drug-resistant bacteria in developing regions of Asia and Caribbean province

Research Project

Project/Area Number 17H04664
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
アウン メイジソウ  札幌医科大学, 医学部, 助教 (10749584)
川口谷 充代  札幌医科大学, 医学部, 助教 (70733062)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (80396308)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords薬剤耐性菌 / 分子疫学 / 開発途上国 / メチシリン耐性黄色ブドウ球菌 / カルバペネム耐性腸内細菌
Outline of Annual Research Achievements

本研究は開発途上国のなかでも薬剤耐性菌に関する情報が特に少ないミャンマー、バングラデシュ、キューバ等のアジア・カリブ地域を対象とし、新興薬剤耐性菌の包括的な分子疫学的解析を行うことを目的とする。今年度は研究の最初の年度として、各国の共同研究者との打ち合わせを行い、研究計画の確認と対象細菌株の収集・保管、保存菌株の分子疫学的解析を行った。ミャンマーではすでに菌株の収集が進められていた大腸菌臨床分離株、健康成人由来の黄色ブドウ球菌について解析した。大腸菌は426株中ESBL産生株は37%であり、その多くがCTX-M-15であった。カルバペネム耐性は8.2%に見られ、その耐性酵素遺伝子としてNDM-1、NDM-4、NDM-5、NDM-7、OXA-181遺伝子が同定され、そのうちNDM-5が最も多く見つかった。健康成人(食品取扱者)の鼻腔、手指に由来する黄色ブドウ球菌にMRSAはなかったが、Panton Valentine leucocidin (PVL) 遺伝子が12%の菌株で陽性、TSST-1が5株で検出されたほか、すべての株がいずれか一つ以上のエンテロトキシン遺伝子を保有することが判明した。バングラデシュではマイメンシン医科大学附属病院で分離された大腸菌、肺炎桿菌、黄色ブドウ球菌の収集が順調に進み、解析が開始された。キューバでは大腸菌、アシネトバクターの収集と解析が進められている。またキューバで初めてVanA型バンコマイシン耐性腸球菌が検出された2011、2012年の菌株を再培養して解析したところ、それらが東ヨーロッパや南米の菌株に遺伝学的に近いことがわかり、外国からの伝播によりもたらされたことが示唆された。なお当初計画していたセントクリストファー・ネイビス、ラオスとの共同研究は、共同研究者側の都合で、今年度の開始は難しいことがわかり、今後あらためて検討することとした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

共同研究先のバングラデシュにおいては大腸菌、肺炎桿菌、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)の臨床分離株の収集保管が概ね終了し、分子疫学的解析が進められている。ミャンマーでは大腸菌の収集と解析が終了し論文投稿に至った。またMRSA臨床分離株の収集と解析が行われている。キューバではバンコマイシン耐性腸球菌に関する分子疫学的解析を行ったほか、大腸菌臨床分離株の収集が行われており、解析も一部終了済みである。

Strategy for Future Research Activity

バングラデシュでは大腸菌、肺炎桿菌、黄色ブドウ球菌に関する解析結果を論文としてまとめ、さらに腸球菌、アシネトバクターの収集を進める。ミャンマーでは、すでに収集を進めている黄色ブドウ球菌(MRSAを含む)のほか、コアグラーゼ陰性ブドウ球菌、アシネトバクターも研究対象として臨床分離株の保管を行い、一部については分子疫学的解析を開始する。キューバにおける大腸菌臨床分離株に関する解析を年度内に行い、論文作成を目標とする。以上に加え中国の武漢市CDCからも細菌の薬剤耐性に関する共同研究を行いたいとの申し入れがあったため、その実施について検討を行う。

  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Medicine (2), Yangon(Myanmar)

    • Country Name
      Myanmar
    • Counterpart Institution
      University of Medicine (2), Yangon
  • [Int'l Joint Research] Mymensingh Medical College(Bangladesh)

    • Country Name
      Bangladesh
    • Counterpart Institution
      Mymensingh Medical College
  • [Int'l Joint Research] IPK Tropical Medicine Institute(Cuba)

    • Country Name
      Cuba
    • Counterpart Institution
      IPK Tropical Medicine Institute
  • [Journal Article] Genetic characteristics of VanA-type vancomycin-resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium in Cuba.2018

    • Author(s)
      Quinones D, Aung MS, Sousa Martins JP, Urushibara N, Kobayashi N
    • Journal Title

      New Microbes New Infect

      Volume: 21 Pages: 125-127

    • DOI

      10.1016/j.nmni.2017.12.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prevalence of Extended-Spectrum Beta-Lactamase and Carbapenemase Genes in Clinical Isolates of Escherichia coli in Myanmar: Dominance of blaNDM-5 and Emergence of blaOXA-181.2018

    • Author(s)
      Aung MS, San N, Maw WW, San T, Urushibara N, Kawaguchiya M, Sumi A, Kobayashi N
    • Journal Title

      Microbial Drug Resistance

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1089/mdr.2017.0387

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prevalence and Genetic Characteristics of Staphylococcus aureus and Staphylococcus argenteus Isolates Harboring Panton-Valentine Leukocidin, Enterotoxins, and TSST-1 Genes from Food Handlers in Myanmar.2017

    • Author(s)
      Aung MS, San T, Aye MM, Mya S, Maw WW, Zan KN, Htut WHW, Kawaguchiya M, Urushibara N, Kobayashi N
    • Journal Title

      Toxins (Basel)

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.3390/toxins9080241

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ミャンマーの大腸菌臨床分離株におけるESBL・カルバペネマーゼ遺伝子の分布状況2018

    • Author(s)
      小林宣道、アウンメイジソウ、サン ニラ、モウ ウィンウィン、川口谷充代、漆原範子、鷲見紋子
    • Organizer
      第88回日本衛生学会総会
  • [Presentation] Escherichia coli O25b-ST131: a pandemic, multi-resistant, community-associated strain isolated from puerperal infections in Bangladesh.2017

    • Author(s)
      Ahmed S, Paul SK, Nasreen SA, Haque N, Kawaguchiya M, Urushibara N, Hossain MA, Kobayashi N
    • Organizer
      15th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology (IUMS, 2017)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular epidemiology, virulence and drug resistance profile of extended-spectrum β-lactamases- (ESBLs) producing extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) in Myanmar.2017

    • Author(s)
      Aung MS, San N, Kawaguchiya M, Urushibara N, Kobayashi N
    • Organizer
      30th International Congress of Chemotherapy and Infection 2017 (ICC, 2017)
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 札幌医科大学医学部衛生学講座ホームページ

    • URL

      http://web.sapmed.ac.jp/hygiene/index.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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